การจัดจำแนกชนิดเชื้อซานโทโมนาสสาเหตุโรคใบจุดมะเขือเทศและพริกในประเทศไทย
DOI:
https://doi.org/10.14456/thaidoa-agres.2020.7คำสำคัญ:
เชื้อซานโทโมนาส, โรคใบจุด, มะเขือเทศ, พริก, ลำดับนิวคลีโอไทด์หลายตำแหน่ง, ยีนพื้นฐานบทคัดย่อ
โรคใบจุดมะเขือเทศและพริกที่เกิดจากเชื้อแบคทีเรียโรค จัดเป็นโรคที่สำคัญโดยเฉพาะกับอุตสาหกรรมเมล็ดพันธุ์มะเขือเทศและพริก จากการศึกษาของ Jones et al., (2004) จำแนกเชื้อ Xanthomonas spp.สาเหตุโรคใบจุดมะเขือเทศและพริกออกเป็น 4 ชนิด (species) คือ X. euvesicatoria, X. gardneri, X. perforans, และ X. vesicatoria นำเชื้อแบคทีเรีย Xanthomonas spp. สาเหตุโรคใบจุดที่แยกเชื้อจากมะเขือเทศและพริก ที่สำรวจเก็บตัวอย่างจากพื้นที่ภาคเหนือ ภาคตะวันออกเฉียงเหนือและภาคกลาง จำนวน 38 ไอโซเลท (Isolate) ที่ผ่านการศึกษาจำแนกด้วยลักษณะทางสัญฐานวิทยา สรีรวิทยาและชีวเคมีเบื้องต้นแล้ว คัดเลือกเชื้อจำนวน 18 ไอโซเลทมาวิเคราะห์จัดจำแนกด้วยเทคนิค Multilocus sequence analysis (MLSA) ของยีน gyrB, efp, dnaK และ atpD มาต่อกัน และการตรวจสอบด้วยเทคนิค PCR ด้วยไพรเมอร์ที่จำเพาะต่อเชื้อสาเหตุโรคทั้ง 4 ชนิด จากการศึกษาพบว่าเชื้อแบคทีเรียสาเหตุโรคใบจุดของมะเขือเทศที่พบในประเทศไทยมี 2 ชนิด ได้แก่เชื้อ X. perforans ที่ส่วนใหญ่พบจากมะเขือเทศ และเชื้อ X. euvesicatoria จำนวน10 ไอโซเลท ที่แยกมาจากพริก จากการศึกษานี้ตรวจไม่พบว่ามีเชื้อ X. gardneri และ X. vesicatoria อย่างไรก็ตามพบว่าเชื้อที่ศึกษาจำแนกเป็น X. perforans โดยวิธีข้างต้นทุกไอโซเลท ไม่มีการสังเคราะห์ดีเอ็นเอเป้าหมายจากปฏิกิริยา PCR ที่ใช้คู่ไพรเมอร์ Bs-XpF/ Bs-XpR ที่จำเพาะต่อเชื้อ X. perforans
เอกสารอ้างอิง
บงกชไพร ศรีวิไล. 2537. การจำแนกและตรวจสอบเชื้อแบคทีเรีย Xanthomonas campestris pv. vesicatoria (Doidge) Dye ที่เป็นสาเหตุโรคใบจุดของมะเขือเทศ (รายงานผลงานวิจัย). มหาวิทยาลัยขอนแก่น, ขอนแก่น.
วัลลา ดิฐพงษ์พิชญ์. 2539. การวิเคราะห์ plamid และการจำแนก races ของ Xanthomonas campestris pv. vesicatoria. คณะเกษตรศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น.
วิชัย โฆสิตรัตน. 2549. โรคพืชที่เกิดจากแบคทีเรีย: บทปฏิบัติการ. พิมพ์ครั้งที่ 2. ภาควิชาโรคพืช คณะเกษตร กำแพงแสน มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตกำแพงแสน, นครปฐม.
Araújo, E. R., J.R. Costa, M. A. S.V. Ferreira and A. M. Quezado-Duval. 2017. Widespread distribution of Xanthomonas perforans and limited presence of X. gardneri in Brazil. Plant Pathology 66: 139-168.
Burlakoti, R. R., C. F. Hsu, J.R. Chen and J. F. Wang. 2018. Population dynamics of xanthomonads associated with bacterial spot of tomato and pepper during 27 years across Taiwan. Plant Disease 102: 1348-1356.
Doidge, E. M. 1921. A tomato canker. Annals of Applied Biology 7(4): 407-430.
Dye D. 1966. Cultural and biochemical reaction of additional Xanthomonas species. New Zealand Journal of Forestry Science 9: 913–919.
EPPO. 2013. PM 7/110 (1) Xanthomonas spp. (Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas vesicatoria) causing bacterial spot of tomato and sweet pepper. EPPO Bulletin 43: 7-20.
Hamza, A. A., I. Robène-Soustrade, E. Jouen, L.Gagnevin, P. Lefeuvre, F. Chiroleu and O. Pruvost. 2010. Genetic and pathological diversity among Xanthomonas strains responsible for bacterial spot on tomato and pepper in the southwest Indian Ocean region. Plant Disease 94: 993-999.
Huelsenbeck, J. P. and F. Ronquist. 2001. MRBAYES: Bayesian inference of phylogeny. Bioinformatics 17:754-755.
Jones, J. B., G. H. Lacy, H. Bouzar, R. E. Stall and N. W. Schaad. 2004. Reclassification of the xanthomonads associated with bacterial spot disease of tomato and pepper. Systematic and Applied Microbiology 27(6): 755-762.
Koenraadt, H., B. Van Betteray, R. Germain, G. Hiddink, J. B. Jones, J. Oosterhof, A. Rijlaarsdam, P. Roorda and B. Woudt. 2009. Development of specific primers for the molecular detection of bacterial spot of pepper and tomato. Acta Horticulturae 808: 99-102.
Rambaut, A. 2018. FigTree v1.4.4. http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree.
Roach, R., R. Mann, C. G. Gambley, R. G. Shivas, and B. Rodoni. 2018. Identification of Xanthomonas species associated with bacterial leaf spot of tomato, capsicum and chilli crops in eastern Australia. European Journal of Plant Pathology 150(3): 595-608.
Schaad, N. W., J. B. Jones and W. Chun. 2001. Laboratory Guide for Identification of Plant Pathogenic Bacteria (3rd Ed.). APS Press, Minnesota. 398p.
Stall, R. E., C. Beaulieu, D. Egel, N. C. Hodge, R. P. Leite, G. V. Minsavage, H. Bouzar, J. B. Jones and A. A. Benedict. 1994. Two genetically diverse groups of strains are included in Xanthomonas campestris pv. vesicatoria. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 44(1): 47-53
Sutic, D. 1957. Bakterioze crvenog patlidzana (Tomato Bacteriosis). Posebna Izdanja Institut za zastitu bilja Beograd (Special Edition Institute for Plant Protection Belgrade), 66p.
Vauterin, L., B. Hoste, K. Kersters and J. Swings. 1995. Reclassification of Xanthomonas. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 45(3): 472-489.
ดาวน์โหลด
เผยแพร่แล้ว
รูปแบบการอ้างอิง
ฉบับ
ประเภทบทความ
สัญญาอนุญาต
วารสารวิชาการเกษตร
