การพัฒนาเครื่องหมาย RAPD-SCAR เพื่อใช้ในการระบุชนิดบัวสายสกุล Nymphaea
Article Sidebar
เผยแพร่แล้ว:
ม.ค. 18, 2018
คำสำคัญ:
อาร์เอพีดี เครื่องหมายดีเอ็นเอ บัวสาย
Main Article Content
บทคัดย่อ
บทคัดย่อ
การพัฒนาเครื่องหมาย RAPD-SCAR สำหรับการระบุชนิดของบัวสายใน 3 สกุลย่อย ได้แก่ Anecphya Nymphaea และ Lotos จำนวน 27 ตัวอย่าง จากการคัดเลือกอาร์เอพีดีไพรเมอร์ จำนวน 30 ชนิด พบอาร์เอพีดีไพรเมอร์ที่ให้แถบดีเอ็นเอที่แตกต่างกันมี 18 ไพรเมอร์ (60 %) และเมื่อพัฒนาเครื่องหมาย SCAR สำหรับบัวสายแต่ละสกุลย่อย พบว่าในสกุลย่อย Anecphya จำนวน 7 ตัวอย่าง สามารถคัดเลือกได้ 5 เครื่องหมาย โดยมี 2 เครื่องหมาย คือ NYM007 ที่มีความจำเพาะกับบัวสายชนิด N. atrans และ N. immutabilis และ NYM010 ที่มีความจำเพาะกับบัวสายชนิด N. gigantea var. neorosea ในสกุลย่อย Nymphaea จำนวน 10 ตัวอย่าง สามารถคัดเลือกได้ 2 เครื่องหมาย โดยมี 1 เครื่องหมาย ที่มีความจำเพาะต่อ Nymphaea ‘Sunrise’ และในสกุลย่อย Lotos จำนวน 10 ตัวอย่าง สามารถคัดเลือกได้ 3 เครื่องหมาย แต่ไม่มีเครื่องหมายใดที่จำเพาะต่อบัวสายในสกุลย่อยนี้เลย ดังนั้นสามารถพัฒนาเครื่องหมาย RAPD-SCAR ทั้งหมด 3 เครื่องหมาย สำหรับใช้ระบุชนิดของบัวสายในสกุลย่อย Anecphya และ Nymphaea ได้
คำสำคัญ : อาร์เอพีดี; เครื่องหมายดีเอ็นเอ; บัวสาย
Article Details
ประเภทบทความ
Biological Sciences
เอกสารอ้างอิง
[1] Verdcourt, B., 1989, Flora of tropical East Africa Nymphaeaceae, Balkema, Rotterdam, 14 p.
[2] Borsch, T., Hilu, K.W., Wiersema, J.H., Lohne, C., Barthlott, W. and Wildes, V., 2007, Phylogeny of Nymphaea (Nymphaeaceae): Evidence from substitutions and microstructure changes in the chloroplast trnT-trnL region, Int. J. Pl. Sci. 168: 639-671.
[3] Volkowa, P.A. and Shipunov, A.B., 2007, Morphological variation of Nymphaea (Nymphaeaceae) in European Russia, Nord. J. Bot. 25: 329-338.
[4] มลิวรรณ นาคขุนทด, 2554, การเปรียบเทียบลักษณะทางสัณฐานวิทยาของละอองเรณูในบัวสายเขตอบอุ่นและเขตร้อน, ว.วิทยาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยราชภัฏพิบูลสงคราม 12: 60-73.
[5] Slocum, P.D., 2005, Waterlilies and Lotuses: Species, Cultivars, and New Hybrids, Portland, Oregon, 265 p.
[6] Sharma, S., 1993. The 1837-1838 famine in U.P.: Some dimensions of popular action, Ind. Econ. Soc. Hist. Rev. 30: 337-372.
[7] มลิวรรณ นาคขุนทด และวสันต์ เอื้อมลฉัตร, 2555, การจัดจำแนกพืชสกุลบัวสาย (Genus Nymphaea L.) โดยใช้วิธีการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์บริเวณ trnT-L, ว.วิทยาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร 6: 11-20.
[8] มลิวรรณ นาคขุนทด และณัฐวุฒิ วงศ์อนันต์, 2556, ความหลากหลายของรูปแบบนิวคลีโอไทด์บริเวณ ribosomal DNA ในบัวกินสาย, น. 322, การประชุมวิชาการระดับชาติ วิทยาศาสตร์วิจัย ครั้งที่ 5, มหาวิทยาลัยพะเยา, พะเยา.
