Genetic Diversity of Native Chicken in Uttaradit Province for Sustainable of Utilization and Conservation
Article Sidebar
Published:
Feb 12, 2018
Keywords:
Biodiversity Native Chicken Mitochondria DNA Cytochrome B Uttaradit Province
Main Article Content
Abstract
This study was to investigate genetic diversity of native chicken in Uttaradit Province by using mitochondrial DNA (mtDNA) cytochrome b sequences. A total of 22 native chicken of 9 amphoe in Uttaradit province represented. The 560 bases of mtDNA (cytochrome b) were sequenced and compared to native chicken reported in GenBank, and the phylogenetic tree for the native chickens were constructed based on the cytochrome b sequences. Phylogenetic analyses revealed that Thai native chickens were divided into two lineages. The first lineage was closely related to G. gallus gallus andG. gallus spadiceus. The second lineage was closely related to G. gallus gallus, G. gallus spadiceus and G. gallus murghi.This is the first molecular data report of native chicken in Uttaradit Province. The information generated by this study will greatly aid in the establishment of effective breeding programs and conservation genetics of native chicken in Uttaradit.
Article Details
How to Cite
พรหมน้อย ส. and พัฒนกุลอนันต์ ส. (2018) “Genetic Diversity of Native Chicken in Uttaradit Province for Sustainable of Utilization and Conservation”, Journal of Mahanakorn Veterinary Medicine, 12(2), pp. 67–77. Available at: https://li01.tci-thaijo.org/index.php/jmvm/article/view/113332 (Accessed: 13 November 2024).
Section
Research Article
References
กลุ่มสารสนเทศและข้อมูลสถิติ ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร. 2558. ข้อมูลจำนวนปศุสัตว์ในประเทศไทย ปี 2558. กรมปศุสัตว์ กระทรวงเกษตรและสหกรณ์. 193 หน้า.
เจนรงค์ คำมงคุณ ชัยตรี บุญดี และอำนวย เลี้ยวธารากุล. 2559. ความหลากหลายของไก่พื้นเมืองในพื้นที่ภาคเหนือและภาคตะวันออกเฉียงเหนือของไทย. วารสารแก่นเกษตร 44 ฉบับพิเศษ 1: (2559). หน้า 37-42.
เฉลิมชัย หอมตา. 2546. การจําแนกสายพันธุไกพื้นเมืองในภาคตะวันออกเฉียงเหนือดวย ไมโครแซทเทลไลท-มารกเกอร์. วิทยานิพนธ์หลักสูตรปริญญาวิทยาศาสตรมหาบัณฑิตสาขาวิชาเทคโนโลยีการผลิตสัตว มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี. 90 หน้า.
สิริวดี พรหมน้อย และสมเกียรติ ดอนทองแดง. 2559. ความหลากหลายทางพันธุกรรมของไก่เขียวพาลีในพื้นที่อำเภอพิชัย จังหวัดอุตรดิตถ์ด้วยการวิเคราะห์ยีนไซโตโครมบีในไมโตคอนเดรีย. วารสารวิจัยราชภัฏพระนคร สาขาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี. ปีที่ 11 ฉบับพิเศษ (พฤศจิกายน 2559). หน้า 355-365.
อลงกลด แทนออมทอง. (2542). ที่มาของต้นตระกูลไก่ (Origin of Fowl). สาส์นไก่. 3(46): 33-36.
Berthouly-Salazar, C., Rognon, X., Van, T.N., Gely, M., Chi, C.V., Tixier-Boichard, M., Bed’Hom, B., Bruneua, N., Verrier, E., Maillard, J.C. and Michaux, J.R. 2010. Vietnamese chickens: a gate towards Asian genetic diversity. BMC Genetics. 11: 53.
Fumihito, A., Miyake, T., Takada, M., Shingu, R., Endo, T., Gojobori, T., Kondo, N. and Ohno, S (1996). Monophyletic origin and unique dispersal patterns of domestic fowls. Proceeding of the National Academy of Sciences of the United States of America. 93: 6792-6795.
Giuffra, E., Kijas, M.H., Amarger, V., Carlborg, O., Jeon, J.T. and Andersson, L. (2000). The origin of the domestic pig: independent domestication and subsequent introgression. Genetics. 154: 1785-1791.
Hiendleder, S., Kaupe, B., Wassmuth, R. and Janke, A. (2002). Molecular analysis of wild and domestic sheep questions current nomenclature and provides evidence for domestication from two different subspecies. Proceeding of Royal Society B: Biol. Sci. 296: 893-904.
Kanginakudru, S., Metta, M., Jakati, R.D. and Nagaraju, J. (2008). Genetic evidence from Indian red junglefowl corroborates multiple domestication of modern day chicken. BMC Evolutionary Biology. 8: 174.
