การตรวจพบเชื้อไวรอยด์โรคเตี้ยแคระเบญจมาศจากต้นเบญจมาศในแปลงปลูก
DOI:
https://doi.org/10.14456/thaidoa-agres.2020.2คำสำคัญ:
ไวรอยด์, เบญจมาศ, อาร์ที-พีซีอาร์, ลำดับเบสบทคัดย่อ
สุ่มเก็บตัวอย่างเบญจมาศที่แสดงอาการเตี้ยแคระ ใบซีดเหลือง ดอกมีขนาดเล็กและมีลักษณะผิดปกติจากอำเภอวังน้ำเขียว จังหวัดนครราชสีมา จำนวน 23 ตัวอย่าง นำมาตรวจหาเชื้อ Chrysanthemum stunt virus (CSVd) ด้วยเทคนิค reverse transcription – polymerase chain reaction (RT-PCR) พบตัวอย่างที่มีแถบดีเอ็นเอขนาดประมาณ 360 นิวคลีโอไทด์ จำนวน 8 ตัวอย่าง นำตัวอย่างดังกล่าวมาทำการโคลนยีน และวิเคราะห์หาลำดับเบส พบว่า 8 ตัวอย่างมีลำดับเบสยาว 354 นิวคลีโอไทด์ ซึ่งเหมือนกับเชื้อ CSVd Accession Nos. AF394452, JQ685739, HQ891018, JX909290, JF414238, JF398538, Z68210, DQ094298, FN646407 และ U82445 ในฐานข้อมูลของ GenBank ที่ 98 – 100% และเมื่อนำทั้ง 8 โคลนเปรียบเทียบและวิเคราะห์ Phylogenetic Tree ทำให้สรุปได้ว่าเชื้อไวรอยด์ทั้ง 8 โคลนคือเชื้อ Chrysanthemum stunt viroid จากการปลูกเชื้อ CSVd ลงบนพืชทดสอบมะเขือเทศพันธุ์ Rutgers และเบญจมาศ พบว่า มะเขือเทศพันธุ์ Rutgers ไม่แสดงลักษณะอาการ ในขณะที่เบญจมาศแสดงอาการ ใบมีขนาดเล็กลงและซีดเหลือง โดยยืนยันการติดเชื้อ CSVd ด้วยเทคนิค RT-PCR งานวิจัยนี้นับเป็นการตรวจพบเชื้อ Chrysanthemum stunt viroid ในสภาพแปลงปลูกเบญจมาศเป็นครั้งแรกของประเทศไทย
เอกสารอ้างอิง
คนึงนิตย์ เหรียญวรากร. 2556. โรคพืชที่เกิดจากเชื้อไวรอยด์. พิมพ์ครั้งที่ 2. บริษัท ศูนย์การพิมพ์ เพชรรุ่ง จำกัด, นนทบรี. ดวงกมลวรรณ กบกันทา. 2561. เบญจมาศตัดดอก. แหล่งที่มา: http://www.agriman.doae.go.th/home/news/2562/75-76.pdf (สืบค้น: 16 ธันวาคม 2562)
ปริเชษฐ์ ตั้งกาญจนภาสน์. 2548. การตรวจสอบเชื้อไวรอยด์ในแปลงผลิตเมล็ดพันธุ์มะเขือเทศในเขตภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศไทย. วิทยานิพนธ์ปริญญาโท. มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. 85 หน้า
สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งประเทศไทย. 2561. วว. เปิดตัวเบญจมาศสายพันธุ์ใหม่ที่มีศักยภาพต้านทานโรคแห่งแรกของไทย. แหล่งที่: https://klc.tistr.or.th/tistr/newsboard/shownews.php?Category=newsboard&No=1091 (สืบค้น: 17 ธันวาคม 2562).
Bachelier, J.C., M. Monsion and J. Dunez. 1976. Possibilities of improving detection of chrysanthemum stunt and obtention of viroid-free plants by meristem tip culture. Acta Horticulturae. 59: 63-69.
Bouwen, I. and A. Van Zaayen. 2003. Chrysanthemum stunt viroid. In: Hadidi, A., Flores,
R., Randles, J.W., Semancik, J.S. (Eds.), Viroids. CSIRO Publishing, Collingwood, Australia. 218-223.
Chung, B.N., G.S. Choi, H.R. Kim and J.S Kim. 2001. Chrysanthemum Stunt Viroid in Dendranthema grandiflorum, The Plant Pathology Journal. 17: 194–200.
Cho, W.K., Y Jo , K-M. Jo and K-H. Kim. 2013. A current overview of two viroids that infect chrysanthemums: chrysanthemum stunt viroid and Chrysanthemum chlorotic mottle viroid. Viruses. 5: 1099-1113.
Gobatto, D., A.L.R. Chaves, R. Harakava, J.M. Marque, J.A. Daro` s and M. Eiras. 2014. Chrysanthemum stunt viroid in Brazil: survey, identification, biological and molecular characterization and detection methods. Journal of Plant Pathology. 96: 111-119.
