การคัดแยกและจำแนกพลาสมิดดีเอ็นเอของแบคทีเรีย Lactobacillus spp. คัดแยกจากอาหารหมักท้องถิ่นภาคใต้
Article Sidebar
Main Article Content
บทคัดย่อ
จีนัส Lactobacillus เป็นหนึ่งในแบคทีเรียกรดแลคติกที่พบได้ในอาหารหมักหลากหลายชนิด ในปัจจุบันมีการนำแบคทีเรีย Lactobacillus มาใช้เป็นเซลล์เจ้าบ้านสำหรับผลิตโปรตีนลูกผสม (recombinant protein) เพื่อเป็น เอนติเจนที่สามารถกระตุ้นภูมิคุ้มกันต่อโรคต่าง ๆ พลาสมิดดีเอ็นเอของแบคทีเรีย Lactobacillus มีความจำเพาะแตกต่างของแบคเรียแกรมลบ จึงมีการค้นหาและพัฒนาพลาสมิดดีเอ็นเอชนิดใหม่ขึ้นมาใช้ ส่วนใหญ่พลาสมิดดีเอ็นเอเหล่านั้นมีการจดสิทธิบัตรคุ้มครองอยู่ในหลาย ๆ ประเทศ งานวิจัยนี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อคัดแยกและศึกษาความหลากหลายของพลาสมิดดีเอ็นเอของแบคทีเรีย Lactobacillus spp. คัดแยกได้จากอาหารหมักของท้องถิ่นภาคใต้ เช่น ปลาส้ม ปลาดุกร้า ปลาแป้งแดง กุ้งส้ม และแหนมเห็ด เป็นต้น จากทั้งหมด 89 ไอโซเลต สามารถสกัดแยกพลาสมิดดีเอ็นเอได้ 20 ไอโซเลต พบพลาสมิดดีเอ็นเอทั้งหมดจำนวน 34 พลาสมิด จากแบคทีเรีย L. plantarum, L. lactis, L. acidophilus และ L. casei มีจำนวนตั้งแต่ 1 ถึง 3 พลาสมิดต่อไอโซเลต ซึ่งมีขนาดตั้งแต่ 2.5 ถึง 15 กิโลเบส (kb) จากการจำแนกด้วยวิธี restriction fragment length polymorphism (RFLP) แสดงให้เห็นว่าพลาสมิดดีเอ็นเอทั้งหมดมีตำแหน่งจดจำของเอนไซม์ EcoRI HindIII และ BamHI ทั้งหมด 8 รูปแบบ
Article Details
References
Alpert, C. A., Crutz–Le Coq, A. M., Malleret, C., & Zagorec, M. (2003). Characterization of a theta–type plasmid from Lactobacillus sakei: a potential basis for low–copy–number vectors in Lactobacilli. Applied Environmental Microbiology, 69(9), 5574–5584.
Association of Official Analytical Chemists (AOAC). (2005). FDA bacteriological analytical manual. 18th ed. Washington DC.
Asteri, I. A., Papadimitriou, K., Boutou, E., Anastasiou, R., Pot, B., Vorgias, C. E., & Tsakalidou, E. (2010). Characterization of pLAC1, a cryptic plasmid isolated from Lactobacillus acidipiscis and comparative analysis with its related plasmids. International Journal of Food Microbiology, 141(3), 222–228.
Auputinan, P., Tragoolpua, Y., Pruksakorn, S., & Thongwei, N. (2011). Profile of plasmids in Lactobacilli isolated from fermented food. Chiang Mai Journal of Science, 38(4), 648–652.
Chen, C., Ai, L. Z., Zhou, F., Ren, J., Sun, K., Zhang, H., Chen, W., & Guo, B. (2012). Complete nucleotide sequence of plasmid pST–III from Lactobacillus plantarum ST–III. Plasmid, 67(3), 236–244.
Cho, G. S., Huch, M., Mathara, J. M., Van Belkum, M. J., & Franz, C. M. A. P. (2013). Characterization of pMRI 5.2, a rolling–circle–type plasmid from Lactobacillus plantarum BFE 5092 which harbours two different replication initiation genes. Plasmid, 69(2), 160–171.
