ความหลากหลายของรูปแบบยีน ADRB3, FABP3, IGF2 และยีน SCD ในสุกรพันธุ์กระโดน

Main Article Content

ทองสา บัวสุข
เกศรา อำพาภรณ์
รัตติกาล สุวรรณสิงห์

บทคัดย่อ

เนื้อสุกรพื้นเมืองมีรสชาติดีกว่าเนื้อสุกรพันธุ์การค้า จึงได้รับความนิยมและเป็นที่ต้องการของผู้บริโภคในท้องถิ่นต่างๆ แต่สุกรพื้นเมืองมีอัตราการเจริญเติบโตช้าและซากมีไขมันมาก ซึ่งองค์ประกอบไขมันและปริมาณไขมันแทรกในกล้ามเนื้อมีความสัมพันธ์กับคุณภาพเนื้อและเปอร์เซ็นต์ซากในสุกร การศึกษาในครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษารูปแบบจีโนไทป์ของยีน ADRB3, FABP3, IGF2 และยีน SCD ด้วยเทคนิค PCR-RFLP และวิเคราะห์หาค่าความถี่จีโนไทป์ ความถี่อัลลีล และทดสอบ Hardy–Weinberg Equilibrium (HWE) ด้วย Chi-square test (c2-test ) ในสุกรพันธุ์กระโดน ผลการศึกษาพบความหลากหลายของรูปแบบจีโนไทป์ 3 รูปแบบในยีน ADRB3, FABP3 และยีน IGF2 ส่วนยีน SCD พบจีโนไทป์เพียงรูปแบบเดียว (CT) เมื่อวิเคราะห์ค่าความถี่จีโนไทป์ของยีน ADRB3 พบมีค่าความถี่จีโนไทป์ AG เท่ากับ 0.481 สูงกว่าจีโนไทป์ GG และ AA มีค่าเท่ากับ 0.319 และ 0.198 ตามลำดับ สำหรับยีน FABP3 พบค่าความถี่จีโนไทป์ HH, Hh และ hh มีค่าเท่ากับ 0.380, 0.391 และ 0.228 ตามลำดับ ส่วนยีน IGF2 พบความถี่จีโนไทป์ GG และ CG สูงกว่าจีโนไทป์ CC และสุกรพันธุ์กระโดนมีอัลลีล G ของยีน IGF2 เป็นอัลลีลพื้นฐาน เมื่อทดสอบภาวะสมดุล HWE ของยีน พบว่ายีน ADRB3, FABP3 และยีน IGF2 อยู่ในภาวะสมดุลตามกฎ Hardy–Weinberg Equilibrium ดังนั้นจึงมีความเป็นไปได้ที่จะนำรูปแบบจีโนไทป์ของยีน ADRB3, FABP3 และยีน IGF2 ที่พบนี้ไปหาความสัมพันธ์กับลักษณะคุณภาพซากและคุณภาพเนื้อในสุกร เพื่อพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมในการคัดเลือกและปรับปรุงพันธุ์สุกรพันธุ์กระโดนในอนาคตต่อไปได้

Article Details

บท
บทความวิจัย (research article)

References

เกศรา อำพาภรณ์, พิลาสลักษณ์ ปานประเสริฐ, ชเวง สารคล่อง และมนต์ชัย ดวงจินดา. 2561. ผลของยีน IGF-II ต่อลักษณะการเจริญเติบโตและคุณภาพซากในสุกรพันธุ์กระโดน. แก่นเกษตร. 46: 533-542.

จตุพร คูณแก้ว. 2551. การศึกษาลักษณะซากและคุณภาพเนื้อของสุกรพื้นเมืองไทย. วิทยานิพนธ์ตามหลักสูตรปริญญาวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาเทคโนโลยีการผลิตสัตว์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี, นครราชสีมา.

จรัญ จันทลักขณา. 2524. การปรับปรุงพันธุ์หมูเมืองไทยในอนาคต. สุกรสาส์น. 7: 27-45.

จรัญ จันทลักขณา. 2526. ปศุสัตว์สำหรับท้องถิ่น. กรุงเทพมหานคร: สำนักพิมพ์จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย, กรุงเทพฯ.

ธวัชชัย แถวถาทำ และประภาส มหินชัย. 2560. การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ของยีน IGF2 ต่อสมรรถนะการผลิตของสุกร. วารสารวิชาการ สำนักพัฒนาพันธุ์สัตว์, กรมปศุสัตว์ กระทรวงเกษตรและสหกรณ์, กรุงเทพฯ..

