Genetic Diversity Analysis of Oil Palm at Southern Border, Thailand with Simple Sequence Repeat (SSR) Markers
Article Sidebar
Main Article Content
Abstract
Oil palm (Elaeis guineensis Jacq) is one of the most important economic crops in Thailand due to continuously increment in palm oil production, thus genetic diversity study of oil palm is crucial. In this study, we used Simple Sequence Repeats (SSR) markers technique to analyze genetic variation of oil palm population located in Yala and Narathiwat province. Genomic DNA of twenty young leaves sampled from the locations were extracted and amplified with 10 primers for specific SSR. Afterward, UPGMA dendrogram were constructed from SSR fragments by MEGA X program. Genetic variation within and between population was computed by Arlequin program. Calculated haplotype diversity and nucleotide diversity were 0.822 and 0.178, respectively. The results revealed a high genetic variation within oil palm samples collected from the same province. Genetic variation between oil palm groups (Yala and Narathiwat) was statistically significant as indicated by pairwise FST value and FST p-values. Out research suggested that microsatellite technique has good potential as a marker for genetic variation analysis in oil palm population.
Article Details
บทความ ข้อมูล เนื้อหา รูปภาพ ฯลฯ ที่ได้รับการเผยแพร่ในวารสารวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มรย. นี้ ถือเป็นลิขสิทธิ์ของวารสารวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มรย. หากบุคคลหรือหน่วยงานใดต้องการนำทั้งหมดหรือส่วนหนึ่งส่วนใดไปเผยแพร่ต่อหรือกระทำการใดๆ จะต้องได้รับอนุญาตเป็นลายลักษณ์อักษรจากวารสารวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มรย. ก่อนเท่านั้น
References
2. จุฑาพร แสงประจักษ์. (2555). การใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอสำหรับศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมและการปรับปรุงพันธุ์ข้าว. แก่นเกษตร 40, 299 – 308.
3. จุฑามาศ ศุภพันธ์. (2558). โครงสร้างพันธุศาสตร์ประชากรของปลากระบอก (Liza subviridis) ในอ่าวไทย และแนวทางใน การอนุรักษ์. วารสารวิจัยราชภัฏพระนคร สาขาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี, 10(1), 157 - 175.
4. นภาพร แก้วดวงดี และอนุชิรา แซ่ตั้ง. (2555). ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของสายพันธุ์มะพร้าว. กรุงเทพฯ : สาขาวิชา เทคโนโลยีชีวภาพ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยราชภัฏบ้านสมเด็จเจ้าพระยา.
5. รอกีเยาะห์ เจ๊ะหลง ปรียา แก้วอ่อน และจารุ นิคม. (2561). ศึกษาการประยุกต์ใช้เทคนิคเครื่องหมายดีเอ็นเอในการ วิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรปาล์มน้ำมัน ปลูกในพื้นที่ อำเภอหนองจิก จังหวัด ปัตตานี ใน การประชุมวิชาการระดับชาติด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีเครือข่ายภาคใต้ ครั้งที่ 3 ประจำปี 2561. วันที่ 13 พ.ค. 2561. ยะลา : มหาวิทยาลัยราชภัฏยะลา.
6. ฤทธิ์ วัฒนชัยยิ่งเจริญ. (2553). การวิเคราะห์ความหลากหลายของพืชโดยวิธีอณูชีววิทยา. (พิมพ์ครั้งที่ 1). กรุงเทพฯ : ศูนย์การพิมพ์สำนักสื่อและเทคโนโลยีการศึกษา มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ.
7. วีระเกียรติ ทรัพย์มี. (2558). โครงสร้างพันธุศาสตร์ประชากรและประวัติประชากรของปลาตะกรับ (Scatophagus argus) ในภาคใต้ของประเทศไทย. วารสารวิจัยราชภัฏพระนคร, 10(2), 38–56.
8. เศรษฐา ศิริพินทุ์ และมัลลิกา จินดาชิงห์. (2555). ความหลากหลายทางพันธุกรรมของพันธ์ถั่วเหลืองฝักสดโดยเทคนิคโมเลกุล เครื่องหมายเอสเอสอาร์.วารสารวิทยาศาสตร์เกษตร, 43(2)(พิเศษ), 525-528.
9. หทัยรัตน์ อุไรรงค์ อรรัตน์ วงศ์ศรี และนัยเนตร เจริญสันติ ทานากะ. (2560). การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมและการจําแนกชนิดพันธุ์ปาล์มน้ำมันด้วยเครื่องหมายโมเลกุล. วารสารวิชาการเกษตร, 35(2), 117 – 136.
10. ฮูดา แก้วศรีสม. (2557). การศึกษาพันธุกรรมของเรียนพื้นบ้าน (Durio zibethinus Murr.) ในภาคใต้โดยใช้เครื่องหมายอาร์พีดี และไมโครแซทแทลไลท์. สงขลา : สาขาพืชศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์.
11. Avise, J. C., Neigel, J. E. & Arnold, J. (1984). Demographic influenceson mitochondrial DNA lineage survivorship inanimal populations. Journal of Molecular Evolution, 20, 99 – 105.
12. Excoffier, L., & Lischer, H. E. (2010) Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Molecular Ecology Resources, 10, 564-567.
13. Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C., & Tamura, K. (2018). MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution, 35, 1547-1549.
14. Rogers, A. R. (1995). Genetic evidence for a Pleistocene population explosion. Evolution, 49, 608 - 615.
15. Ting, N. C., Jansen, J., Mayes, S., Massawe, F., Sambanthamurthi, R., Ooi, L. C. L., Chin, C. W. Arulandoo, X., Seng, T. Y., Alwee, S. S. R. S., Ithnin, M. & Singh, R. (2014). High density SNP and SSR-based genetic maps of two independent oil palm hybrids. BMC Genomics, 15, 309 - 319.
16. Zhou, L. X., Xiao, Y., Xia, W. & Yang, Y. D. (2015). Analysis of genetic diversity and populationstructure of oil palm (Elaeis guineesis) From China and Malaysia based on species-specific simpie sequence reprat markers. Genetics and Molecular Research, 14(4), 16247 - 16254.