ไฟโลกรุ๊ปและรูปแบบความไวต่อยาต้านจุลชีพของ Escherichia coli ที่คัดแยกจากปัสสาวะของผู้ป่วยหญิงที่ติดเชื้อทางเดินปัสสาวะในโรงพยาบาลระดับตติยภูมิ เขตกรุงเทพมหานคร
Article Sidebar
Main Article Content
บทคัดย่อ
การติดเชื้อระบบทางเดินปัสสาวะจากเชื้อแบคทีเรีย Escherichia coli เป็นปัญหาสุขภาพที่พบได้ทั่วโลก โดยเฉพาะในเพศหญิง งานวิจัยนี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาและวิเคราะห์ความสัมพันธ์ระหว่างไฟโลกรุ๊ป (phylogroup) และความไวต่อยาต้านจุลชีพของ E. coli ที่แยกได้จากผู้ป่วยหญิงติดเชื้อระบบทางเดินปัสสาวะ ผู้วิจัยทำการศึกษา E. coli จำนวน 174 ไอโซเลทที่แยกจากตัวอย่างปัสสาวะของผู้ป่วยหญิงที่ติดเชื้อทางเดินปัสสาวะไม่ซ้ำรายที่เข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลระดับตติยภูมิในกรุงเทพมหานคร ระหว่างเดือนพฤศจิกายน 2566 - มกราคม 2567 โดยทดสอบความไวต่อยาต้านจุลชีพด้วยวิธี disk diffusion และจำแนก phylogroup ด้วย quadruplex PCR ผลการทดสอบความไวต่อยาต้านจุลชีพ พบว่า E. coli มีอัตราการดื้อต่อ ampicillin ciprofloxacin และ trimethoprim-sulfamethoxazole อยู่ที่ 88.5 63.8 และ 51.1 % ตามลำดับ นอกจากนี้ 36.8 % เป็นเชื้อที่สามารถสร้างเอนไซม์ Extended spectrum beta-lactamase (ESBLs) และ 61.3 % เป็นเชื้อดื้อยาต้านจุลชีพหลายขนาน สำหรับ phylogroup ที่พบมากที่สุดคือ B2 (61.5%) รองลงมาคือ D (9.2%) C (7.5%) B1 (7.5%) A (5.2%) F (4.0%) E (3.4%) และ unknown (1.7%) โดย phylogroup C มีอัตราการดื้อต่อยาต้านจุลชีพ เช่น ceftazidime, ciprofloxacin และ gentamicin สูงอย่างมีนัยสำคัญ (p<0.05) และเป็นกลุ่มเดียวที่พบการดื้อต่อ carbapenem ในขณะที่ phylogroup E มีอัตราการดื้อต่อยาหลายขนาน (MDR) สูงอย่างมีนัยสำคัญ การศึกษานี้แสดงให้เห็นว่า E. coli จากผู้ป่วยหญิงที่ติดเชื้อทางเดินปัสสาวะมีอัตราการดื้อต่อยาสูง สะท้อนถึงความจำเป็นในการเฝ้าระวังและควบคุมการแพร่กระจายของเชื้อดื้อยาดังกล่าว
Article Details
เอกสารอ้างอิง
Aguirre-Sánchez, J. R., Valdez-Torres, J. B., Del Campo, N. C., Martínez-Urtaza, J., DelCampo, N. C., Lee, B. G., Quiñones, B., & Chaidez-Quiroz, C. (2022). Phylogenetic group and virulence profile classification in Escherichia coli from distinct isolation sources in
Mexico. Infection, Genetics and Evolution, 106, Article 105380.
Ahumada-Santos, Y. P., Báez-Flores, M. E., Díaz-Camacho, S. P., Uribe-Beltrán, M. J., Eslava-Campos, C. A., Parra-Unda, J. R., & Delgado-Vargas, F. (2020). Association of phylogenetic distribution and presence of integrons with multidrug resistance in Escherichia coli clinical isolates from children with diarrhoea. Journal of Infection and Public Health, 13(5), 767–772.