Grausgruber-Groeger, S. and R.A. Gottsberger. 2012. First report of Tomato apical stunt viroid and Chrysanthemum stunt viroid in Solanum jasminoides in Austria. New Disease Report. 24: 4.
Henkel, J. and H. Saenger. 1995. Chrysanthemum stunt viroid DNA (isolate CSVd-Ageratum).
Journal Unpublished. (Accession No. Z68201)
Hollings, M. and O.M. Stone. 1970. Attempts to eliminate chrysanthemum stunt from chrysanthemum by meristem-tip culture after heat treatment. Annals of Applied Biology. 65: 311-315.
Horst, R.K. and P.E. Nelson. 1997. Compendium of Chrysanthemum Diseases. USA. The American Phytopathological Society.
Kumar S., G. Li M. Stecher, C. Knyaz and K. Tamura. 2018. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molecular Biology Evolution. 35: 1547-1549.
Legrand, P. 2015. Biological assays for plant viruses and other graft-transmissible pathogens diagnoses: a review. EPPO Bulletin. 45: 240-251.
Marais, A., C. Faure, J-M. Deogratias and T. Candresse. 2011. First report of Chrysanthemum stunt viroid in various cultivars of Argyranthemum frutescens in France. Plant Disease. 95: 9: 1196.
Marat, S., K. Reanwarakorn and P. Tangkanchanapas. 2007. Columnea latent viroid, isolate NC17, complete genome. Accession No.AM698094. แหล่งที่มา: http://www.dpvweb.net/dpv/showseq.php?seq=am698094 (13 กรกฏาคม 2562 )
Matsushita, Y. 2013. Chrysanthemum stunt viroid. Japan Agricultural Research Quarterly.
(3): 237-242.
Monger, W., J. Tomlinson, N. Booonham, M.V. Marn, I.M. Plesko, V. Molinero-Demilly, X. Tassus, E. Meekes, M. Toonen and L. Papayiannis. 2010. Development and inter-laboratory evaluation of real-time PCR assays for the detection of pospiviroids. Journal of Virological Methods. 169: 207–210.
Nabeshima, T., M. Hosokawa, S. Yano, K. Ohishi and M. Doi. 2012. Screening of chrysanthemum cultivars resistant to Chrysanthemum stunt viroid. Journal of the Japanese Society for Horticultural Science. 81(3): 285–294.
Navarro B. and R. Flores. 1997. Chrysanthemum chlorotic mottle viroid: unusual structural properties of a subgroup of viroids with hammerhead ribozymes. Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 94: 11262-11267.
Niblett, C. L., E. Dickson, K.H. Horst and C.P. Romaine. 1980. Additional hosts and efficient purification procedure for four viroids. Phytopathology. 70: 610-615.
Nie, X., R.P. Singh and H. Bostan. 2005. Molecular cloning secondary structure and phylogeny of three pospiviroids from ornamental plant. Journal of PIant Pathology. 27: 592-206.
Sanger, F. and A.R. Coulson. 1975. A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase. Journal of Molecular Biology. 94(3): 441-448.
Thompson, J.R., S. Wetzel, M.M. Klerks, D. Vaskova, C.D. Schoen, J. Spak and W. Jelkmann. 2003. Multiplex RT-PCR detection of four aphid-borne strawberry viruses in Fragaria spp. in combination with a plant mRNA specific internal control. Journal of Virological Methods. 111: 85–93.
Torchetti, E.M., B. Navarro, V.N. Trisciuzzi, L. Nuccitelli, M.R. Silletti and F.D. Serio. 2012. First report of Chrysanthemum stunt viroid in Argyranthemum frutescens in Italy. Journal of PIant Pathology. 94: 2.
Verhoeven, J.Th.J., M.S.J. Arts, R.A. Owens and J.W. Roenhurst. 1998. Natural infection of
petunia by Chrysanthemum stunt viroid. European Journal of Plant Pathology. 104: 383-386.
Walia, Y., S. Dhir, R. Ram, A.A. Zaidi and V. Hallan. 2014. Identification of the herbaceous host range of Apple scar skin viroid and analysis of its progeny variants. Journal of Plant Pathology. 63: 684–690.
Xu, W., F. Bolduc, N. Hong and J-P. Perreault. 2012. The use of a combination of computer-assisted structure prediction and SHAPE probing to elucidate the secondary structures of five viroids. Molecular Plant Pathology. 13(7): 666–676
Yoon, J., E. Baek and P. Palukaitis. 2012. Are there strains of Chrysanthemum stunt viroid ?. Journal of Plant Pathology. 94(3): 697–701.
Yoon J-Y, I-S. Cho, G-S. Choi and S-K. Choi. 2014. Construction of infectious cDNA clone of a chrysanthemum stunt viroid Korean isolate. The Plant Pathology Journal. 30(1): 68-74.
Zhang, Z.Z., S. Pan and S.F. Li. 2011. First Report of Chrysanthemum chlorotic mottle viroid in Chrysanthemum in China. Plant Disease. 95(10): 1320
ดาวน์โหลด
เผยแพร่แล้ว
รูปแบบการอ้างอิง
ฉบับ
ประเภทบทความ
สัญญาอนุญาต
วารสารวิชาการเกษตร
