การระบุชนิดปูน้ำเค็มในบริเวณอ่าวยาง จังหวัดจันทบุรี โดยใช้เทคนิคดีเอ็นเอ บาร์โค้ดดิ้ง

Main Article Content

วิรังรอง กรินท์ธัญญกิจ
ชุตาภา คุณสุข
อรอนงค์ บุญมี

บทคัดย่อ

การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาการระบุชนิดปูน้ำเค็มบริเวณอ่าวยาง จังหวัดจันทบุรี โดยใช้เทคนิคดีเอ็นเอ บาร์โค้ดดิ้ง จากการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไซโตโครม ซี ออกซิเดส วัน (Cytochrome c oxidase I gene; COI) ในไมโตคอนเดรีย จากตัวอย่างปูน้ำเค็มทั้งหมด 57 ตัวอย่าง พบว่าสามารถเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอในส่วนของยีน COI โดยเทคนิค PCR และได้ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของปูน้ำเค็มทุกตัวอย่าง โดยมีความยาวของลำดับนิวคลีโอไทด์อยู่ประมาณ 700 คู่เบส เมื่อทำการเปรียบเทียบข้อมูลพันธุกรรมของตัวอย่างปูกับฐานข้อมูลพันธุกรรม GenBank พบว่า สามารถระบุชนิดของปูน้ำเค็ม ได้จำนวน 10 ชนิด จาก 5 วงศ์ โดยมีค่าความคล้ายคลึงทางพันธุกรรมสูงถึง 98.05%-100% โดยผลการระบุชนิดด้วยเทคนิคดีเอ็นเอ บาร์โค้ดดิ้ง พบว่า มีความสอดคล้องกับการระบุชนิดด้วยลักษณะทางสัณฐาน ผลการสร้างแผนภูมิต้นไม้แสดงความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการ (Phylogenetic tree) ด้วยวิธี Neighbor-joining พบว่าตัวอย่างปูทุกชนิดรวมกลุ่มกันในลักษณะ Monophyletic clade โดยสามารถแยกกลุ่มของปูแต่ละวงศ์ (Portunidae, Menippidae, Calappidea, Eriphiidae และ Xanthidae) และปูแต่ละชนิดตามสายวิวัฒนาการออกจากกันได้อย่างชัดเจน การศึกษานี้แสดงให้เห็นว่าเทคนิคดีเอ็นเอ บาร์โค้ดดิ้งมีความเหมาะสมและมีประสิทธิภาพในการยืนยันชนิดปูน้ำเค็มในบริเวณอ่าวยาง จังหวัดจันทบุรี ซึ่งถือเป็นตัวแทนของพื้นที่ชายฝั่งตะวันออกของประเทศไทย โดยเฉพาะอย่างยิ่งปูบางชนิดที่มีลักษณะทางสัณฐานคล้ายคลึงกันมาก หรือมีความแปรผันของลักษณะทางสัณฐานภายในชนิด ข้อมูลที่ได้สามารถใช้เป็นฐานข้อมูลอ้างอิงทางพันธุกรรมของปูน้ำเค็มในอนาคต สนับสนุนการศึกษาด้านอนุกรมวิธานเชิงโมเลกุล ใช้ตรวจสอบชนิดปูในงานอนุรักษ์ทรัพยากรทางทะเลและชายฝั่ง รวมถึงการตรวจสอบความถูกต้องของชนิดในผลิตภัณฑ์อาหารทะเล

Article Details

ประเภทบทความ
บทความวิจัย

เอกสารอ้างอิง

De Grave, S. and et al. 2009. A classification of living and fossil genera of decapod crustaceans. Raffles Bulletin of Zoology. Suppl. 21: 1-109.

UN Environmental Programme (UNEP). 2019. Marine and Coastal Ecosystems: Definitions and Concepts. https://www.unep.org. Accessed 15 October 2025.

Sangpaiboon, P., Kunsook, C. and Nakeiam, S. 2019. Biological Diversity of Some Marine Animals in Rocky Shore and Coral Reef at Ao Yang Bay, Chanthaburi Province. Chanthaburi: Rambhai Barni Rajabhat University. (in Thai)

Kunsook, C. and Karinthanyakit, W. 2021. Diversity, abundance and population structure of shore crabs (Decapoda: Brachyura; Menippidae, Eriphidae, Xanthidae, Oziidae) at Nom Sao Island, Chanthaburi Province, the Eastern Gulf of Thailand. ASEAN Journal of Scientific and Technological Reports. 23(3): 15-26.

Tan, S.H. and Ng, P.K.L. 2020. The Calappidae of Singapore: Taxonomy and DNA barcoding of box crabs. Raffles Bulletin of Zoology. 68: 1-32.

Hebert, P.D.N., Ratnasingham, S. and deWaard, J.R. 2003. Biological identifications through DNA barcodes. Proceedings of the Royal Society of London B Biological Sciences. 270: 313-321.

