การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของต้นสบู่ดำในประเทศไทยโดยเทคนิค Random Amplified Polymorphic DNA

Abstract

บทคัดย่อ

สบู่ดำเป็นพืชที่มีถิ่นกำเนิดในทวีปอเมริกา มีมากกว่า 200 สปีชีย์ กระจายอยู่ในเขตร้อน ซึ่งสบู่ดำเป็นพืชที่ใช้ผลิตน้ำมันไบโอดีเซล การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของต้นสบู่ดำในประเทศไทยจาก 9 ประชากร โดยใช้เทคนิค random amplified polymorphic DNA (RAPD) พบว่าจาก 68 ไพรเมอร์ มี 10 ไพรเมอร์ ที่นำมาใช้ ให้แถบดีเอ็นเอ 68 แถบ ในการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมระหว่างประชากร พบว่าค่า percentage polymorphic loci อยู่ระหว่าง 16.18 ถึง 52.94 จากการศึกษาระยะห่างทางพันธุกรรมมีค่าอยู่ระหว่าง 0.0121 ถึง 0.4372 ซึ่งจากระยะห่างทางพันธุกรรมชี้ให้เห็นว่าความหลากหลายทางพันธุกรรมระหว่างประชากรอยู่ในระดับต่ำ จากแผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมในรูปแบบ dendrogram โดย UPGMA (unweighted pair group method with arithmetic mean) สามารถแบ่งกลุ่มตัวอย่างประชากรของต้นสบู่ดำได้ 2 กลุ่ม 

คำสำคัญ : สบู่ดำ; อาร์เอพีดี; ความหลากหลาย

Abstract

Jatropha is one of a native plant of America continent. There are over 200 species that are widely distributed in tropics. Jatropha is a promising oil crop for bio-diesel. This investigation was carried out to assess the genetic diversity of 9 populations based on random amplified polymorphic DNA marker. Within 68 random primer used, 10 primers gave reproducible amplification banding patterns of 68 polymorphic bands. Genetic diversity greatly varied among the population, by which the percentage of polymorphic loci values range from 16.18 to 52.94. Genetic distance varied from 0.0121 to 0.4372. These indicate low level of genetic variation among the population of Jatropha sample. The UPGMA (unweighted pair group method with arithmetic mean) cluster analysis indicated two distinct clusters of Jatropha sample. 

Keywords: physic nut; RAPD; diversity