การแสดงออกของยีนที่แตกต่างกันของกุ้งขาวแวนนาไมที่ติดเชื้อไวรัสตัวแดงดวงขาวด้วยวิธี differential displayed RT-PCR
คำสำคัญ:
กุ้งขาวแวนนาไม, ไวรัสตัวแดงดวงขาว, ปฏิกิริยาพอลีเมอเรสของการแสดงออกต่างกันบทคัดย่อ
กุ้งขาวแวนนาไมเป็นสัตว์เศรษฐกิจแต่ในปัจจุบันประสบปัญหาโรคไวรัสตัวแดงดวงขาว ทำให้ผลผลิตกุ้งมีจำนวนลดน้อยลงซึ่งส่งผลกับเกษตรกรอย่างมาก การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อหายีนที่แสดงออกต่างกันเมื่อกุ้งขาวแวนนาไมติดเชื้อไวรัสตัวแดงดวง ด้วยการฉีดไวรัสตัวแดงดวงขาวปริมาณที่ทำให้กุ้งขาวแวนนาไมตายเฉียบพลันที่วันที่ 3 และใช้เพื่อค้นหายีนที่แสดงออกต่างกันที่ตอบสนองต่อการติดเชื้อไวรัสตัวแดงดวงขาวหลังการฉีดเชื้อที่เวลาต่างๆ ได้แก่ 0 6 9 12 24 และ 48 ชั่วโมง โดยวิธี differential displayed RT-PCR ใช้การจับคู่ของไพรเมอร์ จำนวน 45 คู่ไพรเมอร์ ของไพรเมอร์ oligo-dT ที่มีปลายห้อยสองเบสสามไพรเมอร์ ได้แก่ AT หรือ GT หรือ CG กับไพรเมอร์สุ่มจับ 15 ไพรเมอร์ (P1 ถึง P15) พบแถบดีเอ็นเอที่มีระดับการแสดงออกที่สูงขึ้นมากกว่าสองเท่าจากแต่ละคู่ของแถบที่ตรงกันจำนวน 30 แถบ จากการจับคู่ของไพรเมอร์ 9 คู่ ได้แก่ คู่ไพรเมอร์ oligo-dT-AT กับไพรเมอร์แบบสุ่มจับ P4 จำนวน 1 แถบ คู่ไพรเมอร์ oligo-dT-CG กับ ไพรเมอร์แบบสุ่มจับ P1 หรือ P2 หรือ P3 หรือ P4 จำนวน 17 แถบ ในขณะที่ คู่ไพรเมอร์ oligo-dT-GT กับ ไพรเมอร์แบบสุ่ม P3 หรือ P4 หรือ P9 หรือ P10 จำนวน 12 แถบ แถบดีเอ็นเอเหล่านี้จะนำไปวิเคราะห์หาลำดับดีเอ็นเอและหาข้อมูลจาก GenBank ในงานวิจัยต่อไป
เอกสารอ้างอิง
ปิยะบุตร วานิชพงษ์พันธุ์. 2545. ศาสตร์ของกุ้งขาว ลิโทพิเนียส แวนนาไม (ตอนที่ 1). วารสารสัตว์น้ำ
14(154): 87–90.
Chungjit, Anan, Suwit Wuthisuthimethavee Supawadee Poompuang, and Suriyan Tunkijjanukij. (2016). Gene Expression Profiles in Giant Freshwater Prawn Macrobrachium Rosenbergii Infected with Macrobrachium Rosenbergii Nodavirus (MrNV) by DD-PCR Technique. Kasetsart University Fisheries Research Bulletin. 40(2): 39–50.
Donald V. Lightner(1996). A handbook of shrimp pathology and diagnostic procedures for disease of cultured penaeid shrimp. World Aquaculture Society.
Gabriel Aguirre-Guzman Jesus Genaro Sanchez-Martinez Angel Isidro Campa-Cordova Antonio Luna-Gonzalez Felipe Ascencio. (2009). Penaeid Shrimp Immune System. Thai Journal of Veterinary Medicine. 39(3): 205–15.
Hirono, Ikuo, and Anchalee Tassanakajon. (2006). Differentially Expressed Genes in Hemocytes of Vibrio Harveyi -Challenged Shrimp Penaeus Monodon. Korean Society for Biochemistry and Molecular Biology. 39(1): 26–36.
Mullis, K.B., Erlich, H.A., Arnheim, N., Horn, G.T., Saiki, R.K., & Scharf, S.J. (1986). Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences. United States.
Peale, Franklin V, and Mary E Gerritsen. (2001). Gene Profiling Techniques and Their Application in Angiogenesis and Vascular Development. Journal of Pathology. 195 : 7–19.
Sánchez-Paz, Arturo. 2010. White Spot Syndrome Virus: An Overview on an Emergent Concern. Veterinary Research. 41(6).
Tawe, Wilson N, Marie-luise Eschbach, Rolf D Walter, and Kimberly Henkle-dührsen. 1998. Identification of Stress-Responsive Genes in Caenorhabditis Elegans Using RT-PCR Differential Display. Nucleic Acids Research. 26(7): 1621–27.
Bas Verbruggen , Lisa K. Bickley , Ronny van Aerle , Kelly S. Bateman,Grant D. Stentiford,
Eduarda M. Santos, and Charles R. Tyler. 2016. Molecular Mechanisms of White Spot Syndrome Virus Infection and Perspectives on Treatments. Viruses. 8(1): 1–29.
Wang, Pei Hui, Tianzhi Huang, Xiaobo Zhang, and Jian Guo He. 2014. Antiviral Defense in Shrimp: From Innate Immunity to Viral Infection. Antiviral Research. 108(1).
ดาวน์โหลด
เผยแพร่แล้ว
ฉบับ
ประเภทบทความ
สัญญาอนุญาต
โปรดกรอกเอกสารและลงนาม "หนังสือรับรองให้ตีพิมพ์บทความในวารสารวิจัยมหาวิทยาลัยราชภัฏพระนคร สาขาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี" ก่อนการตีพิมพ์