[9] มลิวรรณ นาคขุนทด, 2557, ซิสเต็มมาติกระดับโมเลกุลของบัวสายสกุลย่อย Lotos โดยใช้ดีเอ็นเอในคลอโรพลาสต์และนิวเคลียส, น. 69, การประชุมวิชาการพฤกษศาสตร์แห่งประเทศไทย ครั้งที่ 8, มหาวิทยาลัยเชียงใหม่, เชียงใหม่.
[10] ภริตา ต้นสายเพ็ชร และเฌอมาลย์ วงศ์ชาวจันท์, 2555, การพัฒนาเครื่องหมาย RAPD-SCAR เพื่อใช้ในการคัดเลือกพันธุ์ไพล, น. 406-412, การประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตร ศาสตร์ ครั้งที่ 50 : สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์ สาขาพืช, มหาวิทยาลัยเกษตร ศาสตร์, กรุงเทพฯ.
[11] จันทร์เพ็ญ สะระ, ฉันทนา วิชรัตน์, ธีรนุช เจริญกิจ และแสงทองพงษ์เจริญกิต, 2556, การพัฒนาเครื่องหมาย SCAR เพื่อใช้ในการจำแนกลำไยลูกผสมระหว่างพันธุ์ดอ 27 และสีชมพู, น. 244-247, การประชุมวิชาการพันธุศาสตร์แห่งชาติ ครั้งที่ 18, โรงแรมแอมบาสเดอร์ สุขุมวิท, กรุงเทพฯ.
[12] Sairkar, P.K., Sharma, A. and Shukla, N.P., 2016, SCAR marker for identification and discrimination of Commiphora wightii and C. myrrha, Mol. Biol. Int. 2016: Article ID 1482796.
[13] Poczai, P., Matyas, K.K., Szabo, I., Varga, I., Hyvonen, J., Cernak, I., Gorji, A.M., Decsi, K. and Taller, J., 2011, Genetic variability of Thermal Nymphaea (Nymphaeaceae) populations based on ISSR markers: Implications on relationships, hybridi-zation and conservation, Plant Mol. Biol. Rep. 29: 906-918.
[14] Les, D.H., Moody, M.L. and Doran, A.S., 2004, A genetically confirmed inter-subgeneric hybrid in Nymphaea L. (Nymphaeaceae Salisb.), Hort. Science 39: 219-222.
[15] Puripunyavanich, V., La-ongsri, W., Boonsirichai, K. and Chukiatman, P., 2014, Nymphaea siamensis, the new species of waterlily in Thailand, Acta. Hort. 1035: 87-98.
[16] Agrawal, G.K., Pandey, R.N. and Agrawal, V.P., 1992, Isolation of DNA from Cheorospondias asillaris leaves. Biotech Biodiv. 2: 19-24.
[17] Doyle, J. and Doyle, J. 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin 19: 11-15.
[18] วสันต์ เอื้อมลฉัตร, 2555, การจัดจำแนกพืชสกุลบัวสาย (Genus Nymphaea L.) โดยใช้วิธีการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ในคลอโรพลาสต์, วิทยานิพนธ์ปริญญาโท มหาวิทยาลัยนเรศวร, นเรศวร, 90 น.
[19] มลิวรรณ นาคขุนทด และปัทมา เสนทอง, 2552, การตรวจสอบความหลากหลายทางพันธุกรรมของสบู่ดำในประเทศไทยด้วยวิธีอาร์เอพีดี, ว.วิทยาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร, 6: 55-65.
[20] Lohne, C., Borsch, T., Jacobs, S.W.L., Hellquist, C.B. and Wiersema, J.H., 2008, Nuclear and plastid DNA sequences reveal complex reticulate patterns in Australian water lilies (Nymphaea subgenus Anecphya, Nymphaeaceae), Austral. Syst. Bot. 21: 229-250.
[2] Borsch, T., Hilu, K.W., Wiersema, J.H., Lohne, C., Barthlott, W. and Wildes, V., 2007, Phylogeny of Nymphaea (Nymphaeaceae): Evidence from substitutions and microstructure changes in the chloroplast trnT-trnL region, Int. J. Pl. Sci. 168: 639-671.
[3] Volkowa, P.A. and Shipunov, A.B., 2007, Morphological variation of Nymphaea (Nymphaeaceae) in European Russia, Nord. J. Bot. 25: 329-338.
[4] มลิวรรณ นาคขุนทด, 2554, การเปรียบเทียบลักษณะทางสัณฐานวิทยาของละอองเรณูในบัวสายเขตอบอุ่นและเขตร้อน, ว.วิทยาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยราชภัฏพิบูลสงคราม 12: 60-73.
[5] Slocum, P.D., 2005, Waterlilies and Lotuses: Species, Cultivars, and New Hybrids, Portland, Oregon, 265 p.
