Comparison of pummelo identity cv. “Thong Dee” and “Khaonamphueng” with different sources of cultivars using AFLP marker
Main Article Content
Abstract
The objectives of this study were to evaluate identity of pummelo cv. “Thong Dee” and “Khaonamphueng” that were original cultivar of Nakhon Pathom province and to compare morphological characters and genetic information with shoot cutting plant reintroduced from other area including Prachin Buri, Chai Nat, Samut Songkram province. Genetic information was analyzed by using 10 AFLP markers. The analysis showed 48 polymorphic bands from a total of 229 band score. The percentages of polymorphic markers ranged from 41.18 % for ACT/CAC to 12.50 % for AAG/CAA and AAC/CAC. Cluster analysis and dendrogram were constructed to show genetic relationship. The similarity index (SI) ranged from 0.80 to 1.00. The 54 pummelo samples were clustered into 2 groups including “Thong Dee” and “Khaonamphueng” cultivars at SI = 0.80. The different sources of “Thong Dee” and “Khaonamphueng” shoot cutting were the same genetic information, resulting they were identical clone (SI = 0.99-1.00).
Article Details
References
กรมทรัพย์สินทางปัญญา. 2547. ส้มโอนครชัยศรี. แหล่งข้อมูล: http://www.ipthailand.go.th/images/781/pamelo-nakonchaisri_1.pdf. ค้นเมื่อ 9 กรกฎาคม 2561.
กัลปพฤกษ์ ลีละวัฒน์. 2534. การศึกษาลักษณะทางกายภาพและเคมีของผลส้มโอ 7 พันธุ์. ปัญหาพิเศษปริญญาโท ภาควิชาพืชสวน มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ.
ธรรมนูญ เปรมสุนทร. 2500. การสำรวจส้มโอบางพันธ์ของประเทศไทย. วิทยานิพนธ์ปริญญาโทกสิกรรมและสัตวบาล. มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ.
ปัญญา ธยามานนท์. 2541. เอกสารวิชาการที่ 21 เรื่องส้มโอ. โรงพิมพ์ชุมชนสหกรณ์การเกษตรแห่งประเทศไทย, กรุงเทพฯ.
เยาวรัตน์ วงศ์ศรีสกุลแก้ว. 2545. การเจริญเติบโตพัฒนาของผลส้มโอขาวน้ำผึ้งและลักษณะสำคัญของผลพันธุ์อื่นๆ. วิทยานิพนธ์วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, นครปฐม.
ลพ ภวภูตานนท์, กฤษณา กฤษณพุกต์, และยงยุทธ โอสถสภา. 2555. ความสัมพันธ์ระหว่างสมบัติดินในแหล่งปลูกกับปริมาณและคุณภาพผลผลิตส้มโอ. รายงานฉบับฉบับสมบูรณ์ชุดโครงการส้มโอเพื่อการส่งออก สนับสนุนโดยสำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย (สกว.), กรุงเทพฯ.
วิจิตร วังใน. 2526. ชนิดและพันธุ์ไม้ผลเมืองไทย. ห้างหุ้นส่วนจำกัดมิตรเกษตรตลาดและโฆษณา, กรุงเทพฯ.
วิชัย บุณญะวัฒน์. 2501. การศึกษาลักษณะผลส้มโอที่สำคัญ 11 พันธุ์. วิทยานิพนธ์ปริญญาโทกสิกรรมและสัตวบาล มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ.
เสาวณี คงศรี และอุณารุจ บุญประกอบ. 2551. การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของส้มโอในประเทศไทยด้วยเครื่องหมาย Simple Sequence Repeat (SSR). วิทยานิพนธ์ปริญญาวิทยาศาสตร มหาบัณฑิต มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, นครปฐม.
สำนักข่าวกรมประชาสัมพันธ์. 2557. จังหวัดนครปฐมให้โอกาสส้มโอจังหวัดอื่นมาจำหน่าย. แหล่งข้อมูล: http:// www.thainews.prd.go.th. ค้นเมื่อ 20 มิถุนายน 2558.