แพรว เที่ยงพิมล, ธนาทิพย์ สุวรรณโสภี, ศุภมิตร เมฆฉาย และศกร คุณวุฒิฤทธิรณ. 2552. ความสัมพันธ์ของความแตกต่างทางพันธุกรรมของยีน Insulin-like growth factor II (IGF-II) ต่อลักษณะการเจริญเติบโตและขนาดร่างกายในประชากรสุกรเชิงการค้าแห่งหนึ่ง. แก่นเกษตร. 37: 319-330.

วินัย ประลมพ์กาญจน์ และผกาพรรณ สกุลมั่น. 2543. เอกสารการสอนชุดวิชาการปรับปรุงพันธุ์ และการสืบพันธุ์สัตว์ หน่วยที่ 1-7. มหาวิทยาลัยสุโขทัยธรรมาธิราช, นนทบุรี.

Botstein, D., R. L. White, M. Skolnick, and R. W. Davis. 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics. 32: 314-331.

Chikun, K., A. Horiuchi, H. Ide, M. Shibata, T. Hayashi, I. Nakajima, M. Oe, and S. Muroya. 2008. Nucleotide sequence polymorphisms of beta1, beta2, and beta3-adrenergic receptor genes on Jinhua, Meishan, Duroc and Landrace pigs. Animal Science Journal. 79: 665-672.

Cieslak, J., J. Nowacka-Woszuk, M. Bartz, H. Fijak-Nowak, M. Grzes, M. Szydlowski, and M. Switonski. 2009. Association studies on the porcine RETN, UCP1, UCP3 and ADRB3 genes polymorphism with fatness traits. Meat Science. 83: 551-554.

Dekkers, J. C. M. 2004. Commercial Application of Marker- and Gene-assisted Selection in Livestock: Strategies and Lessons. Journal of Animal Science. 82: 313-328.

Enoch, H.G., A. Catala, and P. Strittmatter. 1976. Mechanism of rat liver microsomal stearyl-CoA desaturase. Studies of the substrate specificity, enzyme-substrate interactions, and the function of lipid. Journal of Biological Chemistry. 251: 5095-5103.

Estany, J., R. Ros-Freixedes, M. Tor, and R. N. Pena. 2014. A functional variant in the stearoyl-CoA desaturase gene promoter enhances fatty acid desaturation in pork. PloS One. 9: e86177.

Falcorner, D. S. and T. F. C. Mackey. 1996. Introduction to Quantitative Genetics. 4th Edition. Pearson Education, New York.

Fortin, A., W. M. Robertson, and A. K. W. Tong. 2005. The eating quality of Canadian pork and its relationship with intramuscular fat. Meat Science. 69: 297-305.

Goodwin, W., A. Linacre, and S. Hadi. 2007. An Introduction to Forensic Genetics. John Wiley & Sons Ltd., Chicheste.

Henriquez-Rodriguez, E., M. Tor, R. N. Pena, and J. Estany. 2015. A polymorphism in the stearoyl-CoA desaturase gene promoter increases monounsaturated fatty acid content in dry-cured ham. Meat Science. 106: 38-43.

Klomtong, P., K. Chaweewan, Y. Phasuk, and M. Duangjinda. 2015. MC1R, KIT, IGF2, and NR6A1 as markers for genetic differentiation in Thai native, wild boars, and Duroc and Chinese Meishan pigs. Genetics and molecular research. 14: 12723-12732.

Knoll, A., L. Putnova, J. Dvorak, and S. Cepica. 2000. A NciI PCR-RFLP within intron 2 of the porcine insulin-like growth factor 2 (IGF2) gene. Animal Genetics. 31: 150-151.

Lee, S. H., Y. M. Choi, J. H. Choe, J. M. Kim, K. C. Hong, H. C. Park, and B. C. Kim. 2010. Association between polymorphisms of the heart fatty acid binding protein gene and intramuscular fat content, fatty acid composition, and meat quality in Berkshire breed. Meat Science. 86: 794-800.

Lim, K. S., J. M., Kim, E. A. Lee, J. H. Choe, and K. C. Hong. 2015. A Candidate Single Nucleotide Polymorphism in the 3’ Untranslated Region of Stearoyl-CoA Desaturase Gene for Fatness Quality and the Gene Expression in Berkshire Pigs. Asian Australasian Journal of Animal Sciences. 28: 151-157.

Liu, G. L., S. W. Jiang, Y. Z. Xiong, R. Zheng, and Y. C. Qu. 2003. Association of PCR-RFLP polymorphisms of IGF2 gene with fat deposition related traits in pig resource family. Acta Genetica Sinica. 30: 1107-1112.

Maharani, D., H. B. Park, J. B. Lee, C. K. Yoo, H. T. Lim, S. H. Han, S. S. Lee, M. S. Ko, I. C. Cho, and J. H. Lee. 2013. Association of the gene encoding stearoyl-CoA desaturase (SCD) with fatty acid composition in an intercross population between Landrace and Korean native pigs. Molecular Biology Reports. 40: 73-80.

Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics. 89: 583-590.

Nowacka-Woszuk, J., I. Szczerbal, H. Fijak-Nowak, and M. Switonski. 2008. Chromosomal localization of 13 candidate genes for human obesity in the pig genome. Journal of Applied Genetics. 49: 373-377.

Ranjbari, M., A. Hashemi, K. Mardani, and R. Darvishzadeh. 2012. Allelic polymorphism of Makoei sheep calpastatin gene identified by polymerase chain reeaction and single strand conformation polymorphism. Journal of Agricultural Science and Technology. 14: 533-538.

Reardon, W., A. M. Mullen, T. Sweeney, and R. M. Hamill. 2010. Association of polymorphisms in candidate genes with colour, water-holding capacity, and composition traits in bovine M. longissimus and M. semimembranosus. Meat Science. 86: 270-275.

Ren, J., C. Knorr, F. Habermann, R. Fries, L. S. Huang, and B. Brenig. 2003. Assignment of the porcine stearoyl-CoA desaturase (SCD) gene to SSC14q27 by fluorescence in situ hybridization and by hybrid panel mapping. Animal Genetics. 34: 471-473.

Samulin, J., I. Berget, S. Lien, and H. Sundvold. 2008. Differential gene expression of fatty acid binding proteins during porcine adipogenesis. Comparative Biochemistry and Physiology Part B Biochemistry and Molecular Biology. 151: 147-152.

Tanaka, K., Y. Iwaki, T. Takizawa, M. Murakami, H. Mannen, Y. Maeda, Y. Kurosawa, V. B. Dand, L. Chhum Phith, B. Bouahom, Y. Yamamoto, T. Daing, and T. Namikawa. 2007. The novel polymorphism of the beta 3-adrenergic receptor gene and its distribution in domestic pigs and wild boars in Asia. Animal Science Journal. 78: 243-250.

Tramontana, S., M. Bionaz, A. Sharma, D. E. Graugnard, E. A. Cutler, and P. Ajmone-Marsan. 2008. Internal controls for quantitative polymerase chain reaction of swine mammary glands during pregnancy and lactation. Journal of Dairy Science. 91: 3057-3066.

Uemoto, Y., H. Nakano, T. Kikuchi, S. Sato, M. Ishida, T. Shibata, H. Kadowaki, E. Kobayashi, and K. Suzuki. 2012. Fine mapping of porcine SSC14 QTL and SCD gene effects on fatty acid composition and melting point of fat in a Duroc purebred population. Animal Genetics. 43: 225-228.

Urban, T., A. Knoll, S. Boleslavova, A. Schmidtova, H. Sulcerova, V. Rozikova, and M. Juzl. 2016. Polymorphism in the gene FABP3 and its association with indicators of meat quality in pigs. Acta fytotechn zootechn. 19: 171-173.

Van Laere, A. S., M. Nguyen, M. Braunschweig, C. Nezer, C. Collette, L. Moreau, A. L. Archibald, C. S. Haley, N. Buys, M. Tally, G. Andersson, M. Georges, and L. Andersson. 2003. A regulatory mutation in IGF2 causes a major QTL effect on muscle growth in the pig. Nature. 425: 832-836.

Vasupen, K. 2007. Nutritional studies in native, Thai Kadon pigs. Ph.D. Thesis. Department of Nutrition Faculty of Veterinary Medicine, Utrecht University. Utrecht, The Netherlands.

Vykoukalova, Z., A. Knoll, J. Dvorak, and S. Cepica. 2006. New SNPs in the IGF2 gene and association between this gene and back fat thickness and lean meat content in Large White pigs. Journal of Animal Breeding and Genetics. 123: 204-207.

Wang, W., W. Xue, X. Zhou, L. Zhang, J. Wu, L. Qu, B. Jin, X. Zhang, F. Ma, and X. Xu. 2013. Effects of candidate genes' polymorphisms on meat quality traits in pigs. Acta Agriculturae Scandinavica, Section A – Animal Science. 62: 120-126.

Xue, W., W. Wang, B. Jin, X. Zhang, and X. Xu. 2015. Association of the ADRB3, FABP3, LIPE, and LPL gene polymorphisms with pig intramuscular fat content and fatty acid composition. Czech Journal of Animal Science. 60: 60-66.

Zhang, S., T. J. Knight, K. J. Stalder, R. N. Goodwin, S. M. Lonergan, and D. C. Beitz. 2009. Effects of breed, sex and halothane genotype on fatty acid composition of triacylglycerols and phospholipids in pork longissimus muscle. Journal of Animal Breeding and Genetics. 126: 259-268.