การใช้ nuclear ITS region เป็นเครื่องหมายดีเอ็นเอบาร์โค้ดในการตรวจระบุชนิดเห็ดสกุล Macrocybe ที่ก่อให้เกิดโรคอาหารเป็นพิษ

Main Article Content

ณัฐกานต์ หนูรุ่น
สิทธิพร ปานเม่น
พรพรรณา ชลนากิจกุล
สุจิตรา สิกพันธ์
รุ่งแสง จันทร์คุณาสุขะ
ศรีประภา ภัสรพงษ์กุล
ชิดกมล ทูลคำรักษ์
อัญชลี นิตมา
ชุติมญชุ์ อุตวิชัย
นิสากร ปาละกูล
ดุษฎี พลภัทรพิเศษกุล
อาชวินทร์ โรจนวิวัฒน์

บทคัดย่อ

เห็ดสกุล Macrocybe จัดเป็นราขนาดใหญ่ที่มีรายงาน 8 ชนิดทั่วโลก โดยในประเทศไทยพบการรายงานเพียง 2 ชนิดได้แก่ M. crassa (เห็ดตีนแรด) ที่รับประทานได้และ M. gigantea ที่ไม่มีข้อมูลการรับประทาน ซึ่งเห็ดทั้งสองชนิดมีลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่คล้ายคลึงกัน ข้อมูลอ้างอิงจากศูนย์พิษวิทยาพบสถานการณ์การเกิดพิษจากเห็ดสกุล Macrocybe บ่อยครั้งซึ่งลักษณะตัวอย่างที่พบมีความใกล้เคียงกับ M. crassa ที่รับประทานได้ ดังนั้นการศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อระบุชนิดเห็ดสกุล Macrocybe จาก 7 กรณีการเกิดพิษระหว่างปี พ.ศ. 2555 ถึง พ.ศ. 2565 โดยใช้ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของ nuclear internal transcribed spacer (ITS) วิเคราะห์ความสัมพันธ์เทียบกับฐานข้อมูล BLASTN และ BOLD (ฐานข้อมูลบาร์โค้ดของสิ่งมีชีวิต) อธิบายลักษณะแผนภูมิเชิงวิวัฒนาการโดยใช้วิธี maximum likelihood (ML) ผลการศึกษาจากฐานข้อมูล BLASTN และ BOLD พบลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ได้จากตัวอย่างส่งตรวจมีความคล้ายคลึงที่จะเป็นเห็ด M. gigantea สูง อีกทั้งข้อมูลแผนภูมิเชิงวิวัฒนาการเมื่อวิเคราะห์ด้วยวิธี ML ยืนยันได้ว่าเห็ดสกุล Macrocybe ที่ผู้ป่วยรับประทานเป็นชนิด M. gigantea แม้ว่าเห็ดชนิดนี้ถือว่าเป็นเห็ดที่รับประทานได้ในประเทศอินเดีย แต่อย่างไรก็ตามพบรายงานอาหารเป็นพิษจากเห็ด M. gigantea ในประเทศจีน สำหรับในประเทศไทยพบผู้ป่วยที่รับประทานเห็ดชนิดนี้มีอาการทางระบบทางเดินอาหารหลังจากรับประทานในระยะเวลา 2 ถึง 3.30 ชั่วโมง แสดงให้เห็นว่าเห็ดที่กินได้บางชนิดอาจเป็นพิษต่อมนุษย์ได้

Article Details

รูปแบบการอ้างอิง
หนูรุ่น ณ., ปานเม่น ส. ., ชลนากิจกุล พ. ., สิกพันธ์ ส. ., จันทร์คุณาสุขะ ร. ., ภัสรพงษ์กุล ศ. ., ทูลคำรักษ์ ช. ., นิตมา อ., อุตวิชัย ช. ., ปาละกูล น. ., พลภัทรพิเศษกุล ด., & โรจนวิวัฒน์ อ. . (2023). การใช้ nuclear ITS region เป็นเครื่องหมายดีเอ็นเอบาร์โค้ดในการตรวจระบุชนิดเห็ดสกุล Macrocybe ที่ก่อให้เกิดโรคอาหารเป็นพิษ. วารสารพิษวิทยาไทย, 38(1), 55–67. สืบค้น จาก https://li01.tci-thaijo.org/index.php/ThaiJToxicol/article/view/258482
ประเภทบทความ
บทความวิจัย

เอกสารอ้างอิง

Chandrasrikul A, Suwanarit P, Sangwanit U, et al. Checklist of Mushrooms (Basidio-mycetes) in Thailand. Bangkok, Thailand: Office of Natural Resources and Environmental Policy and Planning; 2011. 448 p.

