Detection of Differential Gene Expression in Tepal of Some Spathoglottis Species by DDRT-PCR Technique

Main Article Content

Jatuporn Anuchai
Nuttha Potapohn
Weenun Bundithya

Abstract

Spathoglottis is one of the orchid species which is popular for its color prominence in Thailand and abroad. However, knowledge and information of genetics controlling color phenotypes in orchid is still limited. Therefore, gene expression in tepals was carried out in 3 species of Spathoglottis which were S. affinis, S. plicata and S. petrei. Differential display reverse transcription-polymerase chain reaction (DDRT-PCR) technique was used to study gene expression in tepals at 3 different stages. The flower development period was divided as follows: flower bud, half opened flower and full bloom flower. Fifty-eight primers were screened and only 3 primers, OPD16, OPF14 and OPAB19, were able to amplify DNA marker associated with flower characteristics. These DDRT-PCR markers may have potentials for identification of genetic variation associated with flower characteristics of Spathoglottis.

Article Details

Section
Research Articles

References

จิรพิพรรธ แพรไพศาลกุล. 2549. การจำแนกยีนที่ต้านทานต่อเชื้อ Escherichia coli สาเหตุของโรคท้องร่วงในสุกรก่อนหย่านม. วิทยานิพนธ์วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาสัตวศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่, เชียงใหม่. 57 หน้า.

ระพี สาคริก. 2516. การเพาะปลูกกล้วยไม้ในสภาพแวดล้อมของประเทศไทย. โรงพิมพ์ชวนพิมพ์, กรุงเทพฯ. 840 หน้า.

สิริณี ยอดเมือง. 2547. การศึกษาพันธุกรรมสีดอกกล้วยไม้ดินโดยใช้เทคนิคทางชีววิทยาระดับโมเลกุล.วิทยานิพนธ์วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาพืชสวน มหาวิทยาลัยขอนแก่น, ขอนแก่น. 147 หน้า.

สุรินทร์ ปิยะโชคุณากุล. 2545. จีโนมและเครื่องหมายดีเอ็นเอ ปฏิบัติการอาร์เอพีดีและเอเอฟแอลพี. สำนักพิมพ์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ. 116 หน้า.

สำนักงานเศรษฐกิจการเกษตร. 2551. ปริมาณและมูลค่าสินค้าเกษตรกรรมส่งออก พ.ศ. 2549-2550 (ระบบออนไลน์). แหล่งที่มา: http: //www.oae.go.th/oae/index2.php (21 Bunny 2553).

อบฉันท์ ไทยทอง. 2543. กล้วยไม้เมืองไทย. สำนักพิมพ์บ้านและสวน, กรุงเทพฯ. 461 หน้า.

Chen, Y., B. Wang, S. Weining and G. Daggard. 2004. Anchor primer associated problems in differential display reverse transcription polymerase chain reaction. Annal Biochem. 329: 145-147.

Liang, P. and A. Pardee. 1992. Differential display of eukaryotic messenger RNA by means of the polymerase chain reaction. Science 257: 967-971.

Maier, R. M., K. Neckermann, B. Hoch, N.B. Akhmerdov and H. Kossel. 1992. Identification of editing positions in the ndhB transcript from maize chloroplasts reveals sequence similarities between editing sites of chloroplasts and plant mitochondria. Nucleic Acids Res. 20: 6189- 6194.

Manoj, P., N. S. Banerjee and P. Ravichandran. 2008. Development of sex specific molecular marker in dioecious Piper longum L. plants by differential display. JATIT. 4: 459-465.

Park, M.J., S. Soo, P.O. Lim, H. Lee and J.C. Koo. 2009. Identification of differentially expressed genes in flower buds of Calanthe discolor and C. sieboldii. Plant Biol. 53: 24-31.

Yu, H. and C.J. Goh. 2000. Differential gene expression during floral transition in an orchid hybrid Dendrobium Madame Thong-in. Plant Cell Rep. 19: 926-931.