Crowley, S., Bottacini, F., Mahony, J., & Van Sinderen, D. (2013). Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum strain 16, a broad–spectrum antifungal–producing lactic acid bacterium. Genome Announcement, 1(4), e00533–13.
Eguchi, T., Doi, K., Nishiyama, K., Ohmomo, S., & Ogata, S. (2000). Characterization of a phage resistance plasmid, pLKS, of silage –making Lactobacillus plantarum NGRI0101. Bioscience Biotechnology and Biochemistry, 64(4), 751–756.
Feld, L., Bielak, E., Hammer, K., & Wilcks, A. (2009). Characterization of a small erythromycin resistance plasmid pLFE1 from the food–isolate Lactobacillus plantarum M345. Plasmid, 61(3), 159–170.
Gao, Y., Lu, Y., Teng, K. L., Chen, M. L., Zheng, H. J., Zhu, Y. Q., & Zhong, J. (2011). Complete genome sequence of Lactococcus lactis subsp. Lactis CV56, a probiotic strain isolated from the vaginas of healthy women. Journal of Bacteriology, 193(11), 2886–2887.
Gilbert, C., Robinson, K., Le Page, R. W., & Wells, J. M. (2000). Heterologous expression of an immunogenic pneumococcal type 3 capsular polysaccharide in Lactococcus lactis. Infection and Immunity, 68(6), 3251–3260.
Hua, X., Zhou, Y., Feng, Y., Duan, K., Ren, X., Sun, J., Gao, S., Wang, N., Li, J., Yang, J., Xia, D., Li, C., Guan, X., Chi, W., & Liu, M. (2021). Oral vaccine against IPNV based on antibiotic–free resistance recombinant Lactobacillus casei expressing CK6–VP2 fusion protein. Aquaculture, 535, 736425. doi: 10.1016/j.aquaculture.2021.736425
Jie, L., Zhang, H., Zhang, J., Jin, J., Lui, H., & Xie, Y. (2017). Characterization of four novel plasmids from Lactobacillus plantarum BM4. Jundishapur Journal of Microbiology, 10(11), e12894. doi: 10.5812/jjm.12894
Klaenhammer, T. R. (1984). A general method for plasmid isolation in lactobacilli. Current Microbiology, 10, 23–28. doi: 10.1007/BF01576043
Lane, D. J. (1991). 16S/23S rRNA sequencing. In E. Stackebrandt and M. Goodfellow (eds.), Nucleic acids techniques in bacterial systematics (pp. 115–175), New York: John Wiley & Sons.
Lin, C. F., Ho, J. L., & Chung, T. C. (2001). Characterization of the replication region of the Lactobacillus reuteri plasmid pTC82 potentially used in the construction of cloning vector. Bioscience Biotechnology and Biochemistry, 65(7), 1495–1503.
Liu, Y. Y., Yang, W. T., Shi, S. H., Li, Y. J., Zhao, L., Shi, C. W., Zhou, F. Y., Jiang, Y. L., Hu, J. T., Gu, W., Yang, G. L., & Wang, C. F. (2017). Immunogenicity of recombinant Lactobacillus plantarum NC8 expressing goose parvovirus VP2 gene in BALB/c mice. Journal of Veterinary Science, 18(2), 159–167.
Mills, S., McAuliffe, O. E., Coffey, A., Fitzgerald, G. F., & Ross, R. P. (2006). Plasmids of lactococci–genetic accessories or genetic necessities? FEMS Microbiology Reviews, 30(2), 243–273.
Moon, G. S., Lee, Y. D., & Kim, W. J. (2008). Screening of a novel lactobacilli replicon from plasmids of Lactobacillus reuteri KCTC 3678. Food Science and Biotechnology, 17(2), 438–441.
Nitipan, S., Sritrakul, T., Kunjantarachot, A., & Prapong, S. (2013). Identification of epitopes in Leptospira borgpetersenii leucine–rich repeat proteins. Infection, Genetics and Evolution, 14, 46–57.
Pan, Q., Zhang, L., Li, J., Chen, T., Chen, W., Wang, G., & Yin, J. (2011). Characterization of pLP18, a novel cryptic plasmid of Lactobacillus plantarum PC518 isolated from Chinese pickle. Plasmid, 65(3), 204–209.