สำนักข่าวประชาสัมพันธ์นครปฐม. 2554. สวนส้มโอนครปฐมยืนต้นตายหลังถูกน้ำท่วมเสียหายนับ 200 ล้านบาท. แหล่งข้อมูล: http://pr.prd.go.th/nakhonpathom. ค้นเมื่อ 20 มิถุนายน 2558.
อัญมณี อาวุชานนท์ และปณาลี ภู่วรกุลชัย. 2559. การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของฟักทองไทย 29 สายพันธุ์ ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอ AFLP. แก่นเกษตร. 44: 237-246.
Agrawal, G.K., R.N. Pandey, and V.P. Agrawal. 1992. Isolation of DNA from Cheorospondias asillaris leaves. Biotech. Biodiv. Lett. 2: 19-24.
Ahmad, R., D. Struss, and S. M. Southwick. 2003. Development and characterization of microsatellite markers in Citrus. J. Amer. Soc. Hort. Sci. 128: 584-590.
Bo W., Z. Guang-yan, Y. Jian-qiang, Y. Run-ting, L. Chong Li, L. Yue-jia, Z. Yun, W. Xuan, J. Bo, Z. Ji, Z. Li, Y. Shu-tang, B. Xue-jun, and Z. Dongguo. 2014. Identification of pummelo cultivars by using a panel of 25 selected SNPs and 12 DNA segments. PLOS ONE. 9: e94506.
Compos, E.T., M.A.G. Espinosa, M.L. Warburton, A.S. Varela, and A.V. Monter. 2005. Characterization of mandarin (Citrus spp.) using morphological and AFLP markers. Interciencia 30: 687-693.
Corazza-Nunes, M. J., M. A. Machado, W. M. C. Nunes, M. Cristofani, and M. L. P. N. Targon. 2002. Assessment of genetic variability in grapefruits (Citrus paradisi Macf.) and pummelos (C. maxima (Burm.) Merr.) using RAPD and SSR markers. Euphytica. 126: 169-176.
Deng, Z.N., A. Gentile, E. Nicolosi, F. Domina, A. Vardi, and E. Tribulato. 1995. Identification of in vivo and in vitro lemon mutants by RAPD marker. J. Hort. Sci. 70: 117-125.
Fang, D. Q., and M. L. Roose. 1997. Identification of closely related citrus cultivars with inter-simple sequence repeat markers. Theor. Appl. Genet. 95: 408-417.
Kijas, J. M. H., M. R. Thomas, J. C. S. Fowler, and M. L. Roose. 1997. Integration of trinucleotide microsatellites into a linkage map of Citrus. Theor. Appl. Genet. 94: 701-706.
Liang, M., X. Yang, H. Li, S. Su, H. Yi, L. Chai, and X. Deng. 2015. De novo transcriptome assembly of pummelo and molecular marker development. PLOS ONE. 10: e0120615.
Nartvaranant, P., and K. Nartvaranant. 2011. Analysis based on AFLP markers of the genetic variations and their relationships for pummelo cultivars grown in the central region of Thailand. Songklanakarin J. Sci. Technol. 33(5): 499-508.
National Bureau of Agricultural Commodity and Food Standards. 2007. Agricultural Standard TAS 13 – 207: Pummelo. Ministry of Agriculture and Cooperatives. The Royal Gazette Vol. 124: Section 78D. Rohlf, F.I. 1997. NTSYSpc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Version 2.00. Exeter Software; Setauket, N.Y.
Soost, R.K. 1964. Self-incompatibility in Citrus grandis (L.) Osbeck. Amer. Soc. Hort. Sci. Proc. 84: 137-140.
Yong, L., S. Zhong-hai, L. De-chun, W. Bo, and T. Jian-jun. 2005. Assessment of the geneticdiversity of pummelo germplasms using AFLP and SSR markers. China Agric. Sci. 38: 2308-2315.
Vos, P., R. Hogers, M. Bleeker, M. Reijans, T.V. Lee, M. Hormes, A. Frijters, T. Plot , J. Peleman, M. Kuiper, and M. Zebeau. 1995. AFLP: A new technique for DNA fingerprinting. Nucl. Acids Res. 23: 4407-4414.