Bailey, J. K., Pinyon, J. L., Anantham, S., & Hall, R. M. (2010). Distribution of human commensal Escherichia coli phylogenetic groups. Journal of Clinical Microbiology, 48(9), 3455–3456.
Beghain, J., Bridier-Nahmias, A., Le Nagard, H., Denamur, E., & Clermont, O. (2018). ClermonTyping: An easy-to-use and accurate in silico method for Escherichia genus strain phylotyping. Microbial Genomics, 4(7), e000192.
Clermont, O., Christenson, J. K., Denamur, E., & Gordon, D. M. (2013). The Clermont Escherichia coli phylo-typing method revisited: Improvement of specificity and detection of new phylo-groups. Environmental Microbiology Reports, 5(1), 58–65.
Clinical and Laboratory Standards Institute. (2020). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing (30th ed.). CLSI supplement M100.
Czajkowski, K., Broś-Konopielko, M., & Teliga-Czajkowska, J. (2021). Urinary tract infection in women. Przegląd Menopauzalny, 20(1), 40–47.
da Cruz Campos, A. C., Cavallo, F. M., Andrade, N. L., van Dijl, J. M., Couto, N., Zrimec, J., Lo Ten Foe, J. R., Rosa, A. C. P., Damasco, P. V., Friedrich, A. W., Chlebowicz-Flissikowska, M. A., & Rossen, J. W. A. (2019). Determining the virulence properties of Escherichia coli ST131 containing bacteriocin-encoding plasmids using short- and long-read sequencing and comparing them with those of other E. coli
lineages. Microorganisms, 7(11), 534.
Eriksson, I., Gustafson, Y., Fagerström, L., & Olofsson, B. (2010). Prevalence and factors associated with urinary tract infections (UTIs) in very old women. Archives of Gerontology and Geriatrics, 50(2), 132–135.
Flores-Mireles, A. L., Walker, J. N., Caparon, M., & Hultgren, S. J. (2015). Urinary tract infections: Epidemiology, mechanisms of infection and treatment options. Nature Reviews Microbiology, 13(5), 269–284.
Foxman, B., Barlow, R., D’Arcy, H., Gillespie, B., & Sobel, J. D. (2000). Urinary tract infection: Self-reported incidence and associated costs. Annals of Epidemiology, 10(8), 509–515.
Halaji, M., Fayyazi, A., Rajabnia, M., Zare, D., Pournajaf, A., & Ranjbar, R. (2022). Phylogenetic group distribution of uropathogenic Escherichia coli and related antimicrobial resistance pattern: A meta-analysis and systematic review. Frontiers in Cellular and Infection
Microbiology, 12, Article 790184.
Iranpour, D., Hassanpour, M., Ansari, H., Tajbakhsh, S., Khamisipour, G., & Najafi, A. (2015). Phylogenetic groups of Escherichia coli strains from patients with urinary tract infection in Iran based on the new Clermont phylotyping method. BioMed Research
International, 2015, Article 846219.
Johnson, J. R., & Stell, A. L. (2000). Extended virulence genotypes of Escherichia coli strains from patients with urosepsis in relation to phylogeny and host compromise. The Journal of Infectious Diseases, 181(1), 261–272.
Kardas, P., Devine, S., Golembesky, A., & Roberts, C. (2005). A systematic review and meta-analysis of misuse of antibiotic therapies in the community. International Journal of Antimicrobial Agents, 26(2), 106–113.
Ketkhao, P., Utrarachkij, F., Parikumsil, N., Poonchareon, K., Kerdsin, A., Ekchariyawat, P., Narongpun, P., Nakajima, C., Suzuki, Y., & Suthienkul, O. (2024). Phylogenetic diversity and virulence gene characteristics of Escherichia coli from pork and patients with
urinary tract infections in Thailand. PLoS ONE, 19(7), e0307544.
Le Gall, T., Clermont, O., Gouriou, S., Picard, B., Nassif, X., Denamur, E., & Tenaillon, O. (2007). Extraintestinal virulence is a coincidental by-product of commensalism in B2 phylogenetic group Escherichia coli strains. Molecular Biology and Evolution, 24(11), 2373–2384.