อุทัยวรรณ แสงวณิช, พูนพิไล สุวรรณฤทธิ์, อัจฉรา พยัพพานนท์, และคณะ. บัญชีรายการทรัพย์สินชีวภาพ เห็ด. สำนักงานพัฒนาเศรษฐกิจจากฐานชีวภาพ (องค์กรมหาชน); 2556. 374 หน้า.

Naksuwankul K, Thongbor A, Chantharasena C, et al. Identification by Morphological and Local Wisdom and Distribution of Poisonous and Edible Mushroom in Thailand. BUSCIJ 2022; 27(1): 66-84.

Nooron N, Parnmen S, Sikaphana S, et al. The situation of mushrooms food poisoning in Thailand: Symptoms and common species list. Thai J Toxicol 2020; 35: 58-69.

White J, Weinstein SA, De Haro L, et al. Mushroom poisoning: A proposed new clinical classification. Toxicon 2019; 157: 53-65.

Bresinsky A, Besl H. A colour atlas of poisonous fungi: A handbook for pharmacists, doctors, and biologists. London: Wolfe Publishing Ltd, 1990. 295 p.

Assisi F. Wild mushrooms: food poisoning prevention guide. Milan: Poison Control Centre of Milan, 2015. 26 p.

Parnmen S, Sikaphan S, Leudang S, et al. Molecular identification of poisonous mushrooms using nuclear ITS region and peptide toxins: a retrospective study on fatal cases in Thailand. J Toxicol Sci 2016; 41(1): 65-76.

Ratnasingham S, Hebert PD. BOLD: The Barcode of Life Data System. Molecular ecology notes 2007; 7(3): 355-64. Available at http://www.barcodinglife.org, accessed on April 5 2023.

Pegler D, Lodge D, Nakasone K. The Pantropical Genus Macrocybe Gen. nov. Mycologia 1998; 90: 494.

Morgulis A, Coulouris G, Raytselis Y, et al. Database indexing for production MegaBLAST searches. Bioinformatics 2008; 24(16): 1757-64.

Stamatakis A. RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies. Bioinformatics 2014; 30(9): 1312-13.

Miller MA, Pfeiffer W, Schwartz T. Creating the CIPRES Science Gateway for Inference of large phylogenetic trees. In: Proceeding of the Gateway Computing Environments Workshop (GCE). New orleans; 2010, 1–8.

Price MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree 2–approximately maximum-likelihood trees for large alignments. PloS one 2010; 5(3): e9490.

Das AK, Nanda PK, Dandapat P, et al. Edible Mushrooms as Functional Ingredients for Development of Healthier and More Sustainable Muscle Foods: A Flexitarian Approach. Molecules 2021; 26(9): 2463.

ขวัญเรือน นาคสุวรรณ์กุล. สารปรับปรุงภูมิคุ้มกันจากเห็ดที่มีฤทธิ์ทางยา. KKU Sci J 2018; 46(3) : 395-407.

Duffy TJ. Toxic fungi of western North America. Group. MykoWeb, 2008. 166 p.

Boonpratuang T, Choeyklin R, Promkium-on P, et al. The identification of poisonous mushrooms in Thailand during 2008-2012. Thai Mushroom 2012; 6–13.

Naksuwankul K, Thongbor A, Chantharasena C, et al. Classification of poisonous mushroom base on morphological charac-teristics and indigenous knowledge at Ubon Ratchathani province. KKU Sci J 2021; 49(1): 40–57.

Leudang S, Sikaphan S, Parnmen S, et al. DNA-based identification of gastrointestinal irritant mushrooms in the genus Chlorophyllum: A food poisoning case in Thailand. J Health Res 2017; 31(1): 41-9.

Parnmen S, Nooron N, Leudang S, et al. Phylogenetic evidence revealed Cantharocybe virosa (Agaricales, Hygrophoraceae) as a new clinical record for gastrointestinal mushroom poisoning in Thailand. Toxicol Res 2020; 36: 239-48.

Razaq A, Nawaz R, Khalid AN. An Asian edible mushroom, Macrocybe gigantea: its distribution and ITS-rDNA based phylogeny. Mycosphere 2016; 7(4): 525–30.

Inyod T, Sassanarakit S, Payapanon A, Keawsompong S. Selection of Macrocybe crassa mushroom for commercial production. Agric Nat Resour 2016; 50(3): 186–191.

Li H, Zhang H, Zhang Y, et al. Mushroom Poisoning Outbreaks–China, 2019. China CDC Wkly 2020; 2 (2): 19–24.