Panya, M., Lulitanond, V., Tangphatsornruang, S., Namwat, W., Wannasutta, R., Suebwongsa, N., & Mayo, B. (2012). Sequencing and analysis of three plasmids from Lactobacillus casei TISTR1341 and development of plasmid–derived Escherichia coli–L. casei shuttle vectors. Applied Microbiology and Biotechnology, 93(1), 261–272.
Pedersen, K., Tiainen, T., & Larsen, J. L. (1996). Plasmid profiles, restriction fragment length polymorphisms and O–serotypes among Vibrio anguillarum isolates. Epidemiology and Infection, 117(3), 471–478.
Siezen, R. J., Bayjanov, J., Renckens, B., Wels, M., Van Hijum, S. A. F. T., Molenaar, D., & Van Hylckama Vlieg, J. E. T. (2010). Complete genome sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147, a plant–associated lactic acid bacterium. Journal of Bacteriology, 192(10), 2649–2650.
Siezen, R. J., & Van Hylckama Vlieg, J. E. T. (2011). Genomic diversity and versatility of Lactobacillus plantarum, a natural metabolic engineer. Microbial Cell Factories, 10(Suppl 1), S3. doi: 10.1186/1475–2859–10–S1–S3
Soomro, A. H., & Masud, T. (2007). Protein pattern and plasmid profile of lactic acid bacteria isolated from Dahi, a traditional fermented milk product of Pakistan. Food Technology and Biotechnology, 45(4), 447–453.
Sorvig, E., Mathiesen, G., Naterstad, K., Eijsink, V. G. H., & Axelsson, L. (2005). High–level, inducible gene expression in Lactobacillus sakei and Lactobacillus plantarum using versatile expression vectors. Microbiology (Reading), 151(Pt7), 2439–2449.
Suphatpahirapol, C., Nguyen, T. H., Tansiri, Y., Yingchutrakul, Y., Roytrakul, S., Nitipan, S., Wajjwalkul, W., Haltrich, D., Prapong, S., & Keawsompong, S. (2019). Expression of a leptospiral leucine–rich repeat protein using a food‑grade vector in Lactobacillus plantarum, as a strategy for vaccine delivery. 3 Biotech, 9, 324. doi: 10.1007/s13205–019–1856–8
Van Reenen, C. A., Chikindas, M. L., Van Zyl, W. H., & Dicks, L. M. T. (2003). Characterization and heterologous expression of a class IIa bacteriocin, plantaricin 423 from Lactobacillus plantarum 423, in Saccharomyces cerevisiae. International Journal of Food Microbiology, 81(1), 29–40.
Wang, Z., Yu, Q., Gao, J., & Yang, Q. (2012). Mucosal and systemic immune responses induced by recombinant Lactobacillus spp. expressing the hemagglutinin of the avian influenza virus H5N1. Clinical and Vaccine Immunology, 19(2), 174–179.
Weber, S., Horn, R., & Friedt, W. (1998). Isolation of a low–copy plasmid from agrobacterium using QIAprep technology. QIAGEN News No. 5 1998, 7.
Zang, Y., Tian, Y., Li, Y., Xue, R., Hu, L., Zhang, D., Sun, S., Wang, G., Chen, J., Lan, Z., Lin, S., & Jiang, S. (2020). Recombinant Lactobacillus acidophilus expressing S1 and S2 domains of porcine epidemic diarrhea virus could improve the humoral and mucosal immune levels in mice and sows inoculated orally. Veterinary microbiology, 248, 108827.
Zhang, Z., Man, C., Sun, L., Yang, X., Li, M., Zhang, W., & Jiang, Y. (2019). Short communication: Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum J26, a probiotic strain with immunomodulatory activity. Journal of Dairy Science, 102(12), 10838–10844. doi: 10.1016/j.vetmic.2020.108827
Zhu, J., Sun, J., Tang, Y., Xie, J., & Wei, D. (2020). Expression, characterization and structural profile of a heterodimeric ß–galactosidase from the novel strain Lactobacillus curieae M2011381. Process Biochemistry, 97, 87–95.