Lee, Y.J., Bhuiyan, M.S.A., Chung, H.J., Jung, W.Y., Choi, K.D., Jang, B.G., Paek, W.K., Jeon, J.T., Park, C.S. and Lee, J.H. (2007). Mitochondrial DNA diversity of Korean Ogal chicken. Asian-Austrarian J. Anim. Sci. 20(4): 477-481.
Liu, Y.P., Wu, G.S., Yao, Y.G., Miao, Y.W., Luikart, G., Baig, M., Beja-Pereira, A., Ding, Z.L., Palanichamy, M.G. and Zhang, Y.P. (2006). Multiple maternal origins of chickens: out of the Asian jungles. Mol. Phylogenet. Evol. 38: 12-19.
Mannen, H., Kohno, M., Nagata, Y., Tsuji, S., Bradley, D.G., Yeo, J.S., Nyamsamba, D., Zagdsuren, Y., Yokohama, M., Nomura, K. and Amano, T. (2004). Independent mitochondrial origin and historical genetic differentiation of north eastern Asian cattle. Mol. Phylogenet. Evol. 32: 539-544.
Nishibori, M., Shimogiri, T., Hayashi, T. and Yasue, H. (2005). Melecular evidence for hybridization of species in the genus Gallus except for Gallus varius. Animal Genetics. 36: 267-375.
Niu, D., F. Yan, L. Jung, R. Hui, Y. Xu-Ping, C Gong and Z Ya-Ping. (2002). The origin and genetic diversity of Chinese native chicken breeds. Biochem. Genetics. 40(5/6): 163-174.
Odahara, S., Chung, H.J., Choi, S.H., Yu, S.L., Sasazaki, S., Mannan, H., Park, C.S. and Lee, J.H. (2006). Mitochondrial DNA diversity of Korean natice goats. Asian-Australian J. Anim. Sci. 19(4): 482-485.
Peter, J.L., McCracken, K.G., Zhuravlev, Y.N., Lu, Y., Wilson, R.E., Johnson, K.P. and Omland, K.E. (2005). Phylogenetics of wigeons and allies (Anatidae: Anus): The importance of sampling multiple loci and multiple individuals. Mol. Phylogenet. Evol. 35: 209-224.
Pramual, P., Meeyen, K., Wongpakam, K. and Klinhom, U. (2013). Genetic diversity of Thai Native Chicken inferred from mitochondrial DNA sequences. Trop. Nat. Hist. 13(2): 97-106.
Ramadamptian, H.A.I., Galal, A., Fathi, M.M., El, F.S. and Yakoub, H.A. (2011). Characterization of two Egyptian native chicken breeds using genetic and immunological parameters. Biotech. Anim. Husbandry. 27: 1-16.
Smith, E.J., and D.W. Burt. 1998. Parameter of the chicken genome (Gallus domesticus). Anim. Genetic. 29: 290-294.
Tamura K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. and Kumar, S. 2011. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 28: 2731-2739.
Vila, C., Leonard, J.A., Gotherstorm, A., Marklund, S., Sandberg, K., Liden, K., Wayne, R.K. and Ellegren, H. (2001). Widespread prigin of domestic horse lineages. Science. 291: 474-477.
เจนรงค์ คำมงคุณ ชัยตรี บุญดี และอำนวย เลี้ยวธารากุล. 2559. ความหลากหลายของไก่พื้นเมืองในพื้นที่ภาคเหนือและภาคตะวันออกเฉียงเหนือของไทย. วารสารแก่นเกษตร 44 ฉบับพิเศษ 1: (2559). หน้า 37-42.
เฉลิมชัย หอมตา. 2546. การจําแนกสายพันธุไกพื้นเมืองในภาคตะวันออกเฉียงเหนือดวย ไมโครแซทเทลไลท-มารกเกอร์. วิทยานิพนธ์หลักสูตรปริญญาวิทยาศาสตรมหาบัณฑิตสาขาวิชาเทคโนโลยีการผลิตสัตว มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี. 90 หน้า.
สิริวดี พรหมน้อย และสมเกียรติ ดอนทองแดง. 2559. ความหลากหลายทางพันธุกรรมของไก่เขียวพาลีในพื้นที่อำเภอพิชัย จังหวัดอุตรดิตถ์ด้วยการวิเคราะห์ยีนไซโตโครมบีในไมโตคอนเดรีย. วารสารวิจัยราชภัฏพระนคร สาขาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี. ปีที่ 11 ฉบับพิเศษ (พฤศจิกายน 2559). หน้า 355-365.
