การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของโมกและพุดด้วยอาร์เอพีดี

Abstract

บทคัดย่อ

การศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของโมกและพุดในวงศ์ Apocynaceae จำนวน 12 ตัวอย่าง ด้วยเทคนิคอาร์เอพีดี โดยใช้ไพรเมอร์แบบสุ่ม 72 ชนิด พบว่าไพรเมอร์ 60 ชนิด สามารถเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอได้ เมื่อคัดเลือกไพรเมอร์ 23 ชนิด ที่ให้ลายพิมพ์ดีเอ็นเออย่างชัดเจนมาวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรม พบว่าสามารถแยกความแตกต่างระหว่างชนิดได้ด้วยแถบดีเอ็นเอที่จำเพาะ นอกจากนั้นยังพบไพรเมอร์ที่สามารถจำแนกโมกและพุดทั้ง 12 ตัวอย่าง ได้ด้วยไพรเมอร์เพียงชนิดเดียว เมื่อวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมสามารถจำแนกโมกและพุดได้ 5 กลุ่ม โดยมีค่าสัมประสิทธิ์ความเหมือนอยู่ระหว่าง 0.19 ถึง 0.88

คำสำคัญ : โมก; พุด; อาร์เอพีดี; ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม

Abstract

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique was used to study genetic relationship among 12 samples of Wrightia and Tabernaemontana in family Apocynaceae. Seventy-two random primers were screened and 60 primers could be used for DNA amplification. Twenty-three primers which gave clear amplified products were selected and used to analyze all species. The result showed significant differences among 12 samples by using specific fragments for each samples. Therefore, using only primer was able to identify all of species. A dendrogram constructed based on polymorphic bands showed genetic similarities among Wrightia and Tabernaemontana species and separated to 5 clusters with similarity coefficients ranging 0.19-0.88.

Keywords : Wrightia; Tabernaemontana; Apocynaceae; RAPD (random amplified polymorphic DNA); genetic relationship