การศึกษาพันธุกรรมของตาลโตนด (Borassus flabellifer) ในภาคกลางของประเทศไทยโดยใช้เครื่องหมายเอแอฟแอลพี
Article Sidebar
เผยแพร่แล้ว:
ก.พ. 16, 2018
คำสำคัญ:
ตาลโตนด เครื่องหมายเอแอฟแอลพี ความหลากหลาย แผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม
Main Article Content
บทคัดย่อ
บทคัดย่อ
ตาลโตนดเป็นพืชที่มีความสำคัญระดับท้องถิ่นของประเทศไทย สามารถเจริญได้ในทุกสภาพภูมิประเทศ ตาลโตนดเป็นพืชที่อายุยืนและให้ผลผลิตครั้งแรกเมื่ออายุ 12-15 ปี และมีลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่คล้ายคลึงกันมากระหว่างต้นเพศผู้และเพศเมีย ดังนั้นจึงไม่สามารถแยกเพศด้วยวิธีทางสัณฐานวิทยาได้ เครื่องหมายดีเอ็นเอจึงเข้ามามีบทบาทสำคัญในการแบ่งกลุ่มและประเมินความหลากหลายของสายพันธุ์ ปัจจุบันมีรายงานการศึกษาความหลากหลายของตาลโตนดในประเทศไทยจากเครื่องหมายดีเอ็นเอเพียงแค่ 2 เครื่องหมาย ได้แก่ เครื่องหมายอาร์เอพีดีและไอเอสเอสอาร์ ดังนั้นงานวิจัยนี้จึงมีการนำเครื่องหมายเอเอฟแอลพีมาศึกษาความหลากหลายของตาลโตนด จำนวน 150 ต้น ที่กระจายอยู่ใน 14 จังหวัด ภาคกลาง พบว่ามี 12 เครื่องหมาย ให้แถบดีเอ็นเอ จำนวน 66 แถบ ที่แสดงความแตกต่างระหว่างตาลโตนดในภาคกลาง จากการประเมินประสิทธิภาพของเครื่องหมายพบว่ามีค่าความหลากหลายที่ค่อนข้างต่ำ และเมื่อสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมด้วยวิธี UPGMA และ PCA พบว่า ตาลโตนดในภาคกลางมีฐานพันธุกรรมที่แคบ มีค่าดัชนีความเหมือนกันทางพันธุกรรมสูง (>0.8) สอดคล้องกับการวิจัยก่อนหน้านี้ในการใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอศึกษาตาลโตนดจากจังหวัดสงขลาและเพชรบุรีที่พบว่ามีฐานพันธุกรรมที่แคบเช่นเดียวกัน
คำสำคัญ : ตาลโตนด; เครื่องหมายเอแอฟแอลพี; ความหลากหลาย; แผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม
Article Details
ประเภทบทความ
Biological Sciences
เอกสารอ้างอิง
[1] Dej-adisai, S., Pitakbut, T. and Wattanapiromsakul, C., 2017, Alpha-glucosidase inhibitory activity and phytochemical investigation of Borassus flabellifer Linn, Afr. J. Pharm. Pharmacol. 11: 45-52.
[2] George, J. and Karun, A., 2011, Marker assisted detection of seed sex ratio in palmyrah palm (Borassus flabellifer L.), Curr. Sci. (Bangalore) 100: 922-925.
[3] Morton, J.F., 1988; Notes on distribution, propagation, and products of Borassus Palms (Arecaceae), Econ. Bot. 42: 420-41.
[4] Saputro, A.D., van de Walle, D., Aidoo, R. P., Mensah, M.A., Delbaere, C., De Clercq, N, van Durme, J. and Dewettinck, K., 2017, Quality attributes of dark chocolates formulated with palm sap-based sugar as nutritious and natural alternative sweetener, Eur. Food Res. Technol. 243: 177-191.
[5] George, J., Karun, A., Manimekalai, R, Rajesh, M. and Remya, P., 2007, Identification of RAPD markers linked to sex determination in palmyrah (Borassus flabellifer L.), Curr. Sci. 93: 1075-1077.
[6] Ruttajorn, K., 2006, Sex Identifying in Palmyra Palm (Borassus fiabellifer L.) Using Botanical Characteristics and Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) Marker, M.S. Thesis, Thaksin University, Songkhla, 74 p.
[7] George, J., Venkataramana, K., Nainar, P., Rajesh, M. and Karun, A., 2016, Evaluation of molecular diversity of ex situ conserved germplasm of palmyrah (Borassus flabellifer L.) accessions using RAPD markers, J. Plant. Crops 44: 96-102.
