การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของพืชครามสกุล Indigofera ด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน matK

Main Article Content

ศุภรัตน์ บัวบาน
นิรมล ศากยวงศ์
ธีระชัย ธนานันต์
นฤมล ธนานันต์

บทคัดย่อ

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อหาลำดับนิวคลีโอไทด์ตำแหน่งจำเพาะของยีน matK เพื่อระบุพันธุ์พืชครามสกุล Indigofera จำนวน 15 ตัวอย่าง ซึ่งเป็นวิธีที่มีความรวดเร็ว ประหยัดเวลา และค่าใช้จ่าย เมื่อเปรียบเทียบข้อมูลกับลำดับนิวคลีโอไทด์ในฐานข้อมูล NCBI พบว่าสามารถระบุพืชครามเป็น 4 ชนิด คือ Indigofera tinctoria, Indigofera tinctoria var. arrecta, Indigofera caroliniana และ Indigofera suffruticosa แต่ไม่สามารถระบุตัวอย่างที่ 13 เมื่อวิเคราะห์ด้วยโปรแกรม ClustalW และสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมด้วยวิธี UPGMA โดยใช้โปรแกรม MEGA รุ่น X พบว่าแบ่งกลุ่มพืชครามสกุล Indigofera เป็น 2 กลุ่ม มีค่าความแตกต่างทางพันธุกรรม 0.113-0.561 ดังนั้นจึงควรใช้ลำดับนิวคลีโอไทด์ตำแหน่งจำเพาะของยีนอื่นมาจำแนกร่วมด้วย เพื่อให้มีประสิทธิภาพมากขึ้น อย่างไรก็ตาม ข้อมูลที่ได้จากงานวิจัยนี้สามารถนำไปประยุกต์ใช้ในการอนุรักษ์พันธุ์และปรับปรุงพันธุ์พืชคราม

Article Details

รูปแบบการอ้างอิง
บัวบาน ศ., ศากยวงศ์ น., ธนานันต์ ธ., & ธนานันต์ น. (2020). การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของพืชครามสกุล Indigofera ด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน matK. Thai Journal of Science and Technology, 9(4), 577–586. https://doi.org/10.14456/tjst.2020.60
ประเภทบทความ
วิทยาศาสตร์ชีวภาพ
ประวัติผู้แต่ง

ศุภรัตน์ บัวบาน

สาขาวิชาเทคโนโลยีชีวภาพ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ศูนย์รังสิต ตำบลคลองหนึ่ง อำเภอคลองหลวง จังหวัดปทุมธานี 12120

นิรมล ศากยวงศ์

สาขาวิชาเทคโนโลยีชีวภาพ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ศูนย์รังสิต ตำบลคลองหนึ่ง อำเภอคลองหลวง จังหวัดปทุมธานี 12120

ธีระชัย ธนานันต์

สาขาวิชาเทคโนโลยีชีวภาพ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ศูนย์รังสิต ตำบลคลองหนึ่ง อำเภอคลองหลวง จังหวัดปทุมธานี 12120

นฤมล ธนานันต์

คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยราชภัฏวไลยอลงกรณ์ ในพระบรมราชูปถัมภ์ ตำบลคลองหนึ่ง อำเภอคลองหลวง จังหวัดปทุมธานี 13180

เอกสารอ้างอิง

จุฑามาศ เจียมเจือจันทร์, ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์, 2561, การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการระบุพันธุ์กล้วยไม้สกุลก้านก่อด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน matK และ rbcL, ว.วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 26(1): 91-102.

ณัฐพงษ์ ศรีสมุทร, กิตติศักดิ์ เฉนียง และอลงกลด แทนออมทอง, 2556, การระบุสายพันธุ์หน้าวัวโดยใช้ดีเอ็นเอบาร์โค้ด, แก่นเกษตร 44(1): 838-843.

ดนัย ชาทิพฮด, 2558, ผ้าย้อมคราม : การทำวัฒนธรรมให้กลายเป็นสินค้าในกระแสโลกาภิวัตน์, ว.ไทยศึกษา 10(2): 87-153.

ทีปกา มีเสงี่ยม, ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์, 2561, การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการระบุพันธุ์กล้วยไม้รองเท้านารีกลุ่มใบลายโดยใช้ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน rbcL และ matK, ว.วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 26(1): 103-112.

ธีระชัย ธนานันต์, ศุภรัตน์ บัวบาน และนฤมล ธนานันต์, 2563, การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของพืชครามสกุล Indigofera ด้วยเทคนิคไอเอสเอสอาร์, Thai J. Sci. Technol. 9(3): 388-396.

นฤมล ธนานันต์, เกียรติชัย แซ่ไต่ และธีระชัย ธนานันต์, 2557, การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สิงโตกลอกตา หมู่สิงโตสยาม โดยใช้ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนจำเพาะ, ว.วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 22(4): 523-530.

นฤมล ธนานันต์, ฐิตาพร มณีเนตร, ภัทรพร คุ้มภัย และธีระชัย ธนานันต์, 2561, การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการจำแนกกล้วยไม้สกุลหวาย หมู่แคลิสตา ด้วยลําดับนิวคลีโอไทด์ของยีน rpoC1 และ matK, Thai J. Sci. Technol. 7(1): 81-88.

นฤมล ธนานันต์, วิภาวรรณ ประสิทธิ์ และธีระชัย ธนานันต์, 2555, การจำแนกข้าวพันธุ์ขาวดอกมะลิ 105 และพันธุ์ปรับปรุงจากพันธุ์ขาวดอกมะลิ 105 ด้วยเทคนิคแฮตอาร์พีดี, Thai J. Sci. Technol. 1(3): 169-179.

นฤมล ธนานันต์, ศุภรัตน์ บัวบาน และธีระชัย ธนานันต์, 2563, การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของพืชครามสกุล Indigofera โดยใช้เทคนิคสก๊อต, Thai J. Sci. Technol. 9(2): 333-341.

พรประภา ศิริเทพทวี, ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์, 2561, การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการระบุชนิดกล้วยไม้รองเท้านารีกลุ่มใบสีเขียวด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน rbcL และ matK, ว.วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 26(1): 113-120.

ศุภรัตน์ บัวบาน, ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์, 2563, การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของพืชครามสกุล Indigofera ด้วยเทคนิคแฮตอาร์เอพีดี, Thai J. Sci. Technol. 9(3): 378-387.

อังคณา เทียนกล่ำ, 2556, ประสิทธิภาพของน้ำหมักใบครามต่อการเติบโต ผลผลิต และการควบคุมแมลงศัตรูในมะเขือเปราะ, J. Agric. 3: 249-256.

Doyle, J.J. and Doyle, J.L. 1987, A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh Leaf Tissue, Phytochem. Bull. 19: 11-15.

Mattapha, S. and Chantaranothai, P., 2012, The genus Indigofera L. (Legumimosae) in Thailand, Trop. Nat. Hist. 12: 207-244.

Selvaraj D., Sarma R.K. and Sathishkumar R., 2008, Phylogenetic analysis of chloroplast matK gene from zingiberaceae for plant DNA barcoding, J. Biomed. Inform. 3: 24-27.