ความหลากหลายและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของยีสต์ทนแอลกอฮอล์จากลูกแป้งเหล้าในจังหวัดเชียงใหม่
Article Sidebar
Main Article Content
บทคัดย่อ
บทคัดย่อ
การศึกษาความหลากหลายและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของยีสต์ทนแอลกอฮอล์ที่คัดแยกได้จากลูกแป้งเหล้าในจังหวัดเชียงใหม่ จำนวน 35 ไอโซเลท จาก 9 แหล่ง โดยใช้เทคนิค polymerase chain reaction (PCR) ที่บริเวณ internal transcribed spacer (ITS) 1-5.8S rDNA-ITS2 ของ ribosomal DNA ด้วยไพรเมอร์ ITS1 และ ITS4 เมื่อนำไปวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์และเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลเพื่อจำแนกสายพันธุ์ พบยีสต์ 3 ชนิด คือ Saccharomyces cerevisiae, Pichia kudriavzevii และ Candida glabrata จำนวน 21, 11 และ 3 ไอโซเลท ตามลำดับ ซึ่งเมื่อนำลำดับนิวคลีโอไทด์มาสร้าง phylogenetic tree ด้วยวิธี neighbour-joining โดยใช้ค่า bootstrap เท่ากับ 2,000 จากโปรแกรม MEGA 7.0.18 สามารถจัดกลุ่มของ S. cerevisiae และ P. kudriavzevii ได้ 3 และ 2 กลุ่ม ตามลำดับ แต่ไม่สามารถสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของ C. glabrata แบบมีค่า bootstrap ได้ และพบว่ายีสต์จากลูกแป้งเหล้าของแต่ละแหล่งผลิตที่อยู่ต่างอำเภอมีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่ใกล้ชิดกัน แต่มีตัวอย่าง C. glabrata จำนวน 3 ไอโซเลท จากอำเภอสันทรายที่มีความหลากหลายทางพันธุกรรมสูง
คำสำคัญ : ยีสต์ทนแอลกอฮอล์; ลูกแป้งเหล้า; ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม; ITS; เครื่องหมายดีเอ็นเอ
Article Details
เอกสารอ้างอิง
[2] Schuller, D., Valero, E., Dequin, S. and Casal, M., 2004, Survey of molecular methods for the typing of wine yeast strains, FEMS Microbiol. Lett. 231: 19-26.
[3] Richard, G., Kerrest, A. and Dujon, B., 2008, Comparative genomics and molecular dynamics of DNA repeats in eukaryotes, Microbiol. Mol. Biol. Rev. 72: 686-727.
[4] Kurtzman, C.P., 2015, Identification of food and beverage spoilage yeasts from DNA sequence analyses, Int. J. Food Microbiol. 213: 71-88.
[5] Ghindea, R., Csutak, O., Stoica, I., Ionescu, R., Soare, S., Pelinescu, D., Nohit, A.M., Creangă, O., Vassu, T., 2004, Molecular taxonomy techniques used for yeast identification, Bacteriol Virusol Parazitol Epidemiol 49: 105-113.
[6] White, T.J., Bruns, T., Lee, S. and Taylor, J.W., 1990, Amplification and Direct Sequencing of Fungal Ribosomal RNA Genes for Phylogenetics, pp. 315-322, In Innis, M.A., Gelfand, D.H., Sninsky, J.J. and White, T.J., PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Academic Press, Inc., New York.
[7] Ma, M. And Liu, Z.L., 2010, Mechanisms of ethanol tolerance in Saccharomyces cerevisiae, Appl. Microbiol. Biotechnol. 87: 829-845.
[8] Stanley, D., Bandara, A., Fraser, S., Chambers, P.J. and Stanley G.A., 2010, The ethanol stress response and ethanol tolerance of Saccharomyces cerevisiae. J. Appl. Microbiol. 109: 13-24.
[9] Zoecklein, B.W., Fugelsang, K.C., Gump, B.H. and Nury, F.S., 1995, Wine Analysis and Production, Kluwer Academic Publishers, New York.
[10] Jeyaram, K., Singh, W.M., Capece, A. and Romano, P., 2008, Molecular identification of yeast species associated with 'Hamei' – a traditional starter used for rice wine production in Manipur, India, Int. J. Food Microbiol. 124: 115-125.
[11] Aponte, M. and Blaiotta, G., 2016, Potential role of yeast strains isolated from grapes in the production of Taurasi DOCG, Front. Microbiol. 7: 809.
[12] Watanabe, I., Nakamura, T. and Shima, J., 2009, Characterization of a spontaneous flocculation mutant derived from Candida glabrata: A useful strain for bioethanol production, J. Biosci. Bioeng. 107: 379-382.
[13] Jeyaram, K., Tamang, J.P., Capece, A. and Romano, P., 2011, Geographical markers for Saccharomyces cerevisiae strains with similar technological origins domesticated for rice-based ethnic fermented beverages production in North East India, Antonie Van Leeuwenhoek 100: 569-578.
