Detection of Differential Gene Expression in Bracts of Curcuma petiolata Roxb. by DDRT-PCR Technique
Article Sidebar
Main Article Content
Abstract
Curcuma petiolata Roxb. has been assigned into subgenera of Eucurcuma. Morphological characteristics of Curcuma sp. such as flower color, inflorescence length, as well as the proportion of bract color between upper coma bracts and lower bracts are not easily differentiated. In this study, DDRT-PCR was used to determine the differential gene expression in 2 groups of C. petiolata Roxb. with different inflorescence characters. Young leaves, bracts and coma bracts at the pre-blooming, flowering and first floret blooming stage were used for RNA extraction, and later reversed into cDNA. Fifty eight primers were screened for analysis of differential gene expression. It was found that 2 primers, OPD 08 and OPD 20, with oligo dT12VA were able to amplify DNA specific to C. petiolata Roxb. with different color proportions.
Article Details
References
จิรพิพรรธ แพรไพศาล. 2549. การจำแนกยืนที่ต้านทานต่อเชื้อ Escherichia coli สาเหตุของโรคท้องร่วงในสุกรก่อนหย่านม. วิทยานิพนธ์วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาสัตวศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่, เชียงใหม่. 57 หน้า.
นันทวรรณ์ ฉิมพลี. 2549. การจำแนกสายพันธุ์ขมิ้นชันในประเทศไทยโดยใช้ Microsatellite markers. วิทยานิพนธ์วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาพืชไร่นา. มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ. 143 หน้า.
พิชัย มณีโชติ. 2547. ปทุมมาและกระเจียว. ข่าวสารสมาคมพืชสวน. 19(3): 14-15.
ยุทธศักดิ์ เจียมไชยศรี. 2542. โรครากปมของปทุมมาและกระเจียว. กสิกร 72(2): 121- 124.
สุรวิช วรรณไกรโรจน์. 2539. ปทุมมาและกระเจียว (Curcuma), ไม้ดอกไม้ประดับ. อมรินทร์ พริ้นติ้งแอนด์พับลิชชิ่ง จำกัด (มหาชน), กรุงเทพฯ. 128 หน้า.
สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล. 2545. จีโนมและเครื่องหมายดีเอ็นเอ: ปฏิบัติการอาร์เอพี่ดีและเอเอฟแอลพี. สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ. 115 หน้า.
สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล. 2552. เครื่องหมายดีเอ็นเอ: จากพื้นฐานสู่การประยุกต์. สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ. 269 หน้า.
หทัยรัตน์ โชคทวีพานิชย์. 2545. การจัดกลุ่มขมิ้น (วงศ์ขิง) โดยใช้ลักษณะทางสัณฐานวิทยาและรูปแบบไอโซ ไซม์. วิทยานิพนธ์วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต, มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ. 95 หน้า.
อดิศร กระแสชัย. 2541. การรวบรวมพืชพื้นถิ่นเพื่อพัฒนาเป็นไม้ดอกไม้ประดับ. รายงานผลการวิจัย. ภาควิชาพืชสวน คณะเกษตรศาสตร์, มหาวิทยาลัยเชียงใหม่, 44 หน้า.
Dunican, D., A. Parle-McDermott and D.T. Croke. 1997. Gene expression profiling of cells and tissues. Current Diagnostic Pathology 4: 170-175.
Krutmuang, P. 2003. Detection of Genes Differentially Expressed in Porcine Leucocytes due to Transport Stress by cDNA-AFLP and Differential Display. Ph.D. Thesis. Rheinischen Fricdrich-Wilhelms-Universität. 124 p.
Liang, P. and A. B. Pardee. 1992. Differential display of eukaryotic messenger RNA by means of the polymerase chain reaction. Science 257: 967-971.
Maier, R. M., K. Neckermann, B. Hoch, N. B. Akhmerdov and H. Kossel. 1992. Identification of editing positions in the ndhB transcript from maize chloroplasts reveals sequence similarities between editing sites of chloroplasts and plant mitochondria. Nucleic Acids Res. 20: 6189- 6194.
Manoj, P., N. S. Banerjee and P. Ravichandran .. 2008. Development of sex. specific molecular markers in dioecious Piper longum L. plants by differential display. JATIT. 4: 459-465.
Park, J. M., S. S. Whang, S. So, P. O. Lim, H. Y. Lee and J. C. Koo. 2010. Identification of differentially expressed genes in flower buds of Calanthe discolor and C. sieboldii. Plant Biol. 53: 24-31.
Roux, C., J. Bilang, B. H. Theunissen and C. Perrot-Rechenmann. 1998. Identification of new early auxin markers in tobacco by mRNA differential display. Plant Molecular Biology 37: 385-389.
Stein, J. and P. Liang. 2002. Differential display technology: a general guide. Cell Mol. Life Sci. 59: 1235-1240.