Radulovici, A.E., Archambault, P. and Dufresne, F. 2010. DNA barcodes for marine biodiversity: Moving fast forward? Diversity. 2(3): 450-472.

Amer, M.A. 2021. DNA barcoding of the spider crab Menaethius monoceros (Latreille, 1825) from the Red Sea, Egypt. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology. 19(1): 42.

Joesidawati, M.I. and et al. 2023. Utilizing DNA barcoding approach to study the diversity of the blue swimming crab from Tuban District, East Java, Indonesia. Biodiversitas Journal of Biological Diversity. 24(9): 4731-4737.

Sharifian, S. and et al. 2023. Molecular barcoding of the Persian Gulf mangrove associated brachyuran crabs. Arthropod Systematics & Phylogeny. 81: 889-896.

Suthamrit, W. and Thaewnott-Ngiw, B. 2021. DNA barcoding of mountain crabs (Potamidae) from Phetchabun Mountains of Thailand. Biochemistry & Molecular Biology Journal. 7(6): 1-8.

Shetty, A.S. and Shingadia, H.U. 2023. Application of DNA barcoding in fisheries: A review. Uttar Pradesh Journal of Zoology. 44(23): 351-371.

Fatemi, S. and et al. 2012. Diversity and distribution of true crabs (Brachyura) from intertidal rocky shores of Qeshm Island, Persian Gulf. International Journal of Marine Science and Engineering. 2(1): 115-120.

Thamrongnawasawat, T. and Wisetpongpan, P. 2007. Andaman Guide: Thai Marine Crabs. Bangkok: Baan Phra Arthit. (in Thai)

Radosta, O. 2018. Crab Database. https://www.crabdatabase.info/en/crabs. Accessed 19 July 2025.

Folmer, O. and et al. 1994. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Molecular Marine Biology and Biotechnology. 3(5): 294-299.

Tamura, K., Stecher, G. and Kumar, S. 2021. MEGA11: Molecular evolutionary genetics analysis version 11. Molecular Biology and Evolution. 38(7): 3022-3027.

Abbas, M.E. and et al. 2016. Genetic and morphological identification of some crabs from the Gulf of Suez, Northern Red Sea, Egypt. Egyptian Journal of Aquatic Research. 42(1): 319-329.

Panprommin, D. 2013. DNA barcoding of the fish and its application. Health Science, Science and Technology Reviews. 6(3): 174-181. (in Thai)

Wong, E.H.K. and Hanner, R.H. 2008. DNA barcoding detects market substitution in North American seafood. Food Research International. 41: 828-837.

Hazerli, D., Hopel, C.G. and Richter, S. 2022. New insights into the evolution of portunoid swimming crabs (Portunoidea, Heterotremata, Brachyura) and the brachyuran axial skeleton. Frontiers in Zoology. 19(1): 24.

Bravo, H. and et al. 2021. A DNA barcode libraly for mangrove gastropods and crabs of Hong Kong and the Greater Bay Area reveals an unexpected faunal diversity associated with the intertidal forests of Southern China. BMC Ecology and Evolution. 21(1): 1-15.

Hsu, J.W. and Shih, H.T. 2020. Diversity of Taiwanese brackish crabs genus Ptychognathus Stimpson, 1858 (Crustacea: Brachyura: Varunidae) based on DNA barcodes, with descriptions of two new species. Zoological Studies. 59: e59.

Tungkrerk-olan, N. 2017. Biodiversity and Seasonal Variation of Shrimps, Mantis Shrimps, and Crabs along the East Coast of Thailand for Conservation and Sustainable Uses of Community. Chonburi: Burapha University. (in Thai)

Lee, S.K. and et al. 2013. On the identity of the Indo-west Pacific littoral xanthoid crab, Leptodius exaratus (H. Milne Edwards, 1834). Raffles Bulletin of Zoology. 61(1): 189-204.

Karinthanyakit, W., Kunsook, C. and Damrongrojwatthana, P. 2019. DNA barcoding for species identification in rock crab (Decapoda: Eriphiidae, Menippidae, Oziidae and Xanthidae) at Nomsao Island, Chanthaburi Province. In: Proceedings of the 6th National and International Rajabhat Research Conference, 17-18 August 2020. Bangkok, Thailand. (in Thai)

Kunsook, C. and Wongsomsri, R. 2016. Biodiversity of crab in rocky shore ecosystem at Nomsoa Island, Chanthaburi Province. In: Proceedings of the 10th Rambhai Barni Rajabhat University Research Conference: Moving toward Research in the 21st Century, 19-20 December 2016. Chanthaburi, Thailand. (in Thai)

Amer, M.A., Naruse, T. and Reimer, J.D. 2023. Morphological and molecular investigation of some xanthid crabs from the Egyptian coast of the Red Sea. Thalassas: An International Journal of Marine Sciences. 39: 273–286.

Marco-Herrero, E., Cuesta, J.A. and Gonzalez-Gordillo, J.I. 2021. DNA barcoding allows identification of undescribed crab megalopas from the open sea. Scientific Reports. 11: 20573.