การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการจำแนกผักกาดด้วยเทคนิคแฮตอาร์เอพีดี

Abstract

บทคัดย่อ

ผักกาดเป็นพืชใบเลี้ยงคู่ที่นิยมใช้ประกอบอาหาร สามารถเพาะปลูกได้แทบทุกฤดูกาล งานวิจัยนี้ได้ศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของผักกาด 8 ชนิด ด้วยเทคนิคแฮตอาร์เอพีดี โดยใช้ไพรเมอร์แบบสุ่ม 72 ชนิด พบว่าไพรเมอร์ 54 ชนิด สามารถเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอได้ เมื่อคัดเลือกไพรเมอร์ 16 ชนิด ที่ให้ลายพิมพ์ ดีเอ็นเออย่างชัดเจนมาวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรม พบว่าสามารถแยกความแตกต่างระหว่างพันธุ์ได้ด้วยแถบดีเอ็นเอที่จำเพาะกับพันธุ์ เมื่อวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมโดยใช้โปรแกรม  NTSYS-pc พบว่าสามารถจำแนกพันธุ์ผักกาดได้ โดยมีค่าดัชนีความเหมือนอยู่ระหว่าง 0.38 ถึง 0.75

คำสำคัญ :

ผักกาด; การจำแนกพันธุ์; ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม; แฮตอาร์เอพีดี

Abstract

Brassica species are dicot and commonly used for cooking. It can be grown three crops per year. In this research, high annealing temperature random amplified polymorphic DNA (HAT-RAPD) technique was used to study the genetic diversity among 8 Brasicca cultivars. Seventy-two random primers were screened and 54 primers could be used for DNA amplification. Sixteen primers which gave clear amplified products were selected and used to analyze all cultivars. The result showed significant differences among 8 cultivars by using specific fragments for each cultivar. A dendrogram was constructed based on polymorphic bands using the NTSYS-pc program, which can be classified with similarity coefficients ranging 0.38-0.75.

Keywords:

Brassica; identification; genetic relationship; HAT-RAPD