การศึกษาดีเอ็นเอบาร์โค้ดของปลาเศรษฐกิจ 5 ชนิดในแม่น้ำปิง จังหวัดตาก

Authors

  • ประภาส ยมเกิด คณะเกษตรศาสตร์และทรัพยากรธรรมชาติ มหาวิทยาลัยพะเยา จังหวัดพะเยา 56000
  • ดุจฤดี ปานพรหมมินทร์ (1) คณะเกษตรศาสตร์และทรัพยากรธรรมชาติ มหาวิทยาลัยพะเยา จังหวัดพะเยา 56000 (2) ศูนย์ความเป็นเลิศด้านเทคโนโลยีชีวภาพเกษตร สำนักพัฒนาบัณฑิตศึกษาและวิจัยด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี สำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา จังหวัดกรุงเทพมหานคร 10900

Keywords:

ดีเอ็นเอบาร์โค้ด, ยีน Cytochrome c oxidase I, ปลา, แม่น้ำปิงDNA barcoding, cytochrome c oxidase I, fish, Ping River

Abstract

การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อทราบลำดับนิวคลีโอไทด์ของดีเอ็นเอบาร์โค้ดของปลาเศรษฐกิจ 5 ชนิดในแม่น้ำปิง จังหวัดตาก ได้แก่ ปลารากกล้วย (Acantopsis choirorhynchos) ปลากระดี่หม้อ (Trichogaster trichopterus) ปลายี่สกเทศ (Labeo rohita) ปลาหมูข้างลาย (Syncrossus helodes) และปลาตะเพียนขาว (Barbonymus gonionotus) พบว่า ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน Cytochrome c oxidase I (COI) ของปลาทั้ง 5 ชนิดมีความยาวเฉลี่ยเท่ากับ 623 คู่เบส อยู่ในช่วง 580-636 คู่เบส เมื่อศึกษา Multiple sequence alignment ของลำดับกรดอะมิโนของยีน COI ในปลา แต่ละชนิด พบว่า ปลากระดี่หม้อ ปลาหมูข้างลาย และปลาตะเพียนขาวมีลำดับกรดอะมิโนภายในชนิดเท่ากับ 0.000 ในขณะที่ปลารากกล้วย และปลายี่สกเทศ มีความแตกต่างของลำดับกรดอะมิโนภายในชนิดเท่ากับ 0.005 ในการศึกษาความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการของลำดับกรดอะมิโนของยีน COI ทั้งหมดในปลาทั้ง 5 ชนิด พบว่า สามารถแบ่งกลุ่มของปลาได้เป็น 2 กลุ่มใหญ่ๆ ตามระบบอนุกรมวิธาน คือ กลุ่มของปลาในอันดับ Cypriniformes ได้แก่ ปลารากกล้วย ปลายี่สกเทศ ปลาหมูข้างลาย และปลาตะเพียนขาว และกลุ่มของปลาในอันดับ Perciformes ได้แก่ ปลากระดี่หม้อ

 

DNA barcoding of 5 fish economy from Ping River, Tak Province

Parpras Yomkerd1 and Dutrudi Panprommin1, 2*

1 School of Agriculture and Natural Resources, University of Phayao, Phayao Province 56000

2 Center of Excellence on Agricultural Biotechnology: (AG-BIO/PERDO-CHE), Bangkok 10900

The purpose of this study is to determine the COI sequences to gather DNA barcodes for fish 5 species of economic importance: horseface loach (Acantopsis choirorhynchos); three spot gourami (Trichogaster trichopterus); rohu (Labeo rohita); tiger loach (Syncrossus helodes); and silver barb (Barbonymus gonionotus) from Ping River, Tak province. The average of COI sequence length for 5 fish species was 623 bp ranging from 580 to 636 bp. The genetic divergences within species was 0.000 in three spot gourami, tiger loach and silver barb, whereas, horseface loach and rohu was 0.005. The phylogenetic tree tested on 5 fish species revealed that all included species could be classified into two groups belonging to Order Cypriniformes included horseface loach, rohu, tiger loach and silver barb and Order Perciformes which was including three spot gourami.

vol6No1

Downloads

Published

2013-04-01

How to Cite

1.
ยมเกิด ป, ปานพรหมมินทร์ ด. การศึกษาดีเอ็นเอบาร์โค้ดของปลาเศรษฐกิจ 5 ชนิดในแม่น้ำปิง จังหวัดตาก. Health Sci Tech Rev [Internet]. 2013 Apr. 1 [cited 2024 Dec. 22];6(1):64-70. Available from: https://li01.tci-thaijo.org/index.php/journalup/article/view/43279

Issue

Vol. 6 No. 1 (2013): January - April

Section

Research articles

License

ผู้นิพนธ์ต้องรับผิดชอบข้อความในบทนิพนธ์ของตน มหาวิทยาลัยพะเยาไม่จำเป็นต้องเห็นด้วยกับบทความที่ตีพิมพ์เสมอไป ผู้สนใจสามารถคัดลอก และนำไปใช้ได้ แต่จะต้องขออนุมัติเจ้าของ และได้รับการอนุมัติเป็นลายลักษณ์อักษรก่อน พร้อมกับมีการอ้างอิงและกล่าวคำขอบคุณให้ถูกต้องด้วย

The authors are themselves responsible for their contents. Signed articles may not always reflect the opinion of University of Phayao. The articles can be reproduced and reprinted, provided that permission is given by the authors and acknowledgement must be given.