Lescat, M., Clermont, O., Woerther, P. L., Glodt, J., Dion, S., Skurnik, D., Djossou, F., Dupont, C., Perroz, G., Picard, B., Catzeflis, F., Andremont, A., & Denamur, E. (2012). Commensal Escherichia coli strains in Guiana reveal a high genetic diversity with hostdependent
population structure. Environmental Microbiology Reports, 5(1), 49–57.
Magiorakos, A. P., Srinivasan, A., Carey, R. B., Carmeli, Y., Falagas, M. E., Giske, C. G., Harbarth, S., Hindler, J. F., Kahlmeter, G., Olsson-Liljequist, B., Paterson, D. L., Rice, L. B., Stelling, J., Struelens, M. J., Vatopoulos, A., Weber, J. T., & Monnet, D. L. (2012). Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pan drug-resistant bacteria: An international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. Clinical Microbiology and Infection, 18(3), 268–281.
Medina, M., & Castillo-Pino, E. (2019). An introduction to the epidemiology and burden of urinary tract infections. Therapeutic Advances in Urology, 11, 1756287219832172.
National Antimicrobial Resistance Surveillance, Thailand. (2020). Antimicrobial resistance 2000–2020. http://narst.dmsc.moph.go.th/data/AMR%202000-2020–12M.pdf
Pootong, A., Mungkornkeaw, N., Norrapong, B., & Cowawintaweewat, S. (2018). Phylogenetic background, drug susceptibility and virulence factors of uropathogenic E. coli isolate in a tertiary university hospital in central Thailand. Tropical Biomedicine, 35(1), 195–204.
Singh, T., Das, S., Ramachandran, V. G., Wani, S., Shah, D., Maroof, K. A., & Sharma, A. (2017). Distribution of integrons and phylogenetic groups among enter opathogenic Escherichia coli isolates from children <5 years of age in Delhi, India. Frontiers in Microbiology,
, Article 561.
Sirijatuphat, R., Pongsuttiyakorn, S., Supapueng, O., Kiratisin, P., & Thamlikitkul, V. (2020). Implementation of global antimicrobial resistance surveillance system (GLASS) in patients with bacteriuria. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 20, 60–67.
Sora, V. M., Meroni, G., Martino, P. A., Soggiu, A., Bonizzi, L., & Zecconi, A. (2021). Extraintestinal pathogenic Escherichia coli: Virulence factors and antibiotic resistance. Pathogens, 10(11), 1355.
Tabasi, M., Asadi Karam, M. R., Habibi, M., Yekaninejad, M. S., & Bouzari, S. (2015). Phenotypic assays to determine virulence factors of uropathogenic Escherichia coli (UPEC) isolates and their correlation with antibiotic resistance pattern. Osong Public Health
and Research Perspectives, 6(4), 261–268.
Tewawong, N., Kowaboot, S., Pimainog, Y., Watanagul, N., Thongmee, T., & Poovorawan, Y. (2020). Distribution of phylogenetic groups, adhesin genes, biofilm formation, and antimicrobial resistance of uropathogenic Escherichia coli isolated from hospitalized patients in Thailand. PeerJ, 8, Article e10453.
Themphachanal, M., Kongpheng, S., Rattanachuay, P., Khianngam, S., Singkhamanan, K., & Sukhumungoon, P. (2015). Molecular characterization of virulence and antimicrobial susceptibility profiles of uropathogenic Escherichia coli from patients in a tertiary hospital, southern Thailand. The Southeast Asian Journal of Tropical Medicine and Public Health, 46(6), 1021–1030.
Wang, M., Jiang, M., Wang, Z., Chen, R., Zhuge, X., & Dai, J. (2021). Characterization of antimicrobial resistance in chicken-source phylogroup F Escherichia coli: Similar populations and resistance spectrums between E. coli recovered from chicken colibacillosis
tissues and retail raw meats in Eastern China. Poultry Science, 100(9), 101370.
