การตรวจสอบความถูกต้องของการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอชุดซ้ำของเครื่องหมายดีเอ็นเอจำนวน 16 และ 22 ตำแหน่ง ในการพิสูจน์เอกลักษณ์บุคคล (Validation study of DNA amplification in 16 and 22 STR markers for human identification)
Keywords:
ดีเอ็นเอ (DNA), เครื่องหมายพันธุกรรมลำดับซ้ำ (STR marker), พิสูจน์เอกลักษณ์บุคคล (personal identification), ดีเอ็นเอโปรไฟล์ (DNA profile)Abstract
Recently the knowledge and skill of forensic genetics were applied to justice system, personal identification and paternity test. Therefore, forensic scientists in service laboratories try to develop laboratory process to increase the sensitivity and accuracy, to generate reliable results and to reduce cost. The purpose of this work is to study the quality of DNA profiles using reduced volume of commercial kits in 16 and 22 autosomal short tandem repeat (STR) markers from buccal cells using Investigator IDplex GO and Investigator 24plex QS kits, respectively. The results showed that complete DNA profiles of 16 and 22 STR markers can be obtained by reducing the kits to 50 and 25 %, respectively. The amplification volume reduction can be used to investigate DNA profiles in personal identification and can save the cost in the routine service laboratory.
บทคัดย่อ
ปัจจุบันงานด้านนิติพันธุศาสตร์มีการประยุกต์ใช้ในกระบวนการยุติธรรม การพิสูจน์เอกลักษณ์บุคคล ตลอดจนการพิสูจน์ความสัมพันธ์บิดา-มารดา-บุตร ดังนั้นนักนิติพันธุศาสตร์ในห้องปฏิบัติการบริการ จึงมีความพยายามที่จะปรับปรุงกระบวนการบริการด้านการตรวจวิเคราะห์ดีเอ็นเอ ให้มีความไว ความถูกต้อง ให้รายงานผลการตรวจวิเคราะห์ที่น่าเชื่อถือ และประหยัดค่าใช้จ่าย งานวิจัยนี้ มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาคุณภาพของ DNA profile ที่ได้จากการลดปริมาตรน้ำยาสำเร็จรูป ในการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอในหลอดทดลอง โดยใช้เครื่องหมายพันธุกรรมบนออโทโซมจำนวน 16 และ 22 ตำแหน่ง จากเซลล์เยื่อบุกระพุ้งแก้ม ด้วยชุดน้ำยาสำเร็จรูป Investigator IDplex GO และ น้ำยา Investigator 24plex QS พบว่า สามารถลดปริมาณน้ำยาสำเร็จรูปเหลือร้อยละ 50 และ 25 ตามลำดับ โดยที่ให้ผล DNA profile ที่สมบูรณ์และสามารถนำมาใช้ในการตรวจพิสูจน์เอกลักษณ์บุคคลในทางนิติวิทยาศาสตร์ได้ และยังสามารถช่วยลดเวลาและต้นทุนค่าใช้จ่ายของห้องปฏิบัติการ
References
Butler JM (2005) Forensic DNA typing.2nd ed. Elsevier, USA.
Brito P, Lopes V, Bogas V, Balsa F, Andrade L, Serra A, et al. (2011) Amplification of non-FTA samples with AmpFISTR®Identifiler® Direct PCR Amplification Kit. Forensic SciInt Genet Supplement Ser 3: 371-372.
Chakraborty R, Stivers DN, Su B, Zhong Y, Budowle B (1999) The utility of short tandem repeat loci beyond human identification: implications for development of new DNA typing systems. Electrophoresis 20: 1682-1696.
Collins PJ, Hennessy LK, Leibelt CS, Roby PK, Reeder DJ, Foxall PA (2004) Developmental validation of a single-tube amplification of the 13 CODIS STR loci, D2S1338, D19S433 and Amelogenin: the AmpFISTR®Identifiler® PCR amplification kit. J Forensic Sci 49: 1-13.
Fujii K, Iwashima Y, Kitayama T (2014) Allele frequencies for 22 autosomal short tandem repeat loci obtained by PowerPlex Fusion in a sample of 1501 individuals from the Japanese population. Int J Legal Med 16: 243-237.
Opel KL, Chung DT, Drabek J, Butler JM, McCord BR (2007) Developmental validation of reduced-size STR Miniplex primer sets. J Forensic Sci 52: 1263-1271.
Shotivaranon J, Chirachariyavej T, LeetrakoolN, Rerkamnuaychoke B (2009) DNA database of populations from different parts in the Kingdom of Thailand. Forensic Sci Int Genet 4: 37-38.
Smith LM, Burgoyne LA (2004) Collecting, archiving and processing DNA from wildlife samples using FTA databasing paper. BMC Ecol 4.
Scherer M, Alsdorf B, Bochmann L, Prochnow A, Engel H (2013) Development of the Investigator STR GO! Kits for the direct amplification of reference samples. Forensic Sci Int Genet Supplement Ser 4: 15-16.
Wang DY, Chang CW, Oldroyd NJ, Hennessy LK (2009) Direct amplification of STRs from blood or buccal cell samples. Forensic Sci Int Genet
Supplement Ser 2: 113-114.
Wong HY, Lim ESS (2012) Amplification volume reduction on DNA database samples using FTA TM Classic Cards. Forensic Sci Int Genet 6: 176-179.
Yuan G, Shen C, Wang H, Liu W (2012) Genetic data provided by 21 autosomal STR loci from Chinese Tujia ethnic group. Mol Biol Rep 39: 10265-10271.
