Genetic Diversity Study of Lotus in Phetchaburi Province using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
Article Sidebar
Main Article Content
Abstract
Genetic diversity study of 19 loti (Nelumbo nucifera Gaertn) samples collected from different districts in Petchaburi province using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. One hundred fifty-nine random primers were screened. Seventeen primers showed the highest difference band total of 40 loci. These loci were used in genetic relation analysis by presence band (1) and absent band (0). Genetic similarity was analyzed using Jaccard's coefficient function and performed by NTSYS-2.1m. Results from RAPD could classify 19 lotus samples into three groups. The similar genetic index ranged from 0.23-1.00. Significantly, four (No.7, No.8, No.11, and No.13) lotus samples were the highest similar index of 1. They have indicated that four lotuses are the same species, classified in Group I. However, lotus sample No.15 was the lowest similar index of 0.23, classified in Group III. Furthermore, two (No.2 and 3) lotus samples had a similar index of 0.67, classified in Group II.
Article Details
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
References
กนกวรรณ แดงสวัสดิ์ วิภา หงษ์ตระกูล นิตย์ศรี แสงเดือน และนิรันดร์ จันทวงศ์. 2551. การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของบัวหลวงโดยใช้เทคนิคอาร์เอพีดีและเอเอฟแอลพี. รายงานการประชุมวิชาการ ครั้งที่ 46, มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ 29 กุมภาพันธ์ – 1 มกราคม. มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ. น. 128-134.
ดาราลักษณ์ เยาวภาคย์โสภณ อ้อมหทัย ดีแท้ และวิมลรัตน์ พจน์ไตรทิพย์. 2561. การวิเคราะห์ลายพิมพ์ดีเอ็นเอของพืชสมุนไพรบางชนิดในป่าชุมชนบ้านหัวทุ่งเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าเชียงดาว จังหวัดเชียงใหม่โดยใช้เทคนิค RAPD. รายงานการประชุมวิชาการระดับชาติ ครั้งที่ 28, มหาวิทยาลัยทักษิณ 8-9 พฤษภาคม. มหาวิทยาลัยทักษิณ, จังหวัดสงขลา. น. 658-667.
นฤมล ธนานันต์ และธีระชัย ธนานันต์. 2550. การจำแนกพันธุ์บัวหลวงด้วยเครื่องหมายเอเอฟแอลพี. วารสารวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 15(3): 66-71.
นรารัตน์ วัฒนาพันธ์ และวุฒิชัย ศรีช่วย. 2561. การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของข้าวพื้นเมืองในจังหวัดชายแดนภาคใต้โดยใช้เทคนิค RAPD และเทคนิค HAT-RAPD. วารสารมหาวิทยาลัยนราธิวาสราชนครินทร์ 10(3): 206-217.
ปริมลาภ ชูเกียรติมั่น. 2555. การจำแนกจำพวกของบัวที่ปลูกเลี้ยงในประเทศไทย. ข่าวสารเกษตรศาสตร์ 57(3): 13-28.
พรเทพ เกียรติดำรงกุล สมชาติ หาญวงษา ยรรยง เฉลิมแสนและณวรรณพร จิรารัตน์. 2560. การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของต้นสบู่ดำในประเทศไทย โดยเทคนิค Random Amplified Polymorphic DNA. วารสารวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 25(3): 435-442.
ภาวิณี อินนาค. 2561. การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของลีลาวดีโดยใช้เทคนิค RAPD. รายงานการวิจัยการประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของลีลาวดีโดยใช้เทคนิค RAPD. มหาวิทยาลัยราชภัฏธนบุรี.
เยาวมาลย์ น้อยใหม่ รุจิรา เดชสูงเนิน และกฤษณะ กลัดแดง. 2564. เปรียบเทียบลักษณะทางพฤกษศาสตร์ของบัวหลวง 4 สายพันธุ์เพื่อการใช้ประโยชน์. วารสารวิจัยมหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลธัญบุรี 20(1): 53-67.
รัชนีกร พรสมบัติ กรกนก โมกไธสง กนิษฐา เทียบพระ ฉันทนา เคนศรี และวิไลลักษณ์ สุดวิไล. 2564. ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของสับปะรดไร่ม่วง อำเภอเมือง จังหวัดเลย ดว้ ยเครื่องหมายอารเ์ อพีดี. รายงานการประชุม วิชาการระดับชาติ ครั้งที่ 3, มหาวิทยาลัยราชภัฏเลย 26 มีนาคม. มหาวิทยาลัยราชภัฏเลย, จังหวัดเลย. น.161-16.
