Identification of sugar apple cultivars Nua and Nang using AFLP and SCAR markers
DOI:
https://doi.org/10.14456/tjg.2008.18Keywords:
Sugar apple, Annona squamosa L., AFLP, SCARAbstract
Amplified fragment length polymorphism (AFLP) technique was used to identify sugar apple (Annona squamosa L.) cultivars Nua and Nang. The total of 64 EcoRI-MseI primer-pair combinations were screened and all of them could produce DNA fingerprinting. Eight AFLP markers were clearly polymorphic among the 2 cultivars which were capable to distinguish the sugar apple varieties between Nua and Nang. Four polymorphic AFLP fragments were subsequently cloned and sequenced for sequence characterized amplified region (SCAR) primer design. The primers were tested with individual DNA samples and the result showed the polymorphisms that were identified from the SCAR markers with specific to only sugar apple variety Nua.
References
เกศิณี ระมิงค์วงศ์. 2530. ไม้ผลเมืองร้อน. ภาควิชาพืชสวน คณะเกษตรศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่, เชียงใหม่.
ธีระชัย ธนานันต์. 2550. การจำแนกน้อยหน่าพันธุ์เนื้อและพันธุ์หนังด้วยเครื่องหมายอาร์เอพีดี. ว.วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 15: 9-15.
นฤมล ธนานันต์ และ ธีระชัย ธนานันต์. 2550. การจำแนกพันธุ์บัวหลวงด้วยเครื่องหมายเอเอฟแอลพี. ว.วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 15: 66-72.
พันธิตร์ มะลิสุวรรณ. 2548. คู่มือการเพิ่มผลผลิต: การปลูกน้อยหน่าปลอดสารพิษและวิธีเพิ่มผลผลิตอีกเท่าตัว. บริษัท สำนักพิมพ์ยูทิไลซ์ จำกัด, กรุงเทพฯ.
Agrawal, G.K., Pandey, R.N. and Agrawal, V.P. 1992. Isolation of DNA from Choerospondias asillaris leaves. Biotech Biodiv Lett 2: 19-24.
Escribano, P., Viruel, M.A. and Hormaza, J.I. 2004. Characterization and cross-species amplification of microsatellite markers in cherimoya (Annona cherimola Mill. Annonaceae). Mol Ecol Notes 4: 746-748.
Kashkush, K., Jinggui, F., Tomer, E., Hillel, J. and Lavi, U. 2001. Culture identification and genetic map of mango (Mangifera indica). Euphytica 122: 129-136.
Kwapata, K., Mwase, W.F., Bokosi, J.M., Kwapata, M.B. and Munyenyembe, P. 2007. Genetic diversity of Annona senegalensis Pers. populations as revealed by simple sequence repeats (SSRs). Afr J Biotechnol 6: 1239-1247.
Loh, J.P., Kiew, R., Set, O., Gan, L.H. and Gan, Y.Y. 2000. A study of genetic variation and relationships within the bamboo subtribe Bambusinae using amplified fragment length polymorphism. Ann Bot 85: 607-612.
Morton, J.F. 1987. Sugar apple: Annona squamosa. In: J.F. Morton (ed.) Fruits of Warm Climates. Creative Resource Systems, Inc., Winterville, NC. p. 505.
Phillip, R.L. and Campbell, C.W. 1994. Fact Sheet HS-38: The Sugar Apple. University of Florida, Florida.
Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingey, S. and Rafalski, A. 1996. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSRs markers for germplasm analysis. Mol Breed 2: 225-238.
Sambrook, J., Fritsch, E.F. and Maniatis, T. 1989. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed. Cold Spring Harbor Laboratory, New York.
Wong, C., Kiew, R., Loh, J.P., Gan, L.H., Set, O., Lee, S.K., Lum, S. and Gan, Y.Y. 2001. Genetic diversity of the wild banana Musa acuminata colla in Malaysia as evidenced by AFLP. Ann Bot 88: 1017-1025.
