Genetic Relationship Analysis of Dwarf <I> Doritis pulcherrima </I>Lindl. by RAPD and ISSR Techniques
Article Sidebar
Main Article Content
Abstract
Doritis pulcherrima Lindl. belongs to Orchidaceae family. Phenotypic variation within species is great making it difficult to identify plant using morphological characteristics. In this study, RAPD and ISSR were used to determine genetic relationship of Dwarf D. pulcherrima Lindl. with similar leaf shape and spot. Twelve of the 80 RAPD and 13 of the 115 ISSR screened primers yielded 98 (87.5%) and 160 (85.1%) polymorphic bands, respectively. The genetic similarity coefficients ranged from 0.44 to 0.96 by RAPD and 0.46 to 0.93 by ISSR. Cluster analysis based on UPGMA clearly resulted in grouping of Dwarf D. pulcherrima Lindl. globose leaf with spot, and the dendrogram generated with ISSR markers clearly separated D. pulcherrima Lindl. from Dwarf D. pulcherrima Lindl. and could group Dwarf D. pulcherrima Lindl. globose leaf with spot. The molecular classification based on RAPD and ISSR technique agree with morphological identification of Dwarf D. pulcherrima Lindl.
Article Details
References
ณรงค์ โฉมเฉลา. 2519. Tetraploidy ในกล้วยไม้ไทย. วิทยาสารสโมสรกล้วยไม้บางเขน 4: 213-218.
ระพี สาคริก. 2554. กล้วยไม้สำหรับผู้เริ่มต้น. วศิระ บจก. กรุงเทพฯ. 222 หน้า.
วีณัน บัณฑิตย์ และ ดำเนิน กาละดี. 2554. การพัฒนาเครื่องหมายดีเอ็นเอที่สัมพันธ์กับสารต้านอนุมูลอิสระในข้าวก่ำ. รายงานประจำปี 2554 งานบริหารงานวิจัย และวิเทศสัมพันธ์ คณะเกษตรศาสตร์. มหาวิทยาลัยเชียงใหม่, เชียงใหม่. 91 หน้า.
ศิริลักษณ์ อินทะวงศ์ วีณัน บัณฑิตย์ และ ณัฐา ควร-ประเสริฐ. 2547. การจำแนกกล้วยไม้ไทยสกุลหวายโดยใช้เทคนิคอาร์เอพีดี. วารสารเกษตร 20(2): 152-158
สุรางค์รัตน์ อินทะมุสิก. 2551. การแปรผันทางพันธุกรรมของกล้วยไม้ม้าวิ่ง (Doritis pulcherrima Lindl. Sensulato) ในเขตพรรณพฤกษชาติภาคใต้ของประเทศไทย. วิทยานิพนธ์ปริญญาโท สาขาวิชาพฤกษศาสตร์. มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์, สงขลา. 105 หน้า.
สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล. 2545. จีโนมและเครื่องหมายดีเอ็นเอ: ปฏิบัติการอาร์เอพีดีและเอเอฟแอลพี. สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ. 115 หน้า.
Haider, N., l. Nabulsi and Y. Kamary. 2012. Phylogeny of Orchidaceae species in northwest Syria based on ISSRs. Journal of Plant Biology Research 1: 36-50.
Hampl, V., A. Pavlicek and J. Flegr. 2001. Construction and bootstrap analysis of DNA fingerprinting-based phylogenetic trees with a freeware program free tree: Application to trichomonad parasites. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51: 731–735.
Kate-ngam, S. and P. Lakote. 2008. A comparative study of different RAPD-PCR protocols for genetic diversity analysis of Doritis germplasm. Agricultural Science Journal 39: 203-206.
Kumar, M., G. P. Mishra, R. Singh, J. Kumar, P. K. Naik and S. B. Singh. 2009. Correspondence of ISSR and RAPD markers for comparative analysis of genetic diversity among different apricot genotypes from cold arid deserts of trans-Himalayas. Physiology and Molecular Biology Plants 15: 225-36.
Lee, I. S., D. S. Kim, S. J. Lee, H. S. Song and Y. I. Lee. 2003. Selection and characterizations of radiation-induced salinity-tolerant lines in rice. Breeding Science 53: 313-318.
Lim, S. H., P. C. P. Teng, Y. H. Lee and C. J. Goh. 1999. RAPD analysis of some species in the genus Vanda. Annals of Botany 83: 193-196.
Medraoui, L., A. Mohammed, B. Ouafae, M. Driss and F. M. Abdelkarim. 2007. Evaluation of genetic variability of sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) in northwestern Morocco by ISSR and RAPD markers. Comptes Rendus Biologies 330: 789-797.
Oliveira, L. D. V. R., R. T. D. Faria, C. D. F. Ruas, P. M. Ruas, M. D. O. Santos and V. P. Carvalho. 2010. Genetic analysis of species in the genus Catasetum (Orchidaceae) using RAPD markers. Brazilian Archives of Biology and Technology 53: 375-387.
Rohlf, F. 2000. NTSYS-pc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, version 2.01e. Exeter Ltd., Setauket, NY, U. S. A.
Taywiya, P., W. Bundithya and N. Potapohn. 2008 . Analysis of genetic relationship of the genus Phalaenopsis by RAPD technique. Acta Horticulture 788: 39-45.
Verma, P., C. Debasis, N. J. Satya, K. M. Devesh, K. S. Pradhyumna, V. S. Samir and T. Rakesh. 2009. The extent of genetic diversity among Vanilla species: comparative results for RAPD and ISSR. Industrial Crops and Products 29: 581-589.
Wang, H. Z., J. J. Lu, X. Hu and J. J. Liu. 2011. Genetic variation and cultivar identification in Cymbidium ensifolium. Plant System 293: 101-110.
Wang, H. Z., Z. X. Wu, J. J. Lu, N. N. Shi, Z. Yan, Y. Zhao, Z. T. Zhang and J. J. Liu. 2009. Molecular diversity and relationship among Cymbidium goeringii cultivars based on inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. Genetica 136: 391-399.
William, J. G. K., A. R. Kubelik, K. J. Livak, J. A. Rafalski and S. V. Tingey. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Research 18: 6,531-6,535.
Wu, W., Y. L. Zheng, L. Chen, Y. M. Wei, R. W. Yang and Z. H. Yan. 2005. Evalution of genetic relationships in the genus Houttuynia Thunb. In China based on RAPD and ISSR markers. Biochemical Systematic and Ecology 33: 1141-1157.