วริสรา แทนสง่า เปรมณัช ขุนปักษี ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์. 2556. การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของพืชในวงศ์จำปาด้วยเทคนิคแฮตอาร์เอพีดี. การประชุมวิชาการพันธุศาสตร์แห่งชาติครั้งที่ 18, 7 กรกฎาคม 2556 – 19 กรกฎาคม 2556, โรงแรมแอมบาสเดอร์ สุขุมวิท, กรุงเทพฯ. น. 210-213.
วรรณอุษา ผาคำ. 2563. สัณฐานวิทยาและความหลากหลายทางพันธุกรรมมะม่วงโดยใช้เทคนิค RAPD. วิทยานิพนธ์วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาพืชสวน, คณะผลิตกรรมการเกษตร, มหาวิทยาลัยแม่โจ้.
ศาสตรา ลาดปะละ พรอนันต์ บุญก่อน และหฤทัย ไทยสุชาติ. 2561. ความหลากหลายทางพันธุกรรมของข้าวเหนียวดำในจังหวัดลำปางโดยใช้เทคนิคRAPD. แก่นเกษตร 1(2561): 468-477.
ศรัณยา กิตติคุณไพศาล. 2566. บัวหลวงราชินี. ดอกบัวแสนสวย. แหล่งข้อมูล https://www.gotoknow.org/posts/450088 (30 มีนาคม 2566).
สุจิตรา จางตระกูล. 2551. การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมโดยใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอและไอโซเอนไซม์ยีนเพื่อการประเมินสถานภาพแหล่งทรัพยากรทางพันธุกรรมป่าไม้. แหล่งข้อมูล https://www.dnp.go.th/geneticsgroup/genetic (30 มีนาคม 2566).
สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล. 2552. เครื่องหมายดีเอ็นเอ: จากพื้นฐานสู่การประยุกต์. สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ.
Doyle, J.J. and J.L. Doyle. 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities fresh leaf tissue. Phytochemical bulletin 19(1): 11-15.
Hu, J., L. Pan, H. Liu, S. Wang, Z. Wu, W. Ke and Y. Ding. 2012. Comparative analysis of genetic diversity in sacred lotus (Nelumbo nucifera Gaertn.) using AFLP and SSR markers Molecular Biology Reports 39: 3637-3647. Available: https://doi.org/10.1007/s11033-011-1138-y.
Kubo, N., M. Hirrai, A. Kaneko, D. Tanaka and K. Kasumi. 2009. Development and characterization of simple sequence repeat (SSR) markers in the water lotus (Nelumbonucifera). Aquatic Botany 90(2): 191-194. Available: https://doi.org/10.1016/j.aquabot.2008.06.006.
Li, Y., F.L. Zhu, X.W. Zheng, M.L. Hu, C. Dong, Y. Diao, Y.W. Wang, K.Q. Xie and Z.L. Hu. 2020. Comparative population genomics reveals genetic divergence and selection in lotus, Nelumbo nucifera. BMC Genomics 21: 1-13. Available:https://doi.org/10.1186/s12864-019-6376-8.
Li, J.K. and S.Q. Haung. 2009. Effective pollinators of Asian sacred lotus (Nelumbo nucifera): Contemporary pollinators may not reflect the historical pollination syndrome. Annals of Botany 104(5): 845-851. Available: https://doi.org/10.1093/aob/mcp173.
Liu, X., J. Cheng, Z. Mei, C. Wei, M. A. Khan, J. Peng, and J. Fu. 2020. SCAR marker for identification and discrimination of specific medicinal Lycium chinense Miller from Lycium species from ramp-PCR RAPD fragments. Biotech10: 1-7. Available: https://doi.org/10.1007/s13205-020-02325-y.
Na, A. N., H.B. Guo and W.D. KE. 2009. Genetic variation in rhizome lotus (Nelumbo nucifera Gaertn. ssp. nucifera) germplasms from China assessed by RAPD markers Agricultural Sciences in China 8(1): 31-39. Available: https://doi.org/10.1016/S1671-2927(09)60006-7.
Tian, H., X. Chen, J. Xue, J. Wen, G. Mitchell and S. Zhou. 2008. Development and characterization of microsatellite loci for lotus (Nelumbo nucifera). Conservation Genetics 9: 1385-1388. Available: https://doi.org/10.1007/s10592-007-9503-z.
Yang, L., S. Fu, M.A. Khan, W. Zeng and J. Fu. 2013. Molecular cloning and development of RAPD-SCAR markers for Dimocarpus longan variety authentication. SpringerPlus 2: 1-8. Available: https://doi.org/10.1186/2193-1801-2-501.
