Application of ISSR Molecular Markers for Assessment of Genetic Diversity In Nine Tobacco (Nicotiana tabacum L.) Cultivars
Article Sidebar
Main Article Content
Abstract
The objective of this study was to investigate the genetic diversity of nine tobacco cultivars. We select five ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) primers capable of detecting genetic polymorphism using PCR technique and identifying genetic diversity by IBM SPSS program. The five primers selected were used to amplify the genomic DNA of nine individuals and generated a total 26 DNA bands, of which 59.34% were polymorphic. The similarity index ranged from 0.45 to 0.97. Nine cultivars tobacco were use cluster analysis by NTSY-pc 2.1 program (UPGMA). The result from cluster analysis showed clearly two groups tobacco (commercial and local cultivars), which accordance to their geographical locations. These results will help in the formulation of appropriate strategies for variety improvement in tobacco, and ISSR marker of the genetic diversity will contribute to further study and improvement of tobacco.
Article Details
References
เศรษฐา ศิริพินทุ์ และภาวิน อิทธิรส. 2556. ความหลากหลายทางพันธุกรรมของพันธุ์ยาสูบโดยเทคนิคโมเลกุลเครื่องหมายเอสเอสอาร์. ว. วิทย์. กษ. 44(พิเศษ): 357-360.
เศรษฐา ศิริพินทุ์ ภาวิน อิทธิรส และศูนย์ความเป็นเลิศทางด้านเทคโนโลยีชีวภาพเกษตร สำนักพัฒนาบัณฑิตและวิจัยวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี สำนักงานคณะกรรมการอุดมศึกษา. 2556. ความหลากหลายทางพันธุกรรมของพันธุ์ยาสูบเบอร์เลย์พันธุ์พื้นเมืองและพันธุ์ป่า โดยเทคนิคเครื่องหมายโมเลกุลเอสเอสอาร์. ใน: รายงานการประชุมวิชาการประจำปี 2556. ณ ศูนย์การศึกษาและฝึกอบรมนานาชาติ มหาวิทยาลัยแม่โจ้ จ.เชียงใหม่.
สุทวัฒน์ สินธีรโรจน์. 2557. การพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุลสำหรับการจำแนกมะละกอพันธุ์ขอนแก่น 80. มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลธัญบุรี, ปทุมธานี.
Costa, F.R., N. S. P Telma, P. C. G. Ana, and G. P., Messias. 2011. NOTE ISSR markers for genetic relationships in Caricaceae and sex differentiation in papaya. Crop Breed. Appl. Biotechnol. 11: 352-357.
Denduangboripant, J., S. Setaphan, W. Suwanprasart, and S. Panha. 2010. Determination of Local Tobacco Cultivars Using ISSR Molecular Marker. Chiang Mai J. Sci. 37: 293-303.
Godwin, I. D., E. S. Mace, and Nurzuhairawaty. 2001. Genotyping Pacific Island Taro (Colocasia esculenta L.) Schott) Germplasm, P.109-128. In: R. J. Henry. Plant Genotyping the DNA Fingerprinting of Plants. The University of Queensland, Brisbane, QLD 4072, Australia.
Gomes, S., P.M. Lopes, J. Lopes, and H. Guedes-Pinto.2009. Assessing genetic diversity in Olea europaea L. using ISSR and SSR. Plant Mol. Biol. Rep. 27: 365-373.
Lai, J.A., W. C. Yang, and J. Y. Hsiao. 2001. An assessment of genetic relationships in cultivated tea clones andnative wild tea in Taiwan using RAPD and ISSR markers. Bot. Bull. Acad. Sin. 42: 93-100
Lynch, M. 1991. Analysis of population genetic structure by DNA fingerprinting, DNA Fingerprinting: Approaches and Application, Birkhauser Verlag, Basel, Switzerland.
Oliveira, E.J., A. Santos, F. M. Silva, L. F. Carvalho, J. L. Santos, V. B. Costa, A. Oliveira, and J. L. L. Dantas. 2010. Polymorphic microsatellite marker set for Carica papaya L. and its use in molecular- assisted selection. Euphytica 173: 279-287.
Rohlf, F.J. 1998. NTSYS-pc: Numerical Taxonomy and Multivariat Analysis System, Version 3.2. 1st Edn., Exeter Software, New York.
Tsumura, Y., K. Ohba, and S. H. Strauss. 1996. Diversity and inheritance of inter simple sequence repeat polymorphisms in Douglasfir (Pseudotsuga menziesii) and sugi (Cryptomeria japonica). Theor. Appl. Genet. 92: 40-45.
Wang, X. 2011. Inter-simple sequence repeats (ISSR) molecular fingerprinting markers for authenticating the genuine species of rhubarb. J. Medicinal Plants Res. 5: 758-764.