[6] Sharma, S., 1993. The 1837-1838 famine in U.P.: Some dimensions of popular action, Ind. Econ. Soc. Hist. Rev. 30: 337-372.
[7] มลิวรรณ นาคขุนทด และวสันต์ เอื้อมลฉัตร, 2555, การจัดจำแนกพืชสกุลบัวสาย (Genus Nymphaea L.) โดยใช้วิธีการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์บริเวณ trnT-L, ว.วิทยาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร 6: 11-20.
[8] มลิวรรณ นาคขุนทด และณัฐวุฒิ วงศ์อนันต์, 2556, ความหลากหลายของรูปแบบนิวคลีโอไทด์บริเวณ ribosomal DNA ในบัวกินสาย, น. 322, การประชุมวิชาการระดับชาติ วิทยาศาสตร์วิจัย ครั้งที่ 5, มหาวิทยาลัยพะเยา, พะเยา.
[9] มลิวรรณ นาคขุนทด, 2557, ซิสเต็มมาติกระดับโมเลกุลของบัวสายสกุลย่อย Lotos โดยใช้ดีเอ็นเอในคลอโรพลาสต์และนิวเคลียส, น. 69, การประชุมวิชาการพฤกษศาสตร์แห่งประเทศไทย ครั้งที่ 8, มหาวิทยาลัยเชียงใหม่, เชียงใหม่.
[10] ภริตา ต้นสายเพ็ชร และเฌอมาลย์ วงศ์ชาวจันท์, 2555, การพัฒนาเครื่องหมาย RAPD-SCAR เพื่อใช้ในการคัดเลือกพันธุ์ไพล, น. 406-412, การประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตร ศาสตร์ ครั้งที่ 50 : สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์ สาขาพืช, มหาวิทยาลัยเกษตร ศาสตร์, กรุงเทพฯ.
[11] จันทร์เพ็ญ สะระ, ฉันทนา วิชรัตน์, ธีรนุช เจริญกิจ และแสงทองพงษ์เจริญกิต, 2556, การพัฒนาเครื่องหมาย SCAR เพื่อใช้ในการจำแนกลำไยลูกผสมระหว่างพันธุ์ดอ 27 และสีชมพู, น. 244-247, การประชุมวิชาการพันธุศาสตร์แห่งชาติ ครั้งที่ 18, โรงแรมแอมบาสเดอร์ สุขุมวิท, กรุงเทพฯ.
[12] Sairkar, P.K., Sharma, A. and Shukla, N.P., 2016, SCAR marker for identification and discrimination of Commiphora wightii and C. myrrha, Mol. Biol. Int. 2016: Article ID 1482796.
[13] Poczai, P., Matyas, K.K., Szabo, I., Varga, I., Hyvonen, J., Cernak, I., Gorji, A.M., Decsi, K. and Taller, J., 2011, Genetic variability of Thermal Nymphaea (Nymphaeaceae) populations based on ISSR markers: Implications on relationships, hybridi-zation and conservation, Plant Mol. Biol. Rep. 29: 906-918.
[14] Les, D.H., Moody, M.L. and Doran, A.S., 2004, A genetically confirmed inter-subgeneric hybrid in Nymphaea L. (Nymphaeaceae Salisb.), Hort. Science 39: 219-222.
[15] Puripunyavanich, V., La-ongsri, W., Boonsirichai, K. and Chukiatman, P., 2014, Nymphaea siamensis, the new species of waterlily in Thailand, Acta. Hort. 1035: 87-98.
[16] Agrawal, G.K., Pandey, R.N. and Agrawal, V.P., 1992, Isolation of DNA from Cheorospondias asillaris leaves. Biotech Biodiv. 2: 19-24.
[17] Doyle, J. and Doyle, J. 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin 19: 11-15.
[18] วสันต์ เอื้อมลฉัตร, 2555, การจัดจำแนกพืชสกุลบัวสาย (Genus Nymphaea L.) โดยใช้วิธีการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ในคลอโรพลาสต์, วิทยานิพนธ์ปริญญาโท มหาวิทยาลัยนเรศวร, นเรศวร, 90 น.
[19] มลิวรรณ นาคขุนทด และปัทมา เสนทอง, 2552, การตรวจสอบความหลากหลายทางพันธุกรรมของสบู่ดำในประเทศไทยด้วยวิธีอาร์เอพีดี, ว.วิทยาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร, 6: 55-65.
[20] Lohne, C., Borsch, T., Jacobs, S.W.L., Hellquist, C.B. and Wiersema, J.H., 2008, Nuclear and plastid DNA sequences reveal complex reticulate patterns in Australian water lilies (Nymphaea subgenus Anecphya, Nymphaeaceae), Austral. Syst. Bot. 21: 229-250.
