การเปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์และการแสดงออกของยีน CpRDR6 ที่เกี่ยวข้องกับความต้านทานโรคไวรัสใบด่างจุดวงแหวนมะละกอ

บทคัดย่อ

มะละกอ (Carica papaya L.) เป็นไม้ผลที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจ มักประสบปัญหาการระบาดของโรคไวรัสใบด่างจุดวงแหวน ซึ่งเป็นโรคที่สำคัญและมีผลกระทบต่อการปลูกมะละกอในประเทศไทยอย่างมาก มีสาเหตุมาจากไวรัสใบด่างจุดวงแหวนมะละกอ (Papaya ringspotvirus, PRSV) จากรายงาน พบว่า ยีน RDR6 อยู่ในกระบวนการ RNA silencing และเกี่ยวข้องกับความต้านทานต่อไวรัส การศึกษานี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน CpRDR6 ในมะละกอ 3 พันธุ์ ได้แก่แขกดำฟลอริด้า และขอนแก่น 80 และศึกษารูปแบบการแสดงออกของยีน CpRDR6 ในมะละกอแขกดำ (พันธุ์อ่อนแอ) และฟลอริด้า (พันธุ์ทนทาน) ที่ถูกเข้าทำลายด้วยไวรัสสาเหตุโรคใบด่างจุดวงแหวนมะละกอ ผลจากการเปรียบเทียบนิวคลีโอไทด์จำนวน 1,125 คู่เบส ในส่วนของโปรตีน super family ใน exon 1 พบว่า มีความแตกต่างกันของนิวคลีโอไทด์ที่ตำแหน่ง 292 ซึ่งมีลำดับเบส C (cytosine) ในพันธุ์ฟลอริด้า ในขณะที่พันธุ์แขกดำพบลำดับเบส A (adenine) และพันธุ์ขอนแก่น 80 พบทั้ง C และ A ผลจากการศึกษารูปแบบการแสดงออกของยีน CpRDR6ในมะละกอสายพันธุ์อ่อนแอและต้านทาน พบว่ามะละกอพันธุ์แขกดำ ซึ่งเป็นพันธุ์อ่อนแอ มีการแสดงออกของยีนสูงสุดในวันที่ 5 และ ในสายพันธุ์ฟลอริด้าซึ่งเป็นพันธุ์ต้านทานมีการแสดงออกของยีนในวันที่ 9 หลังจากการปลูกเชื้อไวรัสจุดวงแหวนมะละกอ สำหรับการแสดงอาการของโรคในพันธุ์แขกดำและฟลอริด้า เริ่มแสดงอาการเส้นใบซีดใน 7 และ 9 วัน หลังการปลูกเชื้อไวรัสนอกจากนี้ พบว่า การแสดงออกของยีน CpRDR6 ในพันธุ์อ่อนแอจะสูงกว่าพันธุ์ต้านทาน