การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของกล้วยจีโนม AAA ด้วยเทคนิคแฮตอาร์เอพีดี
Article Sidebar
Main Article Content
บทคัดย่อ
บทคัดย่อ
กล้วยหอมเป็นพืชเศรษฐกิจที่สร้างรายได้ให้กับเกษตรกรไทยเป็นอย่างมาก ปัจจุบันมีการขยายพื้นที่เพาะปลูกเพิ่มมากขึ้นและมีการปรับปรุงพันธุ์อย่างแพร่หลาย ดังนั้นงานวิจัยนี้จึงประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของกล้วยหอมจีโนม AAA 13 พันธุ์ ด้วยเครื่องหมายแฮตอาร์เอพีดี โดยใช้ไพรเมอร์แบบสุ่ม 72 ชนิด พบว่าสามารถคัดเลือกไพรเมอร์ 18 ชนิด ที่ให้ลายพิมพ์ดีเอ็นเออย่างชัดเจน เมื่อสร้างลายพิมพ์ดีเอ็นเอพบว่าปรากฏแถบดีเอ็นเอรวม 240 แถบ ขนาดประมาณ 250-3,000 คู่เบส ซึ่งเป็นแถบดีเอ็นเอที่ให้ความหลากรูป 199 แถบ (82.92 เปอร์เซ็นต์) และเมื่อสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ด้วยโปรแกรม NTSYS-pc รุ่น 2.01e และเลือกวิธีการจัดกลุ่มแบบ UPGMA พบว่ามีค่าดัชนีความเหมือน 0.65 ถึง 0.91 และสามารถแบ่งกล้วยหอมเป็น 3 กลุ่ม โดยผลการวิจัยนี้สามารถใช้ประโยชน์ในการวางแผนอนุรักษ์พันธุ์และปรับปรุงพันธุ์กล้วยต่อไป
คำสำคัญ : กล้วยหอม; สกุลมิวซา; ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม; เครื่องหมายดีเอ็นเอ; แฮตอาร์เอพีดี
Article Details
บทความที่ได้รับการตีพิมพ์เป็นลิขสิทธิ์ของคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ข้อความที่ปรากฏในแต่ละเรื่องของวารสารเล่มนี้เป็นเพียงความเห็นส่วนตัวของผู้เขียน ไม่มีความเกี่ยวข้องกับคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี หรือคณาจารย์ท่านอื่นในมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ผู้เขียนต้องยืนยันว่าความรับผิดชอบต่อทุกข้อความที่นำเสนอไว้ในบทความของตน หากมีข้อผิดพลาดหรือความไม่ถูกต้องใด ๆ
เอกสารอ้างอิง
ฐิตาพร มณีเนตร, ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์, 2560, การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการจำแนกกล้วยไม้สกุลหวายหมู่แคลิสตาด้วยเครื่องหมายแฮตอาร์เอพีดี, Thai J. Sci. Technol. 6: 316-323.
ฐิติพร โท้มโสภา, เปรมณัช ขุนปักษี, ธีระชัย ธนา นันต์ และนฤมล ธนานันต์, 2556, การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยสกุลมิวซาด้วยเทคนิคแฮตอาร์เอพีดี, Thai J. Genet. S1: 201-205.
นฤมล ธนานันต์, สุรีย์พร พุ่มเอี่ยม และธีระชัย ธนา นันต์, 2556, การจำแนกพันธุ์และความ สัมพันธ์ทางพันธุกรรมของกล้วยไม้ช้างและลูกผสมด้วยเครื่องหมายแฮตอาร์เอพีดี, ว.วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 21: 360-370.
เบญจมาศ ศิลาย้อย, 2558, กล้วย, สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ.
พรประภา ศิริเทพทวี, ฐิตาพร มณีเนตร, เปรมณัช ขุนปักษี, ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์, 2560, การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการจำแนกกล้วยด้วยเครื่องหมายสก็อต, Thai J. Sci. Technol. 6: 271-278.
