Genetic diversity in the blue swimming crab (Portunus pelagicus) and mud crab (Scylla spp.) populations of Thailand: conclusion of the study results, benefits and utilizations
DOI:
https://doi.org/10.14456/tjg.2009.13Keywords:
Portunus pelagicus, Scylla spp., genetic diversity, microsatellite, allozymeAbstract
Genetic diversity in blue swimming crab and mud crab populations of Thailand was studied based on the molecular genetic marker techniques, microsatellite and allozyme. Results of the study are as follows: (1) eleven pairs of microsatellite primers were developed and/or tested in the blue swimming crab, and nine pairs in the mud crabs; (2) interspecifically and allozymically, the mud crabs (Scylla spp.) were classified into four species (the “black”, S. olivacea; “white”, S. paramamosain; “green”, S. serrata; and “purple”, S. tranquebarica); (3) with the allozyme-based analysis, the interspecific genetic structure and relationships of all the blue swimming and mud crabs species were clearly shown; (4) with the microsatellite-based analysis, informative knowledge of the genetic variability and variation in the blue swimming and mud crab populations of Thailand, and the interpopulation differentiation and structure within the crab species were attained.
References
กาญจนา จิรพันธ์พิพัฒน์ และ ณฐกร ประดิษฐ์สรรพ์. 2548. รายงานวิจัยฉบับสมบูรณ์ โครงการ ”การจำแนกชนิดและการประเมินสภาวะทรัพยากรปูทะเลในบริเวณคลองหงาว จังหวัดระนอง”. ชุดโครงการ “ปู” สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย (สกว.).
จรัลธาดา กรรณสูต และ พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข. 2542. ลักษณะและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของปลาในวงศ์ปลาสลาดที่พบในประเทศไทย. วารสารการประมง 52: 565-578.
พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข และ ศรีรัตน์ สอดศุข. 2550. รายงานวิจัยฉบับสมบูรณ์ โครงการ “การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากรปูม้าและปูทะเลของไทย”. ชุดโครงการ “พันธุศาสตร์พืชและสัตว์น้ำ” สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย (สกว.).
พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข ศรีรัตน์ สอดศุข และ พลชาติ ผิวเณร. 2550. ลักษณะความแตกต่างและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างชนิด โดยเครื่องหมายพันธุกรรมอัลโลไซม์ในปูทะเลและปูม้าของไทย. เอกสารวิชาการฉบับที่ 10/2550 สถาบันวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ กรมประมง.
พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข สุภัทรา อุไรวรรณ์ และ ศรีรัตน์ สอดศุข. 2548. วิเคราะห์ความแปรปรวนทางพันธุกรรมโดยใช้โมเลกุลเครื่องหมาย ในกระบวนการคัดเลือกปรับปรุงพันธุ์กุ้งกุลาดำ. เอกสารวิชาการฉบับที่ 5/2548 สถาบันวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ กรมประมง.
ศรีรัตน์ สอดศุข. 2539. ความแตกต่างและโครงสร้างทางพันธุกรรมของกุ้งกุลาดำในประเทศไทย. เอกสารวิชาการฉบับที่ 12 สถาบันวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ กรมประมง.
ศรีรัตน์ สอดศุข และ พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข. 2541. ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรกุ้งแชบ๊วยจาก 3 แหล่งในประเทศไทย. เอกสารวิชาการฉบับที่ 17/2541 สถาบันวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ กรมประมง.
ศรีรัตน์ สอดศุข และ พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข. 2548. การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซททัลไลท์ในปูทะเล. เอกสารวิชาการฉบับที่ 1/2548. สถาบันวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ. กรมประมง
สุเมธ ตันติกุล. 2527. ชีววิทยาการประมงของปูม้าในอ่าวไทย. เอกสารเผยแพร่วิชาการฉบับที่ 1/2527 ฝ่ายสัตว์น้ำอื่นๆ กองประมงทะเล กรมประมง.
Allendorf, F.W. and Ryman, N. 1987. Genetic management of hatchery stocks. In: N. Ryman and F. Utter (eds.) Population Genetics and Fisheries Management. University of Washington Press. Seattle. pp. 141-159.
Excoffier, L., Laval, G. and Schneider, S. 2006. Arlequin ver 3.1. An Integrated Software Package for Population Genetics Data Analysis. Institute of Zoology, Univ. of Berne, Bern, Switzerland.
Farris, J.S. 1970. Methods for computing Wagner trees. Syst. Zool. 34: 21-33.
Felsenstein, J. 1985. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution 39: 783-791.
Felsenstein, J. 1990. PHYLIP (Phylogeny Inference Package) Version 3.3. University of Washington, Seattle.
Fu, Y.X. 1997. New statistical test of neutrality for DNA samples from a population. Genetics 43: 550-557.
Goudet, J. 1995. Fstat version 1.2: a computer program to calculate Fstatistics. J. Heredity. 86: 485-486.
Keenan, C.P., Davie, P.J.F. and Mann, D.L. 1998. A revision of the genus Scylla De Haan, 1833 (Crustacea: Decapoda: Brachyura: Portunudae). The Raffles Bulletin of Zoology 46: 217-245.
Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics 89: 583-590.
Ng, P.K.L. 1998. Crabs (Portunidae). In: K.E. Carpenter and V.H. Niem (eds.) FAO Species Identification Guide for Fisheries Purposes. The Living Marine Resources of the Western Central Pacific. Vol. 2. Cephalopods, Crustaceans, Holothurians and Sharks. pp. 1115-1131.
Ng, P.K.L., Guinot, D. and Davie, P.J.F. 2008. Systema Brachyurorum: Part I. An annotated checklist of extant brachyuran crabs of the world. The Raffles Bulletin of Zoology 17: 1-286.
Shaklee, J.B., Allendorf, F.W., Morizot, D.C. and Whitt, G.S. 1990. Gene nomenclature of protein coding loci in fish. Trans. Am. Fish. Soc. 119: 2-15.
Siegel, S. 1956. Nonparametric Statistics for the Behavioural Sciences. McGraw-Hill Kogakusha, Tokyo.
Sneath, P.H.A. and Sokal, R.R.. 1973. Numerical Taxonomy. W.H.Freeman, San Francisco.
Sodsuk, P. and B.J. McAndrew. 1991. Molecular systematics of three tilapiine genera Tilapia, Sarotherodon and Oreochromis using allozyme data. J. Fish Biol. 39 (Suppl A): 301-308.
Sodsuk, P.K. 1993. Molecular genetics and systematics of tilapiine cichlids using allozymes and morphological characters. PhD thesis, Univ. of Stirling, Scotland, UK.
Suvatti, C. 1950. Fauna of Thailand. Department of Fisheries. The Tieng Saeng Press, Bangkok, Thailand.
Swofford, D.L. and Olsen, G.J. 1990. Phylogeny reconstruction. In: D.M. Hillis and C. Moritz (eds.). Molecular Systematics. Sinauer Associates, Massachusetts. pp. 411-501.
Swofford, D.L. and Selander, R.B. 1989. BIOSYS-1: A Computer Program for the Analysis of Allelic Variation in Population Genetics and Biochemical Systematics. D.L. Swofford, Illinois Natural History Survey.
Workman, P.L. and Niswander, J.D. 1970. Population studies on Southwestern Indian tribes. II. Local genetic differentiation in the Papago. Am. J. Hum. Gen. 22: 24-49.
Yeh, F.C., R. Yang and T. Boyle. 1999. POPGENE Version 1.31. Microsoft Window-based Freeware for Population Genetic Analysis. (Website: http://www.ualberta.ca/~fyeh/)
