Genetic Diversity of Cinnamomum porrectum (Roxb.) Kosterm. in Southern Thailand Detected by Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) Analysis
Article Sidebar
Main Article Content
Abstract
Genetic diversity of Cinnamomum porrectum (Roxb.) Kosterm. (‘Thep tharo’) in southern Thailand was assessed by analyzing molecular genetic markers at the population level. Inter simple sequence repeat (ISSR) markers were used to analyze the genetic diversity of six populations in Phangnga, Phuket, Phatthalung, Satun, Krabi, and Songkhla provinces. In total, 73 amplified bands were obtained from 117 individuals of all sampled populations using seven primers. At the species level, the percentage of polymorphic loci (P), the mean expected heterozygosity (He), and the Shannon’s information index of diversity (I) were high (87.67%, 0.2883, and 0.4343, respectively). However, P, He, and I were relatively low at the population level with averages of 47.03%, 0.1689, and 0.2508, respectively. Among the six populations investigated, the Songkhla and Phangnga populations revealed the highest genetic diversity, followed by Satun, Phatthalung, Phuket and Krabi populations, respectively. Based on Nei’s genetic differentiation (Gst) value, 35.51% of genetic differentiation existed among populations. The gene flow (Nm) was 0.9081. UPGMA cluster analysis divided the populations into two main groups. One consisted of the populations of Satun, Songkhla, Phangnga, and Phatthalung, while the other was composed of the Phuket and Krabi populations. Based on the results of the present study and field survey, it could be suggested that in situ gene conservation is very important for this species, especially in the Songkhla and Phangnga populations due to their higher genetic diversity and larger population sizes. At the same time, ex situ gene conservation should be established as an option to conserve the genetic material of the Satun, Phatthalung, Phuket, and Krabi populations that showed low genetic diversity and small population sizes.
Keywords: Cinnamomum porrectum, ‘Thep tharo’, genetic diversity, ISSR, conservation
Article Details
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
ข้าพเจ้าและผู้เขียนร่วม (ถ้ามี) ขอรับรองว่า ต้นฉบับที่เสนอมานี้ยังไม่เคยได้รับการตีพิมพ์และไม่ได้อยู่ในระหว่างกระบวนการพิจารณาตีพิมพ์ลงในวารสารหรือสิ่งตีพิมพ์อื่นใด ข้าพเจ้าและผู้เขียนร่วม (ถ้ามี) ยอมรับหลักเกณฑ์และเงื่อนไขการพิจารณาต้นฉบับ ทั้งยินยอมให้กองบรรณาธิการมีสิทธิ์พิจารณาและตรวจแก้ต้นฉบับได้ตามที่เห็นสมควร พร้อมนี้ขอมอบลิขสิทธิ์ผลงานที่ได้รับการตีพิมพ์ให้แก่วารสารวนศาสตร์ คณะวนศาสตร์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ กรณีมีการฟ้องร้องเรื่องการละเมิดลิขสิทธิ์เกี่ยวกับภาพ กราฟ ข้อความส่วนใดส่วนหนึ่ง หรือ ข้อคิดเห็นที่ปรากฏในผลงาน ให้เป็นความรับผิดชอบของข้าพเจ้าและผู้เขียนร่วม (ถ้ามี) แต่เพียงฝ่ายเดียว และหากข้าพเจ้าและผู้เขียนร่วม (ถ้ามี) ประสงค์ถอนบทความในระหว่างกระบวนการพิจารณาของทางวารสาร ข้าพเจ้าและผู้เขียนร่วม (ถ้ามี) ยินดีรับผิดชอบค่าใช้จ่ายทั้งหมดที่เกิดขึ้นในกระบวนการพิจารณาบทความนั้น”