ราชันย์ ภู่มา และสมราน สุดดี, 2557, ชื่อพรรณไม้แห่งประเทศไทย เต็ม สมิตินันท์ ฉบับแก้ไขเพิ่มเติม พ.ศ. 2557, สำนักงานหอพรรณไม้สำนักวิจัยการอนุรักษ์ป่าไม้และพันธุ์พืช กรมอุทยานแห่งชาติสัตว์ป่าและพันธุ์พืช, กรุงเทพฯ.
สำนักงานพัฒนาเศรษฐกิจจากฐานชีวภาพ (องค์ การมหาชน), 2554, บัญชีรายการทรัพย์สินชีวภาพกล้วย, สำนักงานพัฒนาเศรษฐกิจจากฐานชีวภาพ (องค์การมหาชน), กรุงเทพฯ.
สุรกฤษฏิ์ สุขสกุล, ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์, 2561, การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการจำแนกบัวสายและลูกผสมด้วยแฮตอาร์เอพีดี, Thai J. Sci. Technol. 7: 418-426.
สุรีพร เกตุงาม, 2546, เครื่องหมายดีเอ็นเอในงานปรับปรุงพันธุ์พืช, ว.วิชาการ ม.อบ. มหาวิทยา ลัยอุบลราชธานี 5(2): 37-59.
Bello-Bello, J.J., Iglesias-Andreu, L.G., Aviles-vinas, S.A., Gomez-Uc, E., Canto-Flick, A. and Santana-Buzzy, N., 2014, Somaclonal variation in Habanero pepper (Capsicum chinense Jacq.) as assessed ISSR molecular markers, Hort. Sci. 49: 481-485.
Doyle, J.J. and Doyle, J.L., 1987, A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue, Phytochem. Bull. 19: 11-15.
Hu J.B., Li Q. and Li J., 2011, ISSR analysis of somaclonal variation in callus-derived plants of Amorphophallus rivieri Durieu, Acta Biol. Cracov. Bot. 53/1: 120-124.
Jayanthi, M., Gupta, R., Mandal, P.K. and Singh, K.B.M., 2018, Analysis of somaclonal variation using molecular markers in in vitro regenerated Chrysanthemum cv. Pusa centenary, Int. J. Curr. Microbiol. Appl. Sci. 7: 1642-1655.
Lu, Y., Zhang, X., Pu, J., Qi, Y. and Xie, Y., 2011, Molecular assessment of genetic identity and genetic stability in banana cultivars (Musa spp.) from China using ISSR markers, Aust. J. Crop Sci. 1: 25-31.
Opara, U.L., Jacobson, D. and Al-Saady, N.A., 2010, Analysis of genetic diversity in banana cultivars (Musa cvs.) from the South of Oman using AFLP markers and classification by phylogenetic, hierarchical clustering and principal component analyses, J. Zhejiang Univ-Sci. (Biomed. & Biotech.), 11: 332-341.
Pinar, H., Unlu, M., Bircan, M., Baysal, F., Tuna, G.S., Tuna, M. and Ercisli, S, 2015, Genetic characterization of banana clones grown in Turkey based on nuclear DNA content and SRAP markers, J. Appl. Bot. Food Qual. 88: 222-227.
Rahman, M.H. and Rajora, O.P., 2001, Microsatellite DNA somaclonal variation in micropropagated trembling aspen (Populus tremuloides), Plant Cell Rep. 20: 531-536.
Rohlf, F.J., 2002, NTSYSpc Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Applied Biostatistics, Inc., New York.
Sambrook, J., Fritsch, E.F. and Maniatis, T., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York.
Tarafdar, S., Gupta, K.S., Banerjee, S. and Shailja, D., 2017, Identification of SSR and ISSR markers associated to off-type somaclonal variants in micro-propagated banana, J. Biotech. Biochem, 3(2): 18-22.