อลงกลด แทนออมทอง. (2542). ที่มาของต้นตระกูลไก่ (Origin of Fowl). สาส์นไก่. 3(46): 33-36.
Berthouly-Salazar, C., Rognon, X., Van, T.N., Gely, M., Chi, C.V., Tixier-Boichard, M., Bed’Hom, B., Bruneua, N., Verrier, E., Maillard, J.C. and Michaux, J.R. 2010. Vietnamese chickens: a gate towards Asian genetic diversity. BMC Genetics. 11: 53.
Fumihito, A., Miyake, T., Takada, M., Shingu, R., Endo, T., Gojobori, T., Kondo, N. and Ohno, S (1996). Monophyletic origin and unique dispersal patterns of domestic fowls. Proceeding of the National Academy of Sciences of the United States of America. 93: 6792-6795.
Giuffra, E., Kijas, M.H., Amarger, V., Carlborg, O., Jeon, J.T. and Andersson, L. (2000). The origin of the domestic pig: independent domestication and subsequent introgression. Genetics. 154: 1785-1791.
Hiendleder, S., Kaupe, B., Wassmuth, R. and Janke, A. (2002). Molecular analysis of wild and domestic sheep questions current nomenclature and provides evidence for domestication from two different subspecies. Proceeding of Royal Society B: Biol. Sci. 296: 893-904.
Kanginakudru, S., Metta, M., Jakati, R.D. and Nagaraju, J. (2008). Genetic evidence from Indian red junglefowl corroborates multiple domestication of modern day chicken. BMC Evolutionary Biology. 8: 174.
Lee, Y.J., Bhuiyan, M.S.A., Chung, H.J., Jung, W.Y., Choi, K.D., Jang, B.G., Paek, W.K., Jeon, J.T., Park, C.S. and Lee, J.H. (2007). Mitochondrial DNA diversity of Korean Ogal chicken. Asian-Austrarian J. Anim. Sci. 20(4): 477-481.
Liu, Y.P., Wu, G.S., Yao, Y.G., Miao, Y.W., Luikart, G., Baig, M., Beja-Pereira, A., Ding, Z.L., Palanichamy, M.G. and Zhang, Y.P. (2006). Multiple maternal origins of chickens: out of the Asian jungles. Mol. Phylogenet. Evol. 38: 12-19.
Mannen, H., Kohno, M., Nagata, Y., Tsuji, S., Bradley, D.G., Yeo, J.S., Nyamsamba, D., Zagdsuren, Y., Yokohama, M., Nomura, K. and Amano, T. (2004). Independent mitochondrial origin and historical genetic differentiation of north eastern Asian cattle. Mol. Phylogenet. Evol. 32: 539-544.
Nishibori, M., Shimogiri, T., Hayashi, T. and Yasue, H. (2005). Melecular evidence for hybridization of species in the genus Gallus except for Gallus varius. Animal Genetics. 36: 267-375.
Niu, D., F. Yan, L. Jung, R. Hui, Y. Xu-Ping, C Gong and Z Ya-Ping. (2002). The origin and genetic diversity of Chinese native chicken breeds. Biochem. Genetics. 40(5/6): 163-174.
Odahara, S., Chung, H.J., Choi, S.H., Yu, S.L., Sasazaki, S., Mannan, H., Park, C.S. and Lee, J.H. (2006). Mitochondrial DNA diversity of Korean natice goats. Asian-Australian J. Anim. Sci. 19(4): 482-485.
Peter, J.L., McCracken, K.G., Zhuravlev, Y.N., Lu, Y., Wilson, R.E., Johnson, K.P. and Omland, K.E. (2005). Phylogenetics of wigeons and allies (Anatidae: Anus): The importance of sampling multiple loci and multiple individuals. Mol. Phylogenet. Evol. 35: 209-224.
Pramual, P., Meeyen, K., Wongpakam, K. and Klinhom, U. (2013). Genetic diversity of Thai Native Chicken inferred from mitochondrial DNA sequences. Trop. Nat. Hist. 13(2): 97-106.
Ramadamptian, H.A.I., Galal, A., Fathi, M.M., El, F.S. and Yakoub, H.A. (2011). Characterization of two Egyptian native chicken breeds using genetic and immunological parameters. Biotech. Anim. Husbandry. 27: 1-16.
Smith, E.J., and D.W. Burt. 1998. Parameter of the chicken genome (Gallus domesticus). Anim. Genetic. 29: 290-294.
Tamura K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. and Kumar, S. 2011. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 28: 2731-2739.
Vila, C., Leonard, J.A., Gotherstorm, A., Marklund, S., Sandberg, K., Liden, K., Wayne, R.K. and Ellegren, H. (2001). Widespread prigin of domestic horse lineages. Science. 291: 474-477.