[8] Promkaew, R., 2006, Study on Genetic Relationship in Palmyra Palm (Borassus flabellifer Linn.) Populations by RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) and ISSR (Inter Simple Sequence), M.S. Thesis, Prince of Songkla University, Songkla, 95 p.
[9] Vos, P., Hogers, R., Bleeker, M., Reijans, M., Lee, Tvd., Hornes, M., Friters, A., Pot, J., Paleman, J. and Kuiper, M., 1995; AFLP: A new technique for DNA fingerprinting, Nucl. Acids Res. 23: 4407-4414.
[10] Gawel, N.L.A. and Jarnet, R.L., 1991, Modified CTAB DNA extraction procedure of Musa and Lpomoea, Plant Mol. Bio. Rep. 9: 262-266.
[11] Benbouza, H., Jacquemin, J.M., Baudoin, J.P. and Mergeai, G., 2006, Optimization of a reliable, fast, cheap and sensitive silver staining method to detect SSR markers in polyacrylamide gels, Biotechnol. Agron. Soc. Environ. 10: 77-81.
[12] Kimura, M. and Crow, J.F., 1964, The number of alleles that can be maintained in a finite population, Genetics 49: 725-738.
[13] Nei, M., 1973, Analysis of gene diversity in subdivided populations, Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 70: 3321-3323.
[14] Stebbins, G.L. and Lewontin, R., 1972, Comparative evolution at the levels of molecules, organisms and populations, Proceedings of the Sixth Berkeley Symposium on Mathematical Statistics and Probability, Berkeley and Los Angeles, 5: 23-42.
[15] Yeh, F.C., Yang, R.C. and Boyle, T., 1999, POPGENE version 1.32: Microsoft Windows – Based Freeware for Population Genetic Analysis, Quick User Guide, Center for International Forestry Research, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada.
[16] Lynch, M. and Walsh, B., 1998, Genetics and Analysis of Quantitative Traits, Sinauer Associates Inc., Sunderland.
[17] Rohlf, J.F., 1998, Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Exeter Software, Setauket, New York.
[18] Sneath, P.H.A. and Sokal, R.R., 1973, Numerical Taxonomy, The Principles and Practice of Numerical Classification, W.H. Freeman, San Francisco.
[19] Staub, J.E., Box, J., Meglic, V., Horejsi, T.F. and McCreight, J.D., 1997, Comparison of isozyme and random amplified polymorphic DNA data for determining intraspecific variation in Cucumis, Genet. Res. Crop. Evol. 44: 257-269.
[20] Darroch, J.N. and Mosimann, J.E., 1985, Canonical and Principal Components of Shape, Biometrika, 241-252 p.
[21] Baraket, G., Chatti, K., Saddoud, O., Mars, M., Marrakchi, M., Trifi, M. and Salhi-Hannachi, A., 2009. Genetic analysis of Tunisian fig (Ficus carica L.) cultivars using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers, Sci. Hort. 120: 487-492.
[22] Perera, L., Russell, J.R., Provan, J., McNicol, J.W. and Powell, W., 1998, Evaluating genetic relationships between indigenous coconut (Cocos nucifera L.) accessions from Sri Lanka by AFLP profiling, Theor. Appl. Genet. 96: 545-550.
[23] Purba, A.R., Noyer, J.L., Baudouin, L., Perrier, X., Hamon, S. and Lagoda, P.J.L., 2000, A new aspect of genetic diversity of Indonesian oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) revealed by isoenzyme and AFLP markers and its consequences for breeding, Theor. Appl. Genet. 101: 956-961.
[24] Ponnuswami, V., 2010, Genetic diversity in palmyrah genotypes using morphological and molecular markers, Elec. J. Plant Breed. 1: 556-567.
[25] Raju, D.C. and Reji, J.V., 2015, Genetic diversity analysis in palmyra palms using RAPD markers, Int. J. Pharm. Bio. Sci. 6: 244-250.
[2] George, J. and Karun, A., 2011, Marker assisted detection of seed sex ratio in palmyrah palm (Borassus flabellifer L.), Curr. Sci. (Bangalore) 100: 922-925.
[3] Morton, J.F., 1988; Notes on distribution, propagation, and products of Borassus Palms (Arecaceae), Econ. Bot. 42: 420-41.
[4] Saputro, A.D., van de Walle, D., Aidoo, R. P., Mensah, M.A., Delbaere, C., De Clercq, N, van Durme, J. and Dewettinck, K., 2017, Quality attributes of dark chocolates formulated with palm sap-based sugar as nutritious and natural alternative sweetener, Eur. Food Res. Technol. 243: 177-191.
[5] George, J., Karun, A., Manimekalai, R, Rajesh, M. and Remya, P., 2007, Identification of RAPD markers linked to sex determination in palmyrah (Borassus flabellifer L.), Curr. Sci. 93: 1075-1077.
[6] Ruttajorn, K., 2006, Sex Identifying in Palmyra Palm (Borassus fiabellifer L.) Using Botanical Characteristics and Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) Marker, M.S. Thesis, Thaksin University, Songkhla, 74 p.
[7] George, J., Venkataramana, K., Nainar, P., Rajesh, M. and Karun, A., 2016, Evaluation of molecular diversity of ex situ conserved germplasm of palmyrah (Borassus flabellifer L.) accessions using RAPD markers, J. Plant. Crops 44: 96-102.
[8] Promkaew, R., 2006, Study on Genetic Relationship in Palmyra Palm (Borassus flabellifer Linn.) Populations by RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) and ISSR (Inter Simple Sequence), M.S. Thesis, Prince of Songkla University, Songkla, 95 p.
[9] Vos, P., Hogers, R., Bleeker, M., Reijans, M., Lee, Tvd., Hornes, M., Friters, A., Pot, J., Paleman, J. and Kuiper, M., 1995; AFLP: A new technique for DNA fingerprinting, Nucl. Acids Res. 23: 4407-4414.
[10] Gawel, N.L.A. and Jarnet, R.L., 1991, Modified CTAB DNA extraction procedure of Musa and Lpomoea, Plant Mol. Bio. Rep. 9: 262-266.
[11] Benbouza, H., Jacquemin, J.M., Baudoin, J.P. and Mergeai, G., 2006, Optimization of a reliable, fast, cheap and sensitive silver staining method to detect SSR markers in polyacrylamide gels, Biotechnol. Agron. Soc. Environ. 10: 77-81.
[12] Kimura, M. and Crow, J.F., 1964, The number of alleles that can be maintained in a finite population, Genetics 49: 725-738.
[13] Nei, M., 1973, Analysis of gene diversity in subdivided populations, Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 70: 3321-3323.
[14] Stebbins, G.L. and Lewontin, R., 1972, Comparative evolution at the levels of molecules, organisms and populations, Proceedings of the Sixth Berkeley Symposium on Mathematical Statistics and Probability, Berkeley and Los Angeles, 5: 23-42.
[15] Yeh, F.C., Yang, R.C. and Boyle, T., 1999, POPGENE version 1.32: Microsoft Windows – Based Freeware for Population Genetic Analysis, Quick User Guide, Center for International Forestry Research, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada.
[16] Lynch, M. and Walsh, B., 1998, Genetics and Analysis of Quantitative Traits, Sinauer Associates Inc., Sunderland.
[17] Rohlf, J.F., 1998, Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Exeter Software, Setauket, New York.
[18] Sneath, P.H.A. and Sokal, R.R., 1973, Numerical Taxonomy, The Principles and Practice of Numerical Classification, W.H. Freeman, San Francisco.
[19] Staub, J.E., Box, J., Meglic, V., Horejsi, T.F. and McCreight, J.D., 1997, Comparison of isozyme and random amplified polymorphic DNA data for determining intraspecific variation in Cucumis, Genet. Res. Crop. Evol. 44: 257-269.
[20] Darroch, J.N. and Mosimann, J.E., 1985, Canonical and Principal Components of Shape, Biometrika, 241-252 p.
[21] Baraket, G., Chatti, K., Saddoud, O., Mars, M., Marrakchi, M., Trifi, M. and Salhi-Hannachi, A., 2009. Genetic analysis of Tunisian fig (Ficus carica L.) cultivars using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers, Sci. Hort. 120: 487-492.
[22] Perera, L., Russell, J.R., Provan, J., McNicol, J.W. and Powell, W., 1998, Evaluating genetic relationships between indigenous coconut (Cocos nucifera L.) accessions from Sri Lanka by AFLP profiling, Theor. Appl. Genet. 96: 545-550.
[23] Purba, A.R., Noyer, J.L., Baudouin, L., Perrier, X., Hamon, S. and Lagoda, P.J.L., 2000, A new aspect of genetic diversity of Indonesian oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) revealed by isoenzyme and AFLP markers and its consequences for breeding, Theor. Appl. Genet. 101: 956-961.
[24] Ponnuswami, V., 2010, Genetic diversity in palmyrah genotypes using morphological and molecular markers, Elec. J. Plant Breed. 1: 556-567.
[25] Raju, D.C. and Reji, J.V., 2015, Genetic diversity analysis in palmyra palms using RAPD markers, Int. J. Pharm. Bio. Sci. 